Help Conquer Cancer, исследование структуры белков в раковых клетках Налаштування

[Rilian]

Читайте статьи о проекте на нашем сайте:
* Официальная статистика
* FAQ по проекту help conquer cancer
* Help Conquer Cancer
* Help Conquer Cancer - результаты проекта, январь 2008
* Help Conquer Cancer - результаты проекта, май 2008 (в переводе) :onpc:
* Help Conquer Cancer - результаты проекта, октябрь 2008 (в переводе) :onpc:
* Сайт Института Рака в Онтарио

Как присоединиться читайте в главном топике World Community Grid

WCG запускает новый проект "Помоги Победить Рак", занимающийся улучшением результатов исследований белков методом рентгеновской кристаллографии. Это поможет не только записать части протеономы человека, но и улучшает понимание возникновения, развития и методы борьбы с раком. Проект спонсирует Институт Рака в Онтарио, Канада. Перейти на официальную страницу



Если Вы желаете помочь ученым в понимании такой сложной, многогранной и беспощадной болезни как Рак — присоединяйтесь к проекту распределенных вычислений "Help Conquer Cancer" (Помоги Победить Рак) основанный учеными из "Ontario Cancer Institute (OCI)" (Институт Рака в Онтарио), "Princess Margaret Hospital" (Госпиталь Принцессы Маргарет» и "University Health Network" (Университетская Сеть Здоровья).
Смысл помощи в том, чтобы предоставить ученым неиспользованное процессорное время вашего ПК для анализа фотографий белков сделанных методом "X-ray Crystallography" (Рентген кристаллография) с целью определения структуры этих белков и в дальнейшем понимания их роли в инициировании, течении и лечении Рака.

Миссия
Миссия проекта ПОМОГИ ПОБЕДИТЬ РАК состоит в том, чтобы улучшить результаты рентгеновской кристаллографии, которая помогает исследователям не только описать неизвестные структуры протеономы человека, но и большим образом понять как образуется рак, как он развивается, и как на него можно повлиять.

Важность проекта
Для того чтобы существенным образом повлиять на понимание рака и на его лечение, нужно не только открыть новые терапевтические подходы нацеленные на исследование метастаз (процесс распространения рака на другие органы тела), но и найти некие маркеры или структурные метки, с помощью которых можно было бы провести раннюю диагностику

Во время изучения многих форм рака, исследователи смогли сделать некоторые открытия даже имея ограниченное представление об участвующих в образовании рака белках. Однако, чтобы глубже понять и найти более эффективные способы лечения, необходимо исследовать все вовлеченные в процесс белки, их структуру и функции, чем и занимается данный проект. В основном это белки, характерные для раковых клеток, а также белки которые в них подавляются. Также исследуются белки которые были модифицированы и изменили свою структуру под воздействием рака.

С помощью рентгеновской кристаллографии исследователи смогут получить более точные данные о структуре этих белков. Это должно привести к более глубокому пониманию функций ракообразующих белков, и позволит найти потенциальные лекарства от смертельной болезни.

С начала проекта обрабатывалось 85 млн изображений.
По данным на 30 июня 2010, в данной фазе проекта обрабатывается более 115 млн изображений, каждое из них - на 2 разных компьютерах. Итого в проекте - 230 млн заданий.
По уточненным данным на 20 октября 2010, в данной фазе проекта обрабатывается более 105 млн изображений, каждое из них - на 2 разных компьютерах. Итого в проекте - 210 млн заданий.

Более 560 (на 1 января 2011) человек из украинской команды распределенных вычислений отдают свободные мощности своих компьютеров на эти исследования.

(Show/Hide)

Help Conquer Cancer project announcement:

World Community Grid takes great pleasure in announcing its newest research project: Help Conquer Cancer, sponsored by the Ontario Cancer Institute in Canada. The mission of Help Conquer Cancer is to improve the results of protein X-ray crystallography, which helps researchers not only annotate parts of the human proteome, but importantly improves their understanding of cancer initiation, progression, and treatment. For more information about this research project, click here. For additional announcement information about this project, please click here.

Help Conquer Cancer runs only on the BOINC client. For more information about BOINC see the last article in this newsletter.

