 Help Fight Childhood Cancer, проект по подбору лекарств от нейробластомы (рак) |
Привіт Гість ( Вхід | Реєстрація )
Розподілені обчислення в Україні > Великі проекти розподілених обчислень > World Community Grid > Завершені проекти WCG
| Rilian |
  Mar 8 2009, 00:08
Пост
#1
|
 interstellar  Група: Team member Повідомлень: 16 930 З нами з: 22-February 06 З: Торонто Користувач №: 184 Стать: НеСкажу Free-DC_CPID Парк машин: ноут и кусок сервера  |
  Помоги в борьбе с детским раком / Help Fight Childhood Cancer Как присоединиться читайте в главном топике World Community Grid 
В новой фазе проекта, запущеной в Августе 2010, исследуется 3 дополнительных цели После этого ввиду успешност экспериментов добавлено еще 3 цели. Итого на апрель 2012 года рассчитано 8 целей, и еще 1 на очереди Help Fight Childhood Cancer это двенадцатый проект в рамках World Community Grid и один из 7 (на момент запуска) которые сейчас активны. Для более детальной информации по остальным проектам, заходите на форум World Community Grid. Часто задаваемые вопросы по проекту: Что такое нейробластома? Нейробластома - один из видов злокачественных опухолей и встречается обычно у младенцев и детей и очень редко у детей старше 10 лет. Клетки этой опухоли напоминают нервные клетки на ранних этапах их развития у плода. Одна треть нейробластом развивается в надпочечниках, другая треть - в брюшной полости по ходу нервных стволов вдоль позвоночника и остальные - в грудной полости и на шее. Некоторые нейробластомы возникают из спинного мозга. Иногда в связи с широким распространением опухоли на момент диагностики трудно установить точно место, откуда возникла опухоль. Не все опухоли нервной системы относятся к злокачественным. Нейробластома составляет 6-10% из всех детских раковых заболеваний и 15% от всех летальных исходов вызванных раком. Что вызывает нейробластому? Вероятность возникновения нейробластомы по всему миру почти одинаковая. Это дает возможность предположить, что факторы окружающей среды, например, ее загрязнение, не являются причиной развития этой опухоли. Многие исследователи полагают, что нейробластома возникает в том случае, когда нормальные эмбриональные нейробласты не созревают в нервные клетки или клетки коры надпочечников. Вместо этого, они продолжают расти и делиться. Большинство нейробластом не являются следствием наследуемых мутаций ДНК. Они вызваны мутациями, приобретенными в ранний период жизни ребенка. Эти мутации присутствуют в опухолевых клетках родителя ребенка и не передаются детям. Причины, вызывающие изменения ДНК, приводящие к возникновению нейробластом, не известны. Какие потенциальные преимущества проекта Help Fight Childhood Cancer? Институт по Исследованию Рака в Чибо, а также Университет Чиба (Япония) используют компьютерные ресурсы WCG для определения новых лекарственных кандидатов которые имеют нужную форму и химические характеристики для блокирования трех протеинов: TrkB, ALK и SCxx, которые часто встречаются, или ненормально мутируют, в агрессивно развивающихся нейробластомах. Блокирование этих протеинов, как считают ученые, позволит значительно повысить шансы на излечение с помощью химиотерапии. Что именно считают рассчетные ядра проекта Help Fight Childhood Cancer? Исследователи приготовили базу из 3 миллионов соединений - или потенциальных кандидатов для лекарства - и используют мощности добровольцев в WCG для симуляции лабораторных экспериментов, чтобы протестировать какие из этих соединений блокируют протеины TrkB, ALK и SCxx. Лучшие из моелкул будут выбраны и протестированы в лаборатории для подавления нейробластомы. Какие преимущества получает проект от использования World Community Grid? На своих мощностях исследователям для этого проекта понадобилось бы 8000 лет компьютерных рассчетов. С помощью мощностей участников WCG рассчеты могут быть проведены примерно за 2 года! Что изображено на скринсейвере? Программа симулирует лабораторное исследование, и проверяет, может ли данный лекарственный кандидат потенциально блокировать протеин, связанный с образованием рака. Форма в центре круга детей представляет собой белковую молекулу, которая является целью эксперимента в данном рабочем юните - белок TrkB, ALK, или SCxx. Когда рассчитывается возможная позиция (докинг двух молекул) лекарственного кандидата и одного из 3 белков, это место обозначается цветным шариком.  