Help Fight Childhood Cancer, проект по подбору лекарств от нейробластомы (рак) Налаштування

[Rilian]

Помоги в борьбе с детским раком / Help Fight Childhood Cancer

Как присоединиться читайте в главном топике World Community Grid

• Help Fight Childhood Cancer - статья у нас на сайте
• Статистика по команде "Ukraine"
• Топ-50 участников команды
• Общая статистика проекта
• обзор проекта на английском
• Официальный сайт Университета Чиба (новости на сайте)
• Видео, составленное командой NMG-NETWORK

World Community Grid рада объявить о запуске проекта Help Fight Childhood Cancer под руководством Института по Исследованию Рака в Чибо (Япония), а также Университета Чиба (префектура Чиба, Япония). Миссия проекта - найти лекарства которые смогут заблокировать три вида белков обычно связываемых с развитием Нейробластомы (вид рака) - одного из видов плотных опухолей которые чаще всего развиваются у детей. Нахождение лекарств, блокирующих эти белки, позволит более эффективно лечить этот вид опухоли с помощью химиотерапии. Нейробластома проявляется чаще всего в раннем детстве и обычно ведет к смерти. Если проект будет удачным, он может привести к прорыву в исследованиях этой болезни, которая до сих пор не поддавалась ученым, и это позволит намного увеличить шансы на лечение нейробластомы.

В новой фазе проекта, запущеной в Августе 2010, исследуется 3 дополнительных цели
После этого ввиду успешност экспериментов добавлено еще 3 цели. Итого на апрель 2012 года рассчитано 8 целей, и еще 1 на очереди

Help Fight Childhood Cancer это двенадцатый проект в рамках World Community Grid и один из 7 (на момент запуска) которые сейчас активны. Для более детальной информации по остальным проектам, заходите на форум World Community Grid.

Часто задаваемые вопросы по проекту:

Что такое нейробластома?
Нейробластома - один из видов злокачественных опухолей и встречается обычно у младенцев и детей и очень редко у детей старше 10 лет. Клетки этой опухоли напоминают нервные клетки на ранних этапах их развития у плода. Одна треть нейробластом развивается в надпочечниках, другая треть - в брюшной полости по ходу нервных стволов вдоль позвоночника и остальные - в грудной полости и на шее. Некоторые нейробластомы возникают из спинного мозга. Иногда в связи с широким распространением опухоли на момент диагностики трудно установить точно место, откуда возникла опухоль. Не все опухоли нервной системы относятся к злокачественным. Нейробластома составляет 6-10% из всех детских раковых заболеваний и 15% от всех летальных исходов вызванных раком.

Что вызывает нейробластому?
Вероятность возникновения нейробластомы по всему миру почти одинаковая. Это дает возможность предположить, что факторы окружающей среды, например, ее загрязнение, не являются причиной развития этой опухоли. Многие исследователи полагают, что нейробластома возникает в том случае, когда нормальные эмбриональные нейробласты не созревают в нервные клетки или клетки коры надпочечников. Вместо этого, они продолжают расти и делиться. Большинство нейробластом не являются следствием наследуемых мутаций ДНК. Они вызваны мутациями, приобретенными в ранний период жизни ребенка. Эти мутации присутствуют в опухолевых клетках родителя ребенка и не передаются детям. Причины, вызывающие изменения ДНК, приводящие к возникновению нейробластом, не известны.

Какие потенциальные преимущества проекта Help Fight Childhood Cancer?
Институт по Исследованию Рака в Чибо, а также Университет Чиба (Япония) используют компьютерные ресурсы WCG для определения новых лекарственных кандидатов которые имеют нужную форму и химические характеристики для блокирования трех протеинов: TrkB, ALK и SCxx, которые часто встречаются, или ненормально мутируют, в агрессивно развивающихся нейробластомах. Блокирование этих протеинов, как считают ученые, позволит значительно повысить шансы на излечение с помощью химиотерапии.

Что именно считают рассчетные ядра проекта Help Fight Childhood Cancer?
Исследователи приготовили базу из 3 миллионов соединений - или потенциальных кандидатов для лекарства - и используют мощности добровольцев в WCG для симуляции лабораторных экспериментов, чтобы протестировать какие из этих соединений блокируют протеины TrkB, ALK и SCxx. Лучшие из моелкул будут выбраны и протестированы в лаборатории для подавления нейробластомы.

Какие преимущества получает проект от использования World Community Grid?
На своих мощностях исследователям для этого проекта понадобилось бы 8000 лет компьютерных рассчетов. С помощью мощностей участников WCG рассчеты могут быть проведены примерно за 2 года!

Что изображено на скринсейвере?
Программа симулирует лабораторное исследование, и проверяет, может ли данный лекарственный кандидат потенциально блокировать протеин, связанный с образованием рака. Форма в центре круга детей представляет собой белковую молекулу, которая является целью эксперимента в данном рабочем юните - белок TrkB, ALK, или SCxx. Когда рассчитывается возможная позиция (докинг двух молекул) лекарственного кандидата и одного из 3 белков, это место обозначается цветным шариком.

