Help Conquer Cancer, исследование структуры белков в раковых клетках Налаштування

[Rilian]

Читайте статьи о проекте на нашем сайте:
* Официальная статистика
* FAQ по проекту help conquer cancer
* Help Conquer Cancer
* Help Conquer Cancer - результаты проекта, январь 2008
* Help Conquer Cancer - результаты проекта, май 2008 (в переводе) :onpc:
* Help Conquer Cancer - результаты проекта, октябрь 2008 (в переводе) :onpc:
* Сайт Института Рака в Онтарио

Как присоединиться читайте в главном топике World Community Grid

WCG запускает новый проект "Помоги Победить Рак", занимающийся улучшением результатов исследований белков методом рентгеновской кристаллографии. Это поможет не только записать части протеономы человека, но и улучшает понимание возникновения, развития и методы борьбы с раком. Проект спонсирует Институт Рака в Онтарио, Канада. Перейти на официальную страницу



Если Вы желаете помочь ученым в понимании такой сложной, многогранной и беспощадной болезни как Рак — присоединяйтесь к проекту распределенных вычислений "Help Conquer Cancer" (Помоги Победить Рак) основанный учеными из "Ontario Cancer Institute (OCI)" (Институт Рака в Онтарио), "Princess Margaret Hospital" (Госпиталь Принцессы Маргарет» и "University Health Network" (Университетская Сеть Здоровья).
Смысл помощи в том, чтобы предоставить ученым неиспользованное процессорное время вашего ПК для анализа фотографий белков сделанных методом "X-ray Crystallography" (Рентген кристаллография) с целью определения структуры этих белков и в дальнейшем понимания их роли в инициировании, течении и лечении Рака.

Миссия
Миссия проекта ПОМОГИ ПОБЕДИТЬ РАК состоит в том, чтобы улучшить результаты рентгеновской кристаллографии, которая помогает исследователям не только описать неизвестные структуры протеономы человека, но и большим образом понять как образуется рак, как он развивается, и как на него можно повлиять.

Важность проекта
Для того чтобы существенным образом повлиять на понимание рака и на его лечение, нужно не только открыть новые терапевтические подходы нацеленные на исследование метастаз (процесс распространения рака на другие органы тела), но и найти некие маркеры или структурные метки, с помощью которых можно было бы провести раннюю диагностику

Во время изучения многих форм рака, исследователи смогли сделать некоторые открытия даже имея ограниченное представление об участвующих в образовании рака белках. Однако, чтобы глубже понять и найти более эффективные способы лечения, необходимо исследовать все вовлеченные в процесс белки, их структуру и функции, чем и занимается данный проект. В основном это белки, характерные для раковых клеток, а также белки которые в них подавляются. Также исследуются белки которые были модифицированы и изменили свою структуру под воздействием рака.

С помощью рентгеновской кристаллографии исследователи смогут получить более точные данные о структуре этих белков. Это должно привести к более глубокому пониманию функций ракообразующих белков, и позволит найти потенциальные лекарства от смертельной болезни.

С начала проекта обрабатывалось 85 млн изображений.
По данным на 30 июня 2010, в данной фазе проекта обрабатывается более 115 млн изображений, каждое из них - на 2 разных компьютерах. Итого в проекте - 230 млн заданий.
По уточненным данным на 20 октября 2010, в данной фазе проекта обрабатывается более 105 млн изображений, каждое из них - на 2 разных компьютерах. Итого в проекте - 210 млн заданий.

Более 560 (на 1 января 2011) человек из украинской команды распределенных вычислений отдают свободные мощности своих компьютеров на эти исследования.

(Show/Hide)

Help Conquer Cancer project announcement:

World Community Grid takes great pleasure in announcing its newest research project: Help Conquer Cancer, sponsored by the Ontario Cancer Institute in Canada. The mission of Help Conquer Cancer is to improve the results of protein X-ray crystallography, which helps researchers not only annotate parts of the human proteome, but importantly improves their understanding of cancer initiation, progression, and treatment. For more information about this research project, click here. For additional announcement information about this project, please click here.

