![]() |
Привіт Гість ( Вхід | Реєстрація )
![]() |
nikelong |
![]() ![]()
Пост
#1
|
Тера ранчер ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() Група: Trusted Members Повідомлень: 11 909 З нами з: 19-March 05 Користувач №: 92 Стать: Чол ![]() |
![]() Проект "Poem@home" ---------------------------------------------------------------------------------------------------------- Официальный сайт Статистика по команде "Ukraine" Статистика на фришниках Статистика на фришниках по команде "Ukraine" ТОП-20 участников: ![]() ---------------------------------------------------------------------------------------------------------- Дата основания команды - 22.10.2007 Капитан - uNiUs ---------------------------------------------------------------------------------------------------------- Для присоединения к команде Украины: 1. Загрузите BOINC менеджер (Если его у Вас еще нет!) 2. Перейдите в "расширенный вид" 3. Выберите сервис ---> добавить проект 4. Введите адрес проекта http://boinc.fzk.de/poem/ 5. Введите свои регистрационные данные. 6. Найдите нашу команду. Она называется Ukraine и адрес ее статистики вы могли видеть выше. 7. Если есть доступные для загрузки задания Вы их получите и начнете расчеты. ---------------------------------------------------------------------------------------------------------- Полезная информация: Для идентификации пользователя в BOINC могут служить 2 вещи: 1) пара e-mail/пароль 2) межпроектный идентификационный ID (Cross-project ID) - 32значное шестнадцатиричное число. Если Вы пожелаете подключится ещё и к другому BOINC-проекту, то помните: чтобы не плодить новых аккаунтов при подключении к новому проекту или команде, нужно обязательно везде регистрироваться с одним и тем же e-mail/паролем либо CPID. если при регистрации в проекте указать другие e-mail или пароль, BOINC создаст новый аккаунт с тем же именем! ---------------------------------------------------------------------------------------------------------- Описание проекта: Моделирование струтуры белка, используется модифицированный метод молекулярной динамики с помощью стохастической оптимизации. Проект занимается поиском молекул, которые могут заблокировать хемокины (хемотаксические цитокины), что даст возможность блокировать различные процессы в организме на уровне клеточных рецепторов, например, остановить воспалительный процесс. Ведется совместная работа с проектами, посвященными малярии, онкологии, болезни Алцгеймера. В будущем планируется разработать метод моделирования белковых молекул, которые уже могут использовать фармацевты, врачи, ученые, а также детально изучить структуру мебранных белков. Вопрос: "Действительно ли поект POEM@Home отличается от других проектов, изучающих белки?" (Show/Hide) Вопрос: "Сворачивая новую последовательность, как ваш метод будет моделировать действие компаньонок (не нашел другого значения слова chperones) ? Вы участвовали в каком-нибудь недавнем соревновании CASP?" (Show/Hide) Вопрос: Мы хотели бы знать о болезнях, которые Poem@Home мог помочь лечить? (Show/Hide) Вопрос: Что Вы можете сказать на утверждение доктора Бейкера: Розетта использует физически детальную модель всего атома, и была бесспорно лучшим методом до настоящего времени для новых всерток, а также для того, чтобы проектировать новые белки. (Show/Hide) Ссылки по теме:График ППД команды за последние 60 дней: (Show/Hide) http://www.boinc-af.org/content/view/806/219/ http://www.dp.by/wiki/Projects/Poemathome http://wiki.bc-team.org/index.php?title=POEM%40home/en http://www.irelandboinc.com/projects/40-pr...ts/102-poemhome Це повідомлення відредагував x3mEn: May 23 2012, 21:17 |
![]() ![]() |
DonDrakon |
![]()
Пост
#331
|
Соромлюсь щось писати ![]() Група: New Members Повідомлень: 14 З нами з: 7-August 13 Користувач №: 3 279 Стать: Чол Free-DC_CPID ![]() |
Закінчились завдання і для CPU і для GPU.
