Українська команда з розподілених обчислень

Помоги в борьбе с детским раком / Help Fight Childhood Cancer

Как присоединиться читайте в главном топике World Community Grid

• Help Fight Childhood Cancer - статья у нас на сайте
• Статистика по команде "Ukraine"
• Топ-50 участников команды
• Общая статистика проекта
• обзор проекта на английском
• Официальный сайт Университета Чиба (новости на сайте)
• Видео, составленное командой NMG-NETWORK

World Community Grid рада объявить о запуске проекта Help Fight Childhood Cancer под руководством Института по Исследованию Рака в Чибо (Япония), а также Университета Чиба (префектура Чиба, Япония). Миссия проекта - найти лекарства которые смогут заблокировать три вида белков обычно связываемых с развитием Нейробластомы (вид рака) - одного из видов плотных опухолей которые чаще всего развиваются у детей. Нахождение лекарств, блокирующих эти белки, позволит более эффективно лечить этот вид опухоли с помощью химиотерапии. Нейробластома проявляется чаще всего в раннем детстве и обычно ведет к смерти. Если проект будет удачным, он может привести к прорыву в исследованиях этой болезни, которая до сих пор не поддавалась ученым, и это позволит намного увеличить шансы на лечение нейробластомы.

В новой фазе проекта, запущеной в Августе 2010, исследуется 3 дополнительных цели
После этого ввиду успешност экспериментов добавлено еще 3 цели. Итого на апрель 2012 года рассчитано 8 целей, и еще 1 на очереди

Help Fight Childhood Cancer это двенадцатый проект в рамках World Community Grid и один из 7 (на момент запуска) которые сейчас активны. Для более детальной информации по остальным проектам, заходите на форум World Community Grid.

Часто задаваемые вопросы по проекту:

Что такое нейробластома?
Нейробластома - один из видов злокачественных опухолей и встречается обычно у младенцев и детей и очень редко у детей старше 10 лет. Клетки этой опухоли напоминают нервные клетки на ранних этапах их развития у плода. Одна треть нейробластом развивается в надпочечниках, другая треть - в брюшной полости по ходу нервных стволов вдоль позвоночника и остальные - в грудной полости и на шее. Некоторые нейробластомы возникают из спинного мозга. Иногда в связи с широким распространением опухоли на момент диагностики трудно установить точно место, откуда возникла опухоль. Не все опухоли нервной системы относятся к злокачественным. Нейробластома составляет 6-10% из всех детских раковых заболеваний и 15% от всех летальных исходов вызванных раком.

Что вызывает нейробластому?
Вероятность возникновения нейробластомы по всему миру почти одинаковая. Это дает возможность предположить, что факторы окружающей среды, например, ее загрязнение, не являются причиной развития этой опухоли. Многие исследователи полагают, что нейробластома возникает в том случае, когда нормальные эмбриональные нейробласты не созревают в нервные клетки или клетки коры надпочечников. Вместо этого, они продолжают расти и делиться. Большинство нейробластом не являются следствием наследуемых мутаций ДНК. Они вызваны мутациями, приобретенными в ранний период жизни ребенка. Эти мутации присутствуют в опухолевых клетках родителя ребенка и не передаются детям. Причины, вызывающие изменения ДНК, приводящие к возникновению нейробластом, не известны.

Какие потенциальные преимущества проекта Help Fight Childhood Cancer?
Институт по Исследованию Рака в Чибо, а также Университет Чиба (Япония) используют компьютерные ресурсы WCG для определения новых лекарственных кандидатов которые имеют нужную форму и химические характеристики для блокирования трех протеинов: TrkB, ALK и SCxx, которые часто встречаются, или ненормально мутируют, в агрессивно развивающихся нейробластомах. Блокирование этих протеинов, как считают ученые, позволит значительно повысить шансы на излечение с помощью химиотерапии.

Что именно считают рассчетные ядра проекта Help Fight Childhood Cancer?
Исследователи приготовили базу из 3 миллионов соединений - или потенциальных кандидатов для лекарства - и используют мощности добровольцев в WCG для симуляции лабораторных экспериментов, чтобы протестировать какие из этих соединений блокируют протеины TrkB, ALK и SCxx. Лучшие из моелкул будут выбраны и протестированы в лаборатории для подавления нейробластомы.