Скриншот графического клиента

Откуда взялись рисунки на сайте Help Fight Childhood Cancer project и в графическом клиенте?
Они были пожертвованы Ассоциацией Детского Рака Японии (Children's Cancer Association of Japan) - это единственная благотворительная организация в Японии которая поддерживает детей больных раком и их семьи. Организация была основана в 1968 году родителями которые потеряли своих детей, больных раком. Рисунки нарисованы детьми:

* "Лев"

* "Розовые семена"

* "Упражнения по радио"


График производительности проекта:


Це повідомлення відредагував Rilian: Apr 16 2012, 21:20

[Rilian]

Target-9 work units ready for HFCC

The Chiba research team has provided the first set of 70 batch inputs for target-9 and these work units are currently being built and indexed into BOINC. The remaining work units for target-9 are expected to be made available in 1-2 weeks. As a result, we aren't anticipating any period of time where work units for HFCC will be depleted until the end of the project (target-9 is currently the last planned target for HFCC).

Seippel

Начали присылать задания из последней - 9й цели проекта. Напоминаю, в каждой цели есть 287 пачек, итого 6.5 млн заданий

ориентировочно проект завершится через 200 дней!

планов продолжить эту фазу проекта рассчетами новых целей пока нет

[Rilian]

Пишут что рассчеты цели №9 закончатся через 90 дней!

http://www.worldcommunitygrid.org/forums/w...ge,yes#lastpost

[MAGADAN]

Пишут что рассчеты цели №9 закончатся через 90 дней!

http://www.worldcommunitygrid.org/forums/w...ge,yes#lastpost

Да они там много чего пишут
Вон уже сами в шоке 82 дня осталось
Глядиш завтра закончим с такими темпами

[Rilian]

проект HFCC ориентировочно закочнится через 70 дней

у кого нет сапфировой медальки - поспешите

[MAGADAN]

Тут хоть бы то изумруда успеть добраться

[Dromage]

Тут хоть бы до золота успеть добраться

[MAGADAN]

Ну и как это понимать ??????
Кто там у них за калькулятором сидит
Разве это реально ??????
УЖЕ 60 дней осталось
Темпы просто бешеные что весь мир считает HFCC

[Rilian]

MAGADAN, просто админы подняли приоритет, а также на других проектах (2 последних) приоритет понижен

[Sonechko]

Да шо там добиратись, 2 тижні діла (до синенького баджика)) Ех хочеться у Бурпі потащити команду поки комп топовий, і форма, ато скоро у багатьох вже буде 16 Гб опери...)

[MAGADAN]

Да шо там добиратись, 2 тижні діла (до синенького баджика)) Ех хочеться у Бурпі потащити команду поки комп топовий, і форма, ато скоро у багатьох вже буде 16 Гб опери...)

ХА ,Sonechko , ты видел мои показатели по производительности
Мне до сапфир более 4 месяцев непрерывного счета нада

[MAGADAN]

Раз такая петрушка пошла, то есть предложение.
На форуме как то вл время проведения челенджа "ПЕДАЛИЛИ" ( не хочу никого обидеть просто слово запомнилось ) помоему Tis-a

Вопрос: Кто готов помочь мне набрать сапфир
Ответ: готов помочь откликнувшимуся и считать для него тот проект который он скажет до той отметки которую укажет.
Вот в общем то и всё предложение.

Просто медельку хочеться

[re_SET]

Раз такая петрушка пошла, то есть предложение.
На форуме как то вл время проведения челенджа "ПЕДАЛИЛИ" ( не хочу никого обидеть просто слово запомнилось ) помоему Tis-a

Вопрос: Кто готов помочь мне набрать сапфир
Ответ: готов помочь откликнувшимуся и считать для него тот проект который он скажет до той отметки которую укажет.
Вот в общем то и всё предложение.

Просто медельку хочеться

Давай ключ. Сколько Тебе ядер нужно?

[MAGADAN]

А какой ключь если не подскажите .
Ядер не знаю если честно Ну что бы хватло насобирать сапфир

[serymba]

А какой ключь если не подскажите .
Ядер не знаю если честно Ну что бы хватло насобирать сапфир

зайди в настройки профиля в WCG,напротив Weak Account Key ,там многа цифир и букв, это и есть слабый ключ
ну и тему про Педали почитай,для общего понимания https://distributed.org.ua/forum/index.php?showtopic=5508

[MAGADAN]

А какой ключь если не подскажите .
Ядер не знаю если честно Ну что бы хватло насобирать сапфир

зайди в настройки профиля в WCG,напротив Weak Account Key ,там многа цифир и букв, это и есть слабый ключ
ну и тему про Педали почитай,для общего понимания https://distributed.org.ua/forum/index.php?showtopic=5508

Спасибо то что доктор прописал
Weak Account Key: 792904_cc0092da4feefd31e38e9f5befcfa107
Ядер ну пускай будет 10