|
Arbalet |
![]()
Пост
#332
|
![]() Штандартенкранчер ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() Група: Trusted Members Повідомлень: 2 647 З нами з: 16-August 05 Користувач №: 119 Стать: Чол Парк машин: FX-8320 + 1070Ti ![]() |
Открытое тестирование нового GPU-клиента
Организаторы проекта POEM@Home c радостью объявили о начале тестирование новой версии GPU-клиента на их тестовом сервере. Появление нового клиента стало возможным благодаря Владимиру Танковичу, одному из участников проекта, который и предложил свою помощь в улучшении эффективности кода клиента, написанного с помощью OpenCL. В результате производительность GPU-клиента с новым силовым полем выросла в разы, если судить по результатам прогонов на небольшом тестовом GPU-кластере. ![]() Улучшенное силовое поле в новом клиенте обеспечивает намного более точное описание атомных взаимодействий в белках, а также - между белком и растворителем вокруг него. Кроме того, новые вычислительные алгоритмы показывают гораздо лучшую эффективность. Так, клиент на видеокарте AMD Radeon R290X выдает в 13 раз большую производительность, чем на процессоре AMD Opteron 6380. Не менее важным новшеством является использование новых алгоритмов Монте-Карло для параллельных вычислений. С помощью этих новых инструментов исследователи собираются сместить исследовательский акцент проекта POEM@Home с вопроса "В какие структуры сворачиваются белки?» на вопрос "Как белки сворачиваются в эти структуры?". В фокусе внимания исследователей не только процесс сворачивания белков в нативные структуры для выполнения заложенных в них функций, но и временные интервалы этих процессов. Кроме того, нативные структуры должны быть достаточно стабильными, но также обеспечивать необходимую гибкость, чтобы белок мог выполнять свою функцию. Этим аспектам и будут посвящены будущие исследования организаторов проекта, в том числе с помощью нового GPU-приложения. Новое силовое поле GCN, оптимизированное для архитектуры графических процессоров AMD, также неплохо работает на оборудовании NVIDIA Maxwell. Старая версия аппаратного обеспечения OpenCL 1.1 для NVIDIA и AMD также поддерживается, но менее эффективна по сравнению с новой версией. Хотя владельцы старых видеокарт также могут присоединиться к тестированию нового GPU-клиента, им рекомендуется все же рассмотреть вопрос об участии в других BOINC-проектах, где эта помощь будет более востребована. Другие производители GPU, например Intel, не поддерживаются. Тестирование нового GPU-клиента будет развернуто в ограниченном виде на специально выделенном тестовом сервере. Для «отлова» ускользнувших от внимания на этапе внутреннего тестирования технических ошибок будет также задействована помощь участников проекта – владельцев самых разнообразных видеокарт. Чем шире будет диапазон вовлеченных в тестирование поддерживаемых видеокарт, тем более устойчивым выйдет в итоге готовый к штатному использованию программный клиент. Чтобы присоединиться к тестированию нового GPU-клиента в вашем BOINC-менеджере нужно добавить тестовый проект по данному URL - http://int-boinctest.int.kit.edu/poem/ Тестовый сервер не указан в перечне официально поддерживаемых проектов BOINC. Следует обратить внимание, что: - результаты работы на тестовом сервере не будет использоваться для научных публикаций; - кредиты за тестовые задания не будут начисляться в статистике BOINC; - тестовый сервер приложений может привести к сбою системы, так что не забудьте сохранить все важные данные заранее; - наилучшим будет выполнить несколько тестовых заданий на вашей видеокарте и сразу же закончить участие в тестировании. Подготовлено по материалам офсайта POEM@Home -------------------- (Show/Hide) |
vadik_ua |
![]()
Пост
#333
|
![]() мрію про ферму... ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() Група: Trusted Members Повідомлень: 145 З нами з: 20-September 13 Користувач №: 3 308 Стать: Чол Free-DC_CPID Парк машин: i5-3570k@4.5GHz / Radeon 7950@1100 ![]() |
Даешь OpenCL в массы
![]() Карта за $400 на ровне с опертронами за $13.000 ![]() -------------------- ![]() |
Death |
![]()
Пост
#334
|
![]() <script ///> ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() Група: Moderators Повідомлень: 6 371 З нами з: 5-November 03 З: Kyiv Користувач №: 26 Стать: НеСкажу Free-DC_CPID Парк машин: гидропарк jabber:deadjdona@gmail.com ![]() |
-------------------- |
Sergyg |
![]()
Пост
#335
|
Гидробиолог ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() Група: Trusted Members Повідомлень: 947 З нами з: 1-April 09 З: Dnipropetrovsk Користувач №: 980 Стать: Чол Парк машин: мозок - понад GPU, CPU та GPU+CPU ![]() |
Не удалось создать учётную запись
|
CrazyBigCat |
![]()
Пост
#336
|
![]() кранчер зі стажем ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() Група: Trusted Members Повідомлень: 431 З нами з: 15-February 13 Користувач №: 3 172 Стать: Чол Парк машин: Intel Xeon E5440 @ 3,2 GHz GeForce GT 440 1024MB GDDR3 Windows 7; MINIX Neo X7 Quad-Core ARM Cortex-A9 @ 1,6 GHz Android 4.2.2; SAMSUNG Galaxy Tab 2 Dual-Core ARM Cortex-A9 @ 1,2 GHz Android 4.4.4; 2 x Intel Xeon E5-2670 @ 2,6 GHz GeForce GTX 560Ti 1024MB GDDR5 Linux Mint... powerdown... ![]() |
Даешь OpenCL в массы ![]() Карта за $400 на ровне с опертронами за $13.000 ![]() По ПОПУГАЯМ - согласен. Но по конечным результатам, не всегда - F@H в пример... основные результаты процессорные, ГПУ - черновые расчеты... -------------------- ![]() ![]() ![]() |
Arbalet |
![]()
Пост
#337
|
![]() Штандартенкранчер ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() Група: Trusted Members Повідомлень: 2 647 З нами з: 16-August 05 Користувач №: 119 Стать: Чол Парк машин: FX-8320 + 1070Ti ![]() |
Ура, запустили новый ГПУ-клиент!