Help Conquer Cancer runs only on the BOINC client. For more information about BOINC see the last article in this newsletter.

Other Research Projects:

The Help Conquer Cancer project is the fifth research project that is currently active on World Community Grid. The other four projects include: Human Proteome Folding - Phase II, FightAIDS@Home, Discovering Dengue Drugs - Together, and AfricanClimate@Home. We hope that you are participating in one or more of these projects. For more information about all five projects, please click here.

Time to Go BOINC!

In the October 2007 newsletter, World Community Grid announced that it was migrating entirely to BOINC (Berkeley Open Infrastructure for Network Computing), a software platform for volunteer computing and desktop grid computing. The move is being made to provide a better experience for all our members.

This is a reminder to all users of the United Devices client that you must migrate to the BOINC client before it sunsets in 2008 by visiting the website and downloading and installing the BOINC client. The BOINC installer will detect if a computer is running the UD client and if it is found, will help you uninstall it. Details on downloading and installing the BOINC agent for Windows may be found here.

To determine whether you are currently on the BOINC or UD client, double click on the World Community Grid icon in your system tray. If you are running the BOINC client, you will see "BOINC Client" at the top of the information panel. If you are running the United Devices client it will say United Devices in the lower right hand corner.

More details about the migration are available in the member news forum.

Are you active?

As we start this new project, the World Community Grid team wants to make sure that everyone who has signed up is actively contributing. To check out if you are actively contributing, sign in on the website and go to My Grid. In the middle of that page you will see a field for "Last Results Returned". If the last time you returned a result was more than 30 days ago, you are probably not active. The easiest way to become active again is to check that the software is installed and running properly.

To see if the software is installed, check for the World Community Grid logo in your system tray. Here is an example of what the logo looks like in the system tray:

Double-clicking on the logo will bring up the client. If the client does not appear to be running correctly (i.e., the numbers for Task Run Time or Elapsed Time are not increasing, examples below), please use the Contact Us feature on the bottom of most pages of the World Community Grid website, and a World Community Grid team member will help you to figure out how to become active again.

If the World Community Grid logo is not in your system tray, you will need to install the software. For instructions, click here. If you have any questions about this, please ask in the forums or send an email via Contact Us.

------------------------------

Для большей скорости (прирост 40%) используйте 64-битную ОС!

график проекта


видео о проекте


Це повідомлення відредагував Rilian: Jan 6 2011, 09:26

[Rilian]

Апдейт по времени карт и времени процессора при этом

The following data was pulled from three hours of results returned for the Help Conquer Cancer project returned on Oct 17th, 2012. It shows some performance information for the different graphics cards.