Какие преимущества получает проект от использования World Community Grid?
На своих мощностях исследователям для этого проекта понадобилось бы 8000 лет компьютерных рассчетов. С помощью мощностей участников WCG рассчеты могут быть проведены примерно за 2 года!

Что изображено на скринсейвере?
Программа симулирует лабораторное исследование, и проверяет, может ли данный лекарственный кандидат потенциально блокировать протеин, связанный с образованием рака. Форма в центре круга детей представляет собой белковую молекулу, которая является целью эксперимента в данном рабочем юните - белок TrkB, ALK, или SCxx. Когда рассчитывается возможная позиция (докинг двух молекул) лекарственного кандидата и одного из 3 белков, это место обозначается цветным шариком.



Откуда взялись рисунки на сайте Help Fight Childhood Cancer project и в графическом клиенте?
Они были пожертвованы Ассоциацией Детского Рака Японии (Children's Cancer Association of Japan) - это единственная благотворительная организация в Японии которая поддерживает детей больных раком и их семьи. Организация была основана в 1968 году родителями которые потеряли своих детей, больных раком. Рисунки нарисованы детьми:

* "Лев"

* "Розовые семена"

* "Упражнения по радио"


График производительности проекта:


Це повідомлення відредагував Rilian: Apr 16 2012, 21:20

Переключаемся на Help Conquer Cancer!

И у меня сапфировый, а на следующей раздаче надеюсь набрать 10 лет в проекте

Поддерживаю предыдущего оратора

Вот теперь похоже действительно все

Можно сказать, что первые 3 цели были успешно досчитаны.

The research team at Chiba Cancer Center would like to thank World Community Grid members for their valuable CPU time contributions to the Help Fight Childhood Cancer project. Because of your generous support, World Community Grid has processed the first three drug targets faster than expected. The preliminary results look very promising and we will provide more information about this at a later time. In the meantime, we have identified two other drug targets that we would like to process on World Community Grid and should have this work unit data ready in about 2 months or earlier. Again, thank you for your all of your help. We are pleasantly surprised at how World Community Grid has so rapidly advanced our research on curing childhood neuroblastoma cancer.

Thank you,
Dr. Akira Nakagawara
http://www.worldcommunitygrid.org/forums/w...ad_thread,29186

Проект получил на сайте WCG статус "Intermittent". И график в шапке темы это подтверждает Ждем августа!
P.S.
А я таки возьму золото в этом проекте

Появились beta-задания по HFCC. Похоже, до запуска проекта осталось немного.

Хорошие новости!

We have received new work from the researchers for this project. They have identified three additional targets they would like to process. They never expected to be able to run this much work through the grid so quickly and are very excited about being able to submit this additional work. The prior computations have identified some promising drug candidates. After they do some more testing and verifying of these results, they will be working on writing papers and providing more information about them. In the meantime, we thank our membership for the generous contribution to this project and hope you continue to contribute your spare computer power!

http://www.worldcommunitygrid.org/forums/w...ad_thread,29417

несколько я понял, вместо одной цели, будут считаться целых три новых!

Появились полновесные задания! Все на абордаж!

По некоторым оценкам, новые данные будут рассчитываться ~9 месяцев

Самый низкокалорийный из всех проектов,которые я считал.
В среднем, 440 очков в сутки.

Що є то є, рахується довго від 5 до 12 годин на різних машинах , вихлоп слабенький.

зато японцы уже что-то тестируют в лабораториях на основе наших вычислений. я считаю не из-за "калорий"

Новости

Now the calculation for N1, the 4th target of this project, has been proceeding.
For T1, we identified 6 compounds that are effectively repress the cell growth among 50 compounds had selected by computer simulation. We continue further detail examination.
For S1 and S2, we started data analysis of the computer simulation.

We appreciate on your co-operation.

http://www.m.chiba-u.ac.jp/class/bioinfor/...fcc_e/news.html

Новости 14.09.10

We have finished the calculation for the second target as S1.

Now we are preparing the screening experiment by neuroblastoma cells.

Thank you .

http://www.m.chiba-u.ac.jp/class/bioinfor/...fcc_e/news.html

Вот и стукнул один год жизни моих верных электронных трудяг в сия благородном проекте … ха…теперь с уверенностью могу сказать…Я видел зеленого человечка