Help Conquer Cancer, исследование структуры белков в раковых клетках Налаштування

[Rilian]

Читайте статьи о проекте на нашем сайте:
* Официальная статистика
* FAQ по проекту help conquer cancer
* Help Conquer Cancer
* Help Conquer Cancer - результаты проекта, январь 2008
* Help Conquer Cancer - результаты проекта, май 2008 (в переводе) :onpc:
* Help Conquer Cancer - результаты проекта, октябрь 2008 (в переводе) :onpc:
* Сайт Института Рака в Онтарио

Как присоединиться читайте в главном топике World Community Grid

WCG запускает новый проект "Помоги Победить Рак", занимающийся улучшением результатов исследований белков методом рентгеновской кристаллографии. Это поможет не только записать части протеономы человека, но и улучшает понимание возникновения, развития и методы борьбы с раком. Проект спонсирует Институт Рака в Онтарио, Канада. Перейти на официальную страницу



Если Вы желаете помочь ученым в понимании такой сложной, многогранной и беспощадной болезни как Рак — присоединяйтесь к проекту распределенных вычислений "Help Conquer Cancer" (Помоги Победить Рак) основанный учеными из "Ontario Cancer Institute (OCI)" (Институт Рака в Онтарио), "Princess Margaret Hospital" (Госпиталь Принцессы Маргарет» и "University Health Network" (Университетская Сеть Здоровья).
Смысл помощи в том, чтобы предоставить ученым неиспользованное процессорное время вашего ПК для анализа фотографий белков сделанных методом "X-ray Crystallography" (Рентген кристаллография) с целью определения структуры этих белков и в дальнейшем понимания их роли в инициировании, течении и лечении Рака.

Миссия
Миссия проекта ПОМОГИ ПОБЕДИТЬ РАК состоит в том, чтобы улучшить результаты рентгеновской кристаллографии, которая помогает исследователям не только описать неизвестные структуры протеономы человека, но и большим образом понять как образуется рак, как он развивается, и как на него можно повлиять.

Важность проекта
Для того чтобы существенным образом повлиять на понимание рака и на его лечение, нужно не только открыть новые терапевтические подходы нацеленные на исследование метастаз (процесс распространения рака на другие органы тела), но и найти некие маркеры или структурные метки, с помощью которых можно было бы провести раннюю диагностику

Во время изучения многих форм рака, исследователи смогли сделать некоторые открытия даже имея ограниченное представление об участвующих в образовании рака белках. Однако, чтобы глубже понять и найти более эффективные способы лечения, необходимо исследовать все вовлеченные в процесс белки, их структуру и функции, чем и занимается данный проект. В основном это белки, характерные для раковых клеток, а также белки которые в них подавляются. Также исследуются белки которые были модифицированы и изменили свою структуру под воздействием рака.

С помощью рентгеновской кристаллографии исследователи смогут получить более точные данные о структуре этих белков. Это должно привести к более глубокому пониманию функций ракообразующих белков, и позволит найти потенциальные лекарства от смертельной болезни.

С начала проекта обрабатывалось 85 млн изображений.
По данным на 30 июня 2010, в данной фазе проекта обрабатывается более 115 млн изображений, каждое из них - на 2 разных компьютерах. Итого в проекте - 230 млн заданий.
По уточненным данным на 20 октября 2010, в данной фазе проекта обрабатывается более 105 млн изображений, каждое из них - на 2 разных компьютерах. Итого в проекте - 210 млн заданий.

Более 560 (на 1 января 2011) человек из украинской команды распределенных вычислений отдают свободные мощности своих компьютеров на эти исследования.

(Show/Hide)

Help Conquer Cancer project announcement:

World Community Grid takes great pleasure in announcing its newest research project: Help Conquer Cancer, sponsored by the Ontario Cancer Institute in Canada. The mission of Help Conquer Cancer is to improve the results of protein X-ray crystallography, which helps researchers not only annotate parts of the human proteome, but importantly improves their understanding of cancer initiation, progression, and treatment. For more information about this research project, click here. For additional announcement information about this project, please click here.

Help Conquer Cancer runs only on the BOINC client. For more information about BOINC see the last article in this newsletter.