Скриншот графического клиента Откуда взялись рисунки на сайте Help Fight Childhood Cancer project и в графическом клиенте? Они были пожертвованы Ассоциацией Детского Рака Японии (Children's Cancer Association of Japan) - это единственная благотворительная организация в Японии которая поддерживает детей больных раком и их семьи. Организация была основана в 1968 году родителями которые потеряли своих детей, больных раком. Рисунки нарисованы детьми: * "Лев"  * "Розовые семена"  * "Упражнения по радио"  График производительности проекта:  Це повідомлення відредагував Rilian: Apr 16 2012, 21:20 |
   |
 
|
|
  |
Відповідей(60 - 74)
| cosmo_vk |
May 24 2009, 10:55
Пост
#61
|
 kранчер Група: Trusted Members Повідомлень: 86 З нами з: 19-September 08 З: Ковров Користувач №: 828 Стать: НеСкажу Парк машин: всего по немногу |
ну вообщем если округлить то примерно около 100 наверное.
 С учетом того как считается HCC(примерно сопоставимого по объемам) года 1,5 - 2 минимум. А это уже плохо.  --------------------  |
 |
|
| Rilian |
May 24 2009, 11:18
Пост
#62
|
|
interstellar Група: Team member Повідомлень: 16 930 З нами з: 22-February 06 З: Торонто Користувач №: 184 Стать: НеСкажу Free-DC_CPID Парк машин: ноут и кусок сервера |
QUOTE(cosmo_vk @ May 24 2009, 11:55)  ну вообщем если округлить то примерно около 100 наверное. С учетом того как считается HCC(примерно сопоставимого по объемам) года 1,5 - 2 минимум. А это уже плохо. в HCC 82 миллиона ВЮ (164 миллиона заданий), каждое считается в среднем по 6 часов, за 1.5 года посчитано 25% -------------------- |
|
|
|
| cosmo_vk |
May 24 2009, 11:47
Пост
#63
|
|
kранчер Група: Trusted Members Повідомлень: 86 З нами з: 19-September 08 З: Ковров Користувач №: 828 Стать: НеСкажу Парк машин: всего по немногу |
ну это в среднем так. В зависимости от процессора и его частоты время может быть очень разным: от 3,5 часов(например, на моих Q6600@3156 и Xeon5365) до 10 часов(на Xeon Nocona@3200).
HFCC на домашнем и на сервере у меня считается около 4 часов максимум. -------------------- |
|
|
|
| Rilian |
Sep 9 2009, 23:56
Пост
#64
|
|
interstellar Група: Team member Повідомлень: 16 930 З нами з: 22-February 06 З: Торонто Користувач №: 184 Стать: НеСкажу Free-DC_CPID Парк машин: ноут и кусок сервера |
Вчера был маленький бета-тест новых заданий типа s1
что за задания не знаю, но по ходы мы подошли к очередному stubspace   QUOTE Greetings, We are going to start another BETA test on HFCC to make sure that the type "s1" work units will run properly in production. These new work units are created a little bit differently on the backend in comparison to what is used for the type "t1" work units that are in production at the moment. This BETA test is mainly to make sure that the new method as well as the results are valid. Thank you for your participation in this BETA. Please post any issues you notice in the forums so we can investigate. Thanks, -Uplinger World Community Grid. -------------------- |
|
|
|
| mzhelo |
Oct 23 2009, 19:32
Пост
#65
|
 кранчер зі стажем Група: Trusted Members Повідомлень: 284 З нами з: 15-April 09 З: Днепропетровск Користувач №: 997 Стать: Чол Free-DC_CPID Парк машин: Intel(R) Celeron(R) CPU 2.66GHz; Intel(R) Core2 Duo 6320 CPU 1.86GH; Intel(R) Core(TM) i7 CPU 930 @ 2.80GHz + GTX275; Intel(R) Core(TM) i5 CPU U 520 @ 1.07GHz |
Прочитал сегодня статью в газете, в частности затронута тема детской нейробластомы - можно воспользоваться для продвижения РВ в массы. Кто-нибудь, возьмитесь написать правильные комментарий к статье, давайте воспользуемся.