CODE

                                    graphics card num_results average_cpu average_elapsed
               AMD Radeon HD 7900 series (Tahiti)        2243          74             119
               AMD Radeon HD 79x0 series (Tahiti)        6705          82             120
             AMD Radeon HD 7800 series (Pitcairn)         163         100             144
                          AMD Radeon HD (unknown)        8592          80             148
                                  GeForce 8800 GT          16         105             153
           AMD Radeon HD 7700 series (Cape Verde)         690          90             180
                                  GeForce GTX 580        3136         177             185
                                  GeForce GTX 570        3183         188             196
               AMD Radeon HD 6900 series (Cayman)        3454          87             203
                                  GeForce GTX 470        1273         186             210
                                  GeForce GTX 480        1012         209             215
                                      Tesla C2075          14         216             218
                                      ATI unknown        8832         101             221
                                  GeForce GTX 590         601         216             222
               ATI Radeon HD5800 series (Cypress)        1579          97             231
                                  GeForce GTX 680        1013         237             241
              ATI Radeon HD 5800 series (Cypress)        4592          95             242
                AMD Radeon HD 6800 series (Barts)        3189          97             261
                                  GeForce GTX 670        1395         255             263
               ATI Radeon HD5700 series (Juniper)        1768          99             286
                                  GeForce GTX 465         366         262             286
                               GeForce GTX 660 Ti         430         283             288
                               GeForce GTX 560 Ti        3558         283             293
              ATI Radeon HD 5700 series (Juniper)        2247         100             304
                                  GeForce 9400 GT          19         117             313
                                  GeForce GTX 690          52         302             316
                                  GeForce GTX 560        1558         313             325
                               GeForce GTX 460 v2          51         314             335
                                      Quadro 5000           1         303             348
                                  GeForce GTX 660         258         355             363
                                 GeForce  GTX 555          53         366             371
                               GeForce GTX 560 SE          32         371             371
                                 GeForce GTX 580M          18         373             373
                                      Quadro 4000          74         354             373
                                  GeForce GTX 460        2076         357             376
                                  GeForce GTX 285         375         393             406
                                  GeForce GTX 275         379         381             407
                                  GeForce GTX 280          80         392             417
                                 GeForce GTX 670M          68         405             418
     AMD Radeon HD 7400/7500/7600 serie (Trinity)          37         127             432
                AMD Radeon HD 6x00 series (Turks)        1030         167             451
                                      Tesla C1060          42         445             453
                                     Quadro 4000M           9         451             457
                               GeForce GTX 550 Ti        1346         440             471
                               GeForce GTX 460 SE          83         452             482
               ATI Radeon HD5x00 series (Redwood)         551         157             490
                                  GeForce GTX 260         897         462             491
              ATI Radeon HD 5x00 series (Redwood)         703         201             512
                                  GeForce GTX 295         211         481             513
                                   GeForce GT 545          46         520             520
                                  GeForce GTS 450         953         467             520
                                  GeForce GT 435M           1          74             522
                                   Quadro FX 3800          92         429             526
                                 GeForce GTX 560M         139         550             559
                                    AMD SUPERSUMO          50         381             630
                                      Quadro 2000         140         626             642
                                     Quadro 2000D          64         614             646
                 AMD Radeon HD 6x00 series (Sumo)         222         427             649
                                 GeForce GTX 460M          89         680             704
                                     Quadro 2000M         131         429             705
                                 GeForce GTX 570M          14         126             721
                                   GeForce GT 330          22         752             772
                                  GeForce GT 635M          18         779             779
                                  GeForce GT 555M         182         463             793
                                  GeForce GT 445M           5         178             865
                                   GeForce GT 530          69         331             868
                                   GeForce GT 240         245         795             878
                                   GeForce GT 640         187         793             893
                                  GeForce GT 420M          26         244             901
                                  GeForce GT 550M          37         316             908
                                 GeForce GTS 360M          45         661             912
                                   GeForce GT 440         171         823             931
                                        NVS 5400M         147         920             932
                                        NVS 5200M          59         943             946
                                     Quadro 1000M         228         657             964
                                  GeForce GT 650M          79        1010            1020
                                   GeForce GT 430         261         906            1036
                                       Quadro 600          76         637            1054
                                  GeForce GT 630M          59        1053            1060
                               GeForce GT 640M LE          10        1058            1061
                                  GeForce GT 640M          12        1059            1062
                                   GeForce GT 620          16        1070            1075
                                  GeForce GT 540M         281         857            1090
                                 GeForce GT 520MX           2         118            1127
                                  GeForce GT 525M          62         658            1166
                                  GeForce GT 425M          24         185            1208
                                   GeForce GT 320          17        1145            1235
               AMD Radeon HD 6300 series (Caicos)         290        1166            1268
                                   GeForce GT 220          94         816            1272
                 ATI Radeon HD5x00 series (Cedar)         159        1253            1345
                ATI Radeon HD 5x00 series (Cedar)         166        1258            1363
                                  GeForce GT 335M          19        1073            1456
                                 GeForce GTS 250M           9         239            1552
               AMD Radeon HD 6250/6310 (Wrestler)           8        1688            2291
                                  Quadro FX 1800M           7        1626            2441
   AMD Radeon HD 6200/6300/7300 series (Wrestler)          43        2903            2957

http://www.worldcommunitygrid.org/forums/w...ad_thread,34078

Under 5 minutes: 480408 (80%)
From 5-10 minutes: 89872 (15%)
From 11-15 minutes: 11504 (1.9%)
From 16 minutes on: 19256 (3.1%)