Other Research Projects:

The Help Conquer Cancer project is the fifth research project that is currently active on World Community Grid. The other four projects include: Human Proteome Folding - Phase II, FightAIDS@Home, Discovering Dengue Drugs - Together, and AfricanClimate@Home. We hope that you are participating in one or more of these projects. For more information about all five projects, please click here.

Time to Go BOINC!

In the October 2007 newsletter, World Community Grid announced that it was migrating entirely to BOINC (Berkeley Open Infrastructure for Network Computing), a software platform for volunteer computing and desktop grid computing. The move is being made to provide a better experience for all our members.

This is a reminder to all users of the United Devices client that you must migrate to the BOINC client before it sunsets in 2008 by visiting the website and downloading and installing the BOINC client. The BOINC installer will detect if a computer is running the UD client and if it is found, will help you uninstall it. Details on downloading and installing the BOINC agent for Windows may be found here.

To determine whether you are currently on the BOINC or UD client, double click on the World Community Grid icon in your system tray. If you are running the BOINC client, you will see "BOINC Client" at the top of the information panel. If you are running the United Devices client it will say United Devices in the lower right hand corner.

More details about the migration are available in the member news forum.

Are you active?

As we start this new project, the World Community Grid team wants to make sure that everyone who has signed up is actively contributing. To check out if you are actively contributing, sign in on the website and go to My Grid. In the middle of that page you will see a field for "Last Results Returned". If the last time you returned a result was more than 30 days ago, you are probably not active. The easiest way to become active again is to check that the software is installed and running properly.

To see if the software is installed, check for the World Community Grid logo in your system tray. Here is an example of what the logo looks like in the system tray:

Double-clicking on the logo will bring up the client. If the client does not appear to be running correctly (i.e., the numbers for Task Run Time or Elapsed Time are not increasing, examples below), please use the Contact Us feature on the bottom of most pages of the World Community Grid website, and a World Community Grid team member will help you to figure out how to become active again.

If the World Community Grid logo is not in your system tray, you will need to install the software. For instructions, click here. If you have any questions about this, please ask in the forums or send an email via Contact Us.

------------------------------

Для большей скорости (прирост 40%) используйте 64-битную ОС!

график проекта


видео о проекте


Це повідомлення відредагував Rilian: Jan 6 2011, 09:26

[Rilian]

в Help Conquer Cancer задания снова выдаются !!

[Rilian]

Посчитано 12.28% проекта, то есть 20,634,369 ВЮ. Всего в проекте 84000000 ВЮ (Каждая будет обработана 2 раза), и осталось досчитать 147000000 штук

при средней скорости в 62700 ВЮ/день проект закончится через 2344 дня то есть через 6.4 года!

Присоединяйтесь!

[lividum]

Что-то не могу к проекту присоединиться

[Rilian]

Что-то не могу к проекту присоединиться

какие проблемы, что пишет?

www в адресе есть?

[lividum]

Что-то не могу к проекту присоединиться

какие проблемы, что пишет?

www в адресе есть?

да ниче не пишет...."посмотрите на страницу сообщений...там в строке написано Фетчинг кофигурейшн файл и адрес"...все....www из адреса убрал, то же самое

[Rilian]

www надо оставить

какой клиент боинка, официальный или WCGшный?

другие проекты работают?

антивирус есть?

фаервол?

винда не заблочила БОИНК ?

проект уже приаттачен?

Фетчинг кофигурейшн файл это значит что оно пытается скачать файл настроек

[lividum]

www надо оставить

какой клиент боинка, официальный или WCGшный?

другие проекты работают?

антивирус есть?

фаервол?

винда не заблочила БОИНК ?

проект уже приаттачен?

какой клиент понятия не имею, версия 6.2.19. Космолоджи работает без проблем. Касперский, в данный момент отключен. Файерволл виндовый. О последнем пункте не знаю что сказать, понятия не имею.

[Rilian]

При добавлении проекта юзер, емейл и пароль были нормально приняты?

Зайди плиз в настройки фаервола и на влякий случай проверь не добавлен ли клиент в блеклист

Скопируй сюда все со вкладки messages. Разберемся

Проверь в браузере открывается http://www.worldcommunitygrid.org/get_project_config.php ?