Вот ссылка: http://kp.ua/daily/231009/199253/ Статья в КП-Украина, "Донор способен не только подарить надежду, но и продлить жизнь". P.S. Не нашел ветку о продвижении РВ, поэтому написал здесь. --------------------  (Show/Hide) |
|
|
|
| Rilian |
Dec 10 2009, 13:36
Пост
#66
|
|
interstellar Група: Team member Повідомлень: 16 930 З нами з: 22-February 06 З: Торонто Користувач №: 184 Стать: НеСкажу Free-DC_CPID Парк машин: ноут и кусок сервера |
Благотворительная организация Cancer Research UK, Великобритания, испытывает новую методику лечения нейробластомы. Этот недуг (рак тканей развивающейся нервной системы) поражает в основном детей младше пяти лет. Шестая часть детских смертей по онкологическим причинам приходится на эту болезнь, сообщает BBC News. Тестирование продлится более четырех лет, в нем примут участие 160 британских детей.
Нейробластома развивается в нервном валике – цепочке нервных клеток, расположенных параллельно спинному мозгу. Эти клетки участвуют в развитии нервной системы ребенка и других тканей. Опухоли часто развиваются в одной из надпочечных желез, но иногда формируются и нервных тканях в шее, грудной клетке, брюшной полости и тазу. Шестерых из десяти детей вылечивают от нейробластомы с помощью хирургического вмешательства и химиотерапии, но как правило прогнозы для детей с прогрессирующей формой рака неутешительны. Новая методика лечения предусматривает умерщвление клеток нейробластомы, уцелевших после традиционного лечения. Антитела прикрепляются к особым молекулам на поверхности клеток нейробластомы, мобилизуют иммунную систему организма, которая затем атакует и убивает клетки. Первые результаты испытания новой методики в США показали, что у детей, перенесших иммунотерапию, меньше шансов на то, что болезнь вернется в течение следующих двух лет. -------------------- |
|
|
|
| Rilian |
Mar 7 2010, 02:28
Пост
#67
|
|
interstellar Група: Team member Повідомлень: 16 930 З нами з: 22-February 06 З: Торонто Користувач №: 184 Стать: НеСкажу Free-DC_CPID Парк машин: ноут и кусок сервера |
новости!
Мы закончили анализ первой "цели" T1 и отобрали 60 лекарственных кандидатов Мы детально рассмотрим их на возможность использования как лекарственных компонентов, и выберем 10 из них для экспериментов на клетках нейробластомы  QUOTE We have finished the analysis for the first target as T1 and selected 60 drug candidates. We will make a detail consideration as drug like compounds on them and choose 10 candidates for next experiment using neuroblastoma cells. http://www.m.chiba-u.ac.jp/class/bioinfor/...fcc_e/news.html  -------------------- |
|
|
|
| Death |
Mar 7 2010, 18:50
Пост
#68
|
 <script ///> Група: Moderators Повідомлень: 6 371 З нами з: 5-November 03 З: Kyiv Користувач №: 26 Стать: НеСкажу Free-DC_CPID Парк машин: гидропарк jabber:deadjdona@gmail.com |
Круто.
Как бы составить пресс-релиз на 1000 знаков? -------------------- |
|
|
|
wbr, Me. 