Other Research Projects:

The Help Conquer Cancer project is the fifth research project that is currently active on World Community Grid. The other four projects include: Human Proteome Folding - Phase II, FightAIDS@Home, Discovering Dengue Drugs - Together, and AfricanClimate@Home. We hope that you are participating in one or more of these projects. For more information about all five projects, please click here.

Time to Go BOINC!

In the October 2007 newsletter, World Community Grid announced that it was migrating entirely to BOINC (Berkeley Open Infrastructure for Network Computing), a software platform for volunteer computing and desktop grid computing. The move is being made to provide a better experience for all our members.

This is a reminder to all users of the United Devices client that you must migrate to the BOINC client before it sunsets in 2008 by visiting the website and downloading and installing the BOINC client. The BOINC installer will detect if a computer is running the UD client and if it is found, will help you uninstall it. Details on downloading and installing the BOINC agent for Windows may be found here.

To determine whether you are currently on the BOINC or UD client, double click on the World Community Grid icon in your system tray. If you are running the BOINC client, you will see "BOINC Client" at the top of the information panel. If you are running the United Devices client it will say United Devices in the lower right hand corner.

More details about the migration are available in the member news forum.

Are you active?

As we start this new project, the World Community Grid team wants to make sure that everyone who has signed up is actively contributing. To check out if you are actively contributing, sign in on the website and go to My Grid. In the middle of that page you will see a field for "Last Results Returned". If the last time you returned a result was more than 30 days ago, you are probably not active. The easiest way to become active again is to check that the software is installed and running properly.

To see if the software is installed, check for the World Community Grid logo in your system tray. Here is an example of what the logo looks like in the system tray:

Double-clicking on the logo will bring up the client. If the client does not appear to be running correctly (i.e., the numbers for Task Run Time or Elapsed Time are not increasing, examples below), please use the Contact Us feature on the bottom of most pages of the World Community Grid website, and a World Community Grid team member will help you to figure out how to become active again.

If the World Community Grid logo is not in your system tray, you will need to install the software. For instructions, click here. If you have any questions about this, please ask in the forums or send an email via Contact Us.

------------------------------

Для большей скорости (прирост 40%) используйте 64-битную ОС!

график проекта


видео о проекте


Це повідомлення відредагував Rilian: Jan 6 2011, 09:26

[nikelong]

tiss,
Проведи с ними воспитательную беседу и ЛикБез. А также завлекай в наши ряды.

[tiss]

tiss,
Проведи с ними воспитательную беседу и ЛикБез. А также завлекай в наши ряды.

А смысл? На его компе мой боинк крутится.

[Rilian]

Проект преодолел рубеж 1000000 тасков в день

[TyphooNick]

Rilian, 1000000 тасков в день - это хорошо.

Подскажи, пожалуйста, как сделать такую подпись со статистикой, как у тебя (с земным шаром слева).

[tiss]

Подскажи, пожалуйста, как сделать такую подпись со статистикой, как у тебя (с земным шаром слева).

Смотреть здесь под спойлером "Таблички в подпись на форуме"

[LSA]

Чтобы сделать себе такую табличку, ее надо попросить на официальном форуме в ветке "I made a new forum signature." ЛИБО написать Rilianу в ЛС. Для генерации таблички требуется ваш Account Number (это 6-значное число, берется в настройках вашего аккаунта тут ) а также ваш никнейм в проекте WCG

После этого поместите такой код (вам будет выдан УРЛ) к себе в подпись

[Rilian]

CODE

Date            Total Run Time            Points Generated    Results Returned

10/28/2012         44:161:13:07:24         236,331,295         1,042,590
10/27/2012         43:136:20:53:45         230,732,484         1,016,379
10/26/2012         45:218:14:21:55         236,960,801         1,043,344
10/25/2012         46:291:10:29:00         232,996,284         1,029,804
10/24/2012         46:326:05:45:24         235,249,486         1,036,354
10/23/2012         46:018:05:58:06         211,814,938         935,878
10/22/2012         45:174:08:32:02         208,777,092         917,614
10/21/2012         42:283:13:15:47         202,752,368         890,855
10/20/2012         41:299:09:00:52         195,116,501         854,329
10/19/2012         43:004:23:14:17         192,199,104         848,325
10/18/2012         38:350:20:50:09         178,831,730         793,209
10/17/2012         36:157:16:13:13         168,101,072         749,830
10/16/2012         35:017:12:12:19         161,274,205         713,407

[netphil]

вроде разобрался всем спасибо. буду вытягивать команду.