[lividum]

При добавлении проекта юзер, емейл и пароль были нормально приняты?

Зайди плиз в настройки фаервола и на влякий случай проверь не добавлен ли клиент в блеклист

Скопируй сюда все со вкладки messages. Разберемся

Проверь в браузере открывается http://www.worldcommunitygrid.org/get_project_config.php ?

Да, все приняло нормально...кстати орбит хоум тоже не принимает. В файерволе поставил в исключения. Сылка эта не работает, пишет что не найдена на этом сервере.

(Show/Hide)

23.10.2008 10:14:32||Starting BOINC client version 6.2.19 for windows_intelx86
23.10.2008 10:14:32||log flags: task, file_xfer, sched_ops
23.10.2008 10:14:32||Libraries: libcurl/7.18.0 OpenSSL/0.9.8e zlib/1.2.3
23.10.2008 10:14:32||Running as a daemon
23.10.2008 10:14:32||Data directory: F:\TSC\BOINC
23.10.2008 10:14:32||Running under account boinc_master
23.10.2008 10:14:33||Processor: 4 GenuineIntel Intel® Core™2 Quad CPU Q6600 @ 2.40GHz [x86 Family 6 Model 15 Stepping 11]
23.10.2008 10:14:33||Processor features: fpu tsc pae nx sse sse2 pni mmx
23.10.2008 10:14:33||OS: Microsoft Windows Vista: Ultimate x86 Editon, Service Pack 1, (06.00.6001.00)
23.10.2008 10:14:33||Memory: 2.00 GB physical, 4.23 GB virtual
23.10.2008 10:14:33||Disk: 315.74 GB total, 93.75 GB free
23.10.2008 10:14:33||Local time is UTC +3 hours
23.10.2008 10:14:35||No general preferences found - using BOINC defaults
23.10.2008 10:14:35||Preferences limit memory usage when active to 1022.88MB
23.10.2008 10:14:35||Preferences limit memory usage when idle to 1841.19MB
23.10.2008 10:14:35||Preferences limit disk usage to 9.31GB
23.10.2008 10:14:35||This computer is not attached to any projects
23.10.2008 10:14:35||Visit http://boinc.berkeley.edu for instructions
23.10.2008 20:02:23||Fetching configuration file from http://lhcathome.cern.ch/lhcathome/get_project_config.php
23.10.2008 20:05:15||Fetching configuration file from http://lhcathome.cern.ch/lhcathome/get_project_config.php
23.10.2008 20:06:26||Running CPU benchmarks
23.10.2008 20:06:26||Suspending computation - running CPU benchmarks
23.10.2008 20:06:35|lhcathome|Master file download succeeded
23.10.2008 20:06:40|lhcathome|Sending scheduler request: Project initialization. Requesting 1 seconds of work, reporting 0 completed tasks
23.10.2008 20:06:45|lhcathome|Scheduler request succeeded: got 0 new tasks
23.10.2008 20:06:57||Benchmark results:
23.10.2008 20:06:57|| Number of CPUs: 4
23.10.2008 20:06:57|| 3054 floating point MIPS (Whetstone) per CPU
23.10.2008 20:06:57|| 6175 integer MIPS (Dhrystone) per CPU
23.10.2008 20:06:58||Resuming computation
23.10.2008 20:19:40||Fetching configuration file from http://lhcathome.cern.ch/lhcathome/get_project_config.php
23.10.2008 20:20:52||No general preferences found - using BOINC defaults
23.10.2008 20:20:52||Reading preferences override file
23.10.2008 20:20:52||Preferences limit memory usage when active to 1022.88MB
23.10.2008 20:20:52||Preferences limit memory usage when idle to 1841.19MB
23.10.2008 20:20:52||Preferences limit disk usage to 9.31GB
23.10.2008 20:20:52||Number of usable CPUs has changed from 4 to 2. Running benchmarks.
23.10.2008 20:20:53||Running CPU benchmarks
23.10.2008 20:20:53||Suspending computation - running CPU benchmarks
23.10.2008 20:21:04||No general preferences found - using BOINC defaults
23.10.2008 20:21:04||Reading preferences override file
23.10.2008 20:21:04||Preferences limit memory usage when active to 1022.88MB
23.10.2008 20:21:04||Preferences limit memory usage when idle to 1841.19MB
23.10.2008 20:21:04||Preferences limit disk usage to 9.31GB
23.10.2008 20:21:11|lhcathome|Sending scheduler request: Requested by user. Requesting 0 seconds of work, reporting 0 completed tasks
23.10.2008 20:21:16|lhcathome|Scheduler request succeeded: got 0 new tasks
23.10.2008 20:21:24||Benchmark results:
23.10.2008 20:21:24|| Number of CPUs: 2
23.10.2008 20:21:24|| 2893 floating point MIPS (Whetstone) per CPU
23.10.2008 20:21:24|| 5913 integer MIPS (Dhrystone) per CPU
23.10.2008 20:21:25||Resuming computation
23.10.2008 20:21:53||No general preferences found - using BOINC defaults
23.10.2008 20:21:53||Reading preferences override file
23.10.2008 20:21:53||Preferences limit memory usage when active to 1022.88MB
23.10.2008 20:21:53||Preferences limit memory usage when idle to 1841.19MB
23.10.2008 20:21:53||Preferences limit disk usage to 9.31GB