![]() Релиз POEM ++ 2.17 OpenCL В проекте POEM@Home штатно запустили новое GPU-приложение для видеокарт ATI, для которого недавно создавали даже целый тестовый проект. Благодарят за неоценимую помощь Владимира Танковича. Одновременно с релизом, запущен обсчет трех новых типов задач под новый GPU-клиент. Также обновили ЦПУ-приложение. Те, кто пользовался конфигом под несколько потоков на видеокартах ATI, могут столкнуться с проблемами, которые сейчас решаются. Пока рекомендуют считать одним потоком, если задания валятся с ошибками. ![]() -------------------- (Show/Hide) |
dimus8210 |
![]()
Пост
#338
|
![]() кранчер з фермою ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() Група: Trusted Members Повідомлень: 699 З нами з: 24-November 13 З: Київ Користувач №: 3 348 Стать: Чол Free-DC_CPID Парк машин: Ryzen 5900X, 32Gb озу, RTX3060, Ubuntu 20.04; E5-2680x2, 32Gb озу, GT1030, Ubuntu 20.04 ![]() |
Завдань для відеокарт на сервері 18619
![]() -------------------- Science knows no country, because knowledge belongs to humanity, and is the torch which illuminates the world. Science is the highest personification of the nation because that nation will remain the first which carries the furthest the works of thought and intelligence. Louis Pasteur
|
Arbalet |
![]()
Пост
#339
|
![]() Штандартенкранчер ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() Група: Trusted Members Повідомлень: 2 647 З нами з: 16-August 05 Користувач №: 119 Стать: Чол Парк машин: FX-8320 + 1070Ti ![]() |
Увеличили кредиты для ГПУ-заданий 1vii и 2f21, т.к. время просчета заданий возросло в связи с изменениями конформационных связей в моделируемой системе.
-------------------- (Show/Hide) |
vadik_ua |
![]()
Пост
#340
|
![]() мрію про ферму... ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() Група: Trusted Members Повідомлень: 145 З нами з: 20-September 13 Користувач №: 3 308 Стать: Чол Free-DC_CPID Парк машин: i5-3570k@4.5GHz / Radeon 7950@1100 ![]() |
Увеличили кредиты для ГПУ-заданий 1vii и 2f21, т.к. время просчета заданий возросло в связи с изменениями конформационных связей в моделируемой системе. А я сидів думав, чому завдання раніше рахувалися за 30 хвилин, тепер 1,5 години. Вот оно шо, Михалыч ![]() -------------------- ![]() |
fram |
![]()
Пост
#341
|
![]() кранчер зі стажем ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() Група: Trusted Members Повідомлень: 328 З нами з: 17-March 10 З: Харьков Користувач №: 1 349 Стать: Чол Free-DC_CPID Парк машин: fx8370, RX588x2 ![]() |
![]() Особенно занятно получилось, когда оказалось, что OpenCL приложения POEM@HOME рассчитывают не структуру белка, а какие-то структуры для лучшей работы OLED экранов, например. Хоть признались, в конце концов. Это касается только части старых заданий группы gpucrystal. В них рассчитывалась конфигурация органических молекул (в частности, полициклических ароматических углеводородов). В догонку ![]() ![]() -------------------- Жить, конечно, хорошо....а хорошо жить - еще лучше
|
vadik_ua |
![]()
Пост
#342
|
![]() мрію про ферму... ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() Група: Trusted Members Повідомлень: 145 З нами з: 20-September 13 Користувач №: 3 308 Стать: Чол Free-DC_CPID Парк машин: i5-3570k@4.5GHz / Radeon 7950@1100 ![]() |
Судячи з повідомлення на сайті проекту, він добігає кінця. Дораховуються фінальні завдання, протягом 2-х місяців буде зупинений сервак. Сайт і форум обіцяють підтримувати ще деякий час. Переходжу зі своєю відеокартою на folding@home
![]() -------------------- ![]() |
dimus8210 |
![]()
Пост
#343
|
![]() кранчер з фермою ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() Група: Trusted Members Повідомлень: 699 З нами з: 24-November 13 З: Київ Користувач №: 3 348 Стать: Чол Free-DC_CPID Парк машин: Ryzen 5900X, 32Gb озу, RTX3060, Ubuntu 20.04; E5-2680x2, 32Gb озу, GT1030, Ubuntu 20.04 ![]() |
Судячи з повідомлення на сайті проекту, він добігає кінця. Дораховуються фінальні завдання, протягом 2-х місяців буде зупинений сервак. Сайт і форум обіцяють підтримувати ще деякий час. Переходжу зі своєю відеокартою на folding@home ![]() Судячи з написаного у проекта достатньо своїх потужностей завдяки оптимізації кода що зробив Володимир Танкович ![]() Код їх додатка SIMONA відкритий і доступний для використання всіма охочими ![]() Можемо тільки побажати проекту POEM без HOME подальших успіхів і за їх рекомендацією підтримати інші проекти РВ ![]() -------------------- Science knows no country, because knowledge belongs to humanity, and is the torch which illuminates the world. Science is the highest personification of the nation because that nation will remain the first which carries the furthest the works of thought and intelligence. Louis Pasteur
|
![]() ![]() |
![]() |
Lo-Fi Версія | Поточний час: 26th April 2024 - 17:10 |