8 заданий для ГПУ счиатет за 2 мин....это нормально ??? загрузка ГПУ = 97%. (АТИ 7970 1000мгц СВО)

[TyphooNick]

netphil,
Вообще отлично. У меня также загрузка ГПУ 94- 97% (AMD 7950 1160мгц). Кранчу пять заданий одновременно от 69 до 140 сек. на отдельное задание. На время расчета в равной степени влияют как разгон граф. процессора, так и центр. процессора.

[Rilian]

Жена знаменитого рок-музыканта Оззи Осборна Шерон перенесла двойную мастэктомию, чтобы избежать риска заболеть раком груди.
Шерон Осборн (Sharon Osbourne) решилась на этот шаг после того, как узнала, что у нее есть ген рака груди - он повышает вероятность заболевания.

60-летняя телеведущая уже победила онкологическое заболевание - в 2002 году ей диагностировали рак толстой кишки, отмечает, Reuters. Хотя прогноз выздоровления у нее был ниже 40%, Осборн сумела выиграть у болезни битву за жизнь.

Когда медики диагностировали у Шерон предраковое состояние груди, она согласилась на двойную мастэктомию, не задумываясь. Данная операция представляет собой удаление обеих молочных желез. Известно, что операция длилась 13 часов.

"После того, как врачи сообщили мне о высокой вероятности заболевания раком молочной железы, я решила, что счет будет не в мою пользу. Однажды я уже перенесла рак, и мысль о том, что ужас болезни и тяжелого лечения могут повториться, была невыносима", - призналась Шерон.

При этом женщина добавила, что она хочет счастливо жить и смотреть на то, как растет ее маленькая внучка, не переживая о возвращении болезни.

"Я не хочу всю оставшуюся жизнь жить в страхе и совсем не жалею о своей груди".

Стоит отметить, что от онкологических заболеваний умерло много знаменитостей: Патрик Суэйзи, Ингрид Бергман, Чед Эверетт, вокалист Bee Gees Робин Гибб и многие другие. При этом есть и такие звезды, которые успешно побороли этот страшный недуг: Шерил Кроу, Майкл Дуглас и Кайли Миноуг.

Напомним, в сентябре в США от рака умер легендарный американский певец и актер Энди Уильямс (Andy Williams).

[Sonechko]

Може такі статті в окремий топік? ато справді щось поширена зараза стала, хоч і відома вже тисячу років...

+ до списку Джобса, реально тру чел.

[MAGADAN]

А вот вопрос на засыпку. знающим на отлично ангийский и часто читающим иностранные информационные ресурсы.
Во как загнул

Это действительно конец (93 дня ) проекта HCC или все таки подкинуть опять в последний момент пару миллиончиков заний ?

[Rilian]

MAGADAN, по информации на ДАННЫЙ момент больше заданий нет.

[Rilian]

Updated Science Application for Help Conquer Cancer v7.05

We have updated the science application for Help Conquer Cancer. This application change will allow work units to process multiple images. The purpose of this change is to increase the average runtime of the work units and decrease the server scheduler requests.

This will be a two part change.

1. The application will be released and process single image work units.
2. In about 3 days we will start sending multiple image work units.

The application version being loaded is 7.05.

Thanks,
-Uplinger

тестируют размещение нескольких картинок в одном рабочем задании, для того чтобы уменьшить нагрузку на сервер. Задания будут дольше обрабатываться, и соответственно меньше спрашивать сервер

поэтому не переживайте если время выполнения резко увеличится. Вообще они хотят все оптимизировать и настроить время выполнения в среднем на 6 часов

[Rilian]

Новый апдейт проекта! Качаем и читаем PDF

в документе написан текущий прогресс, над чем работают ученые, а также про то как помогает GPU платформа

Hello World Community Grid members,

We are happy to announce the November 2012 update to the Help Conquer Cancer project. The launch of the GPU platform has kept us busy, and we are adjusting to the amazing increase in project throughput. Meanwhile, analysis of the results of your crunching continues. This update briefly describes the performance of a new classifier we have developed. More improvement is expected in the near future.

We are grateful to all of you for your contributions of CPU and GPU cycles, making this research possible.

Christian A. Cumbaa
Research Associate, Ontario Cancer Institute