23.10.2008 20:24:17||Fetching configuration file from http://www.worldcommunitygrid.org/get_project_config.php
23.10.2008 20:25:04||Fetching configuration file from http://www.worldcommunitygrid.org/get_project_config.php
23.10.2008 20:28:23||Fetching configuration file from http://www.worldcommunitygrid.org/get_project_config.php
23.10.2008 20:35:22||Fetching configuration file from http://www.worldcommunitygrid.org/get_project_config.php
23.10.2008 20:36:15||Fetching configuration file from http://www.worldcommunitygrid.org/get_project_config.php
23.10.2008 20:36:27|lhcathome|Sending scheduler request: To fetch work. Requesting 60480 seconds of work, reporting 0 completed tasks
23.10.2008 20:36:32|lhcathome|Scheduler request succeeded: got 0 new tasks
23.10.2008 20:41:14||Fetching configuration file from http://www.cosmologyathome.org/get_project_config.php
23.10.2008 20:42:57||Fetching configuration file from http://www.cosmologyathome.org/get_project_config.php
23.10.2008 20:45:58|Cosmology@Home|Master file download succeeded
23.10.2008 20:46:03|Cosmology@Home|Sending scheduler request: Project initialization. Requesting 1 seconds of work, reporting 0 completed tasks
23.10.2008 20:46:08|Cosmology@Home|Scheduler request succeeded: got 1 new tasks
23.10.2008 20:46:10|Cosmology@Home|Started download of camb_2.15_windows_intelx86.exe
23.10.2008 20:46:10|Cosmology@Home|Started download of params_101908_010606_0.ini
23.10.2008 20:46:12|Cosmology@Home|Finished download of params_101908_010606_0.ini
23.10.2008 20:46:12|Cosmology@Home|Started download of cosmo_icon.png
23.10.2008 20:46:13|Cosmology@Home|Finished download of cosmo_icon.png
23.10.2008 20:46:13|Cosmology@Home|Started download of cosmo_slide_01.png
23.10.2008 20:46:20|Cosmology@Home|Finished download of cosmo_slide_01.png
23.10.2008 20:46:20|Cosmology@Home|Started download of cosmo_slide_02.png
23.10.2008 20:46:25|Cosmology@Home|Finished download of cosmo_slide_02.png
23.10.2008 20:46:25|Cosmology@Home|Started download of cosmo_slide_03.png
23.10.2008 20:46:26||Fetching configuration file from http://www.worldcommunitygrid.org/get_project_config.php
23.10.2008 20:46:29|Cosmology@Home|Finished download of cosmo_slide_03.png
23.10.2008 20:46:43|Cosmology@Home|Finished download of camb_2.15_windows_intelx86.exe
23.10.2008 20:46:44|Cosmology@Home|Sending scheduler request: To fetch work. Requesting 43886 seconds of work, reporting 0 completed tasks
23.10.2008 20:46:45|Cosmology@Home|Starting wu_101908_010606_0_1_0
23.10.2008 20:46:45|Cosmology@Home|Starting task wu_101908_010606_0_1_0 using camb version 215
23.10.2008 20:46:49|Cosmology@Home|Scheduler request succeeded: got 3 new tasks
23.10.2008 20:46:51|Cosmology@Home|Started download of params_101908_010647_0.ini
23.10.2008 20:46:51|Cosmology@Home|Started download of params_101908_010643_0.ini
23.10.2008 20:46:53|Cosmology@Home|Finished download of params_101908_010647_0.ini
23.10.2008 20:46:53|Cosmology@Home|Finished download of params_101908_010643_0.ini
23.10.2008 20:46:53|Cosmology@Home|Started download of params_101908_010647_1.ini
23.10.2008 20:46:54|Cosmology@Home|Finished download of params_101908_010647_1.ini
23.10.2008 20:46:54|Cosmology@Home|Starting wu_101908_010647_0_2_0
23.10.2008 20:46:54|Cosmology@Home|Starting task wu_101908_010647_0_2_0 using camb version 215
23.10.2008 20:50:04||Fetching configuration file from http://www.worldcommunitygrid.org/get_project_config.php
23.10.2008 20:50:20||Contacting account manager at http://www.worldcommunitygrid.org/
23.10.2008 20:50:22||Account manager error: file not found
23.10.2008 20:57:30|lhcathome|Sending scheduler request: To fetch work. Requesting 60480 seconds of work, reporting 0 completed tasks
23.10.2008 20:57:35|lhcathome|Scheduler request succeeded: got 0 new tasks
23.10.2008 20:59:15||Fetching configuration file from http://orbit.psi.edu/oah/get_project_config.php
23.10.2008 21:00:35||Fetching configuration file from http://orbit.psi.edu/oah/get_project_config.php
23.10.2008 21:56:07||Fetching configuration file from http://www.worldcommunitygrid.org/get_project_config.php
23.10.2008 21:59:42||Fetching configuration file from http://worldcommunitygrid.org/get_project_config.php
23.10.2008 22:23:17||Fetching configuration file from http://www.worldcommunitygrid.org/get_project_config.php