Dead J
| Rilian |
 Mar 11 2010, 18:31
Пост
#69
|
|
interstellar Група: Team member Повідомлень: 16 930 З нами з: 22-February 06 З: Торонто Користувач №: 184 Стать: НеСкажу Free-DC_CPID Парк машин: ноут и кусок сервера |
Отмечаем годовщину проекта мега-гонкой за максимальное количество посчитанных ВЮ
Чтобы принять участие, с 17 по 23 марта 2010 нужно выбрать в My Projects проект "Help Fight Childhood Cancer", а также галочку "If there is no work available for my computer for the projects I have selected above, please send me work from another project." (то есть "присылать ВЮ с других подпроектов если в HFCC внезапно(!) закончатся задания")    пс: из сильных команд в гонке - BOINX@MIXI, __in2my.net__, и за неделю подтянутся другие -------------------- |
|
|
|
| SlavaAltus |
Mar 11 2010, 18:52
Пост
#70
|
 кранчер зі стажем Група: Trusted Members Повідомлень: 389 З нами з: 9-February 10 З: Украина, Киев Користувач №: 1 302 Стать: Чол Free-DC_CPID Парк машин: 8-10 cores 24/7 (up to 30-40 cores some times) |
QUOTE(Rilian @ Mar 11 2010, 18:31) Отмечаем годовщину проекта мега-гонкой за максимальное количество посчитанных ВЮ пс: из сильных команд в гонке - BOINX@MIXI, __in2my.net__, и за неделю подтянутся другие А что это ты забыл упомянуть ещё одну - Ukraine ? Keep on Cranching!  -------------------- (Show/Hide)   Водку на работе пить не дают!, дома не дают драть обои... чё за фигня ваще((.. ?! |
|
|
|
| Rilian |
Mar 12 2010, 20:15
Пост
#71
|
|
interstellar Група: Team member Повідомлень: 16 930 З нами з: 22-February 06 З: Торонто Користувач №: 184 Стать: НеСкажу Free-DC_CPID Парк машин: ноут и кусок сервера |
QUOTE(Rilian @ Mar 11 2010, 18:31) уже присоединилось около 50 команд, из них новые сильные это UK, France, BRASIL - BRAZIL@GRID, Vulture Central III гонка начнется через 4 дня -------------------- |
|
|
|
| SlavaAltus |
Mar 13 2010, 09:42
Пост
#72
|
|
кранчер зі стажем Група: Trusted Members Повідомлень: 389 З нами з: 9-February 10 З: Украина, Киев Користувач №: 1 302 Стать: Чол Free-DC_CPID Парк машин: 8-10 cores 24/7 (up to 30-40 cores some times) |
А график наметился плотный:
15 Марта - 24 часа Забег - Ides of March в прайме 17-23 Марта - этот забег... Надо бы поразбираться с Кешами в Боинке чтобы везде максимально оперативно включаться... П.С. Или перед самым забегом просто резетить проект и всё <думаю...> -------------------- (Show/Hide) Водку на работе пить не дают!, дома не дают драть обои... чё за фигня ваще((.. ?! |
|
|
|
| Rilian |
Mar 14 2010, 01:15
Пост
#74
|
|
interstellar Група: Team member Повідомлень: 16 930 З нами з: 22-February 06 З: Торонто Користувач №: 184 Стать: НеСкажу Free-DC_CPID Парк машин: ноут и кусок сервера |
думаю, это далеко не полный список
интересно, сколько посетителей сайта donor.org.ua и аналогичных знают о био-медицинских проектах РВ ? -------------------- |
|
|
|
| LaLechuzaBlanca |
Mar 14 2010, 01:18
Пост
#75
|
 Соромлюсь щось писати Група: New Members Повідомлень: 4 З нами з: 4-March 10 З: Донецк Користувач №: 1 338 Стать: Жін |
(Rilian @ Mar 14 2010, 01:15) думаю, это далеко не полный список конечно, не полный это лишь те люди, которые обратились за финансовой помощью к волонтерам и, следовательно, о которых есть информация в инете --------------------  |
|
|
|
|
|
|
1 Користувачів переглядають дану тему (1 Гостей і 0 Прихованих Користувачів)
0 Користувачів:
|
Lo-Fi Версія | Поточний час: 29th April 2024 - 18:18 |