В следующий раз такую длинную хрень прячем под спойлер сами!

Це повідомлення відредагував nikelong: Oct 23 2008, 22:07

[Rilian]

Явно проблемы с подключением к инет на твоей машине. Прокси юзаешь?

По ссылке должен открыться код вида

CODE

This XML file does not appear to have any style information associated with it. The document tree is shown below.
      
−
<project_config>
<name>World Community Grid</name>
<min_passwd_length>6</min_passwd_length>
<uses_username/>
<client_account_creation_disabled/>
<rpc_prefix>http://www.worldcommunitygrid.org/boinc/</rpc_prefix>
−
<platforms>
<platform>windows_intelx86</platform>
<platform>i686-pc-linux-gnu</platform>
<platform>i686-apple-darwin</platform>
<platform>powerpc-apple-darwin</platform>
<platform>x86_64-pc-linux-gnu</platform>
<platform>i386-portbld-freebsd</platform>
</platforms>
</project_config>

собственно похожий код открывается тут

23.10.2008 20:02:23||Fetching configuration file from http://lhcathome.cern.ch/lhcathome/get_project_config.php

[lividum]

Сейчас у меня вот что открывает

World Community Grid 6 http://www.worldcommunitygrid.org/boinc/ windows_intelx86 i686-pc-linux-gnu i686-apple-darwin powerpc-apple-darwin x86_64-pc-linux-gnu i386-portbld-freebsd

[Rilian]

Вроде нормально. И что сейчас говорит БОИНК ?

[lividum]

Вроде нормально. И что сейчас говорит БОИНК ?

то же самое...странно.

[Rilian]

Попробуй рестартнуть БОИНК.....

какое у тебя подключение?

[lividum]

переставил клиент...ничего не изменилось. Подключение через PPPOE, анлим короче. Не судьба видать.

ура, разобрался, надо было сначало учетную запись на их сайте создать...все приступаем))))