Nutritious Rice For The World [complete], рассчет популяции нового, более питательного риса |
Привіт Гість ( Вхід | Реєстрація )
Nutritious Rice For The World [complete], рассчет популяции нового, более питательного риса |
Rilian |
May 21 2008, 09:51
Пост
#1
|
interstellar Група: Team member Повідомлень: 17 056 З нами з: 22-February 06 З: Торонто Користувач №: 184 Стать: НеСкажу Free-DC_CPID Парк машин: ноут и кусок сервера |
Nutritious Rice for the World проект стартовал 12 мая 2008 Полезные ссылки: Как присоединиться читайте в главном топике World Community Grid Изучается строение протеинов риса, чтобы потом, не используя генeтические модификации, а просто за счет скрещивания, выводить новые виды. :flowers: Mission The objective of this project is to predict the structure of proteins of major strains of rice. The intent is to help farmers breed better rice strains with higher crop yields, promote greater disease and pest resistance, and utilize a full range of bioavailable nutrients that can benefit people around the world, especially in regions where hunger is a critical concern. Determining the structure of proteins is an extremely difficult and expensive process. However, it is possible to computationally predict a protein's structure from its corresponding DNA sequence. The Computational Biology Research Group at the University of Washington has developed state of the art software to accomplish this. The difficulty is, there are thousands of distinct proteins found in rice. This presents a computational challenge that a single computer cannot solve within a reasonable timeframe. Therefore, volunteers of World Community Grid are invited to assist in this daunting task. Through collaboration with agricultural researchers and farmers, the hope is to eventually improve global rice yields and quality. Significance Hunger and malnutrition are the top risks to health worldwide. Nearly 30 percent of the world's population suffers from some form of malnutrition [1]. Every year, 10 million people die of hunger and hunger-related diseases. In fact, more people die from hunger and malnutrition annually than from AIDS, malaria, and tuberculosis combined [2]. Rice is the main food staple of more than half the world's population. 20 percent of the total food energy intake for every man, woman, and child in the world comes from rice. In Asia alone, more than 2 billion people get up to 70 percent of their daily dietary energy from rice and its by-products [3]. Improving strains of rice to yield larger, more resilient, and nutritionally-optimized harvests will positively impact the lives of billions of people. Approach Making better strains of rice has traditionally been accomplished through cross breeding of strains to produce hybrids with the best features. However, this is limited to crossing strains with easily observable traits. Complex traits (such as high yield, disease resistance, or nutrient content) come from complex biochemical interactions of individual component proteins. Identifying such proteins and understanding their properties and interactions gives farmers the opportunity to affect these traits in a refined manner by choosing more subtle candidates for cross breeding. Predicting the structure of proteins can provide insight into the roles they play in the biochemistry of these traits. Как работает рассчетное ядро ВЮ содержит некоторые исходные параметры состояния белков. Каждое новое вычисление берет исходные параметры и генерирует новые значения в пределах некоторой нормы, и каждое такое состояние считается примерно 2 минуты на среднем по мощности компьютере. После каждого рассчета ВЮ сохраняется (чекпоинт) и проверяет, превышен ли интервал в 6 часов. Если да - ВЮ отправляется на сервер. Иначе - считается дальше. Таким образом мощные компьютеры могут посчитать примерно 500 состояний за ВЮ, а слабые компьютеры около 200. Соответственно, мощные компьютеры получают больше очков за то же самое время. График проекта Це повідомлення відредагував Rilian: May 20 2010, 20:26 |
Tamagoch |
May 23 2008, 16:10
Пост
#2
|
Мультікранчер Група: Trusted Members Повідомлень: 1 731 З нами з: 27-September 03 З: Бровари Користувач №: 18 Стать: Чол Free-DC_CPID Парк машин: Xeon 2690v2 (6x quiet mode), AMD Ryzen 5 3600 (6x no-HT), Intel i5 3rd gen (4x), а також все інше під рукою |
возможно, для очень быстрых процессоров будет выгоднее по очкам, чем медицинские субпроекты WCG, поскольку поощрение идет за количество найденных вариантов рисовых белков (или чего-то там) за 8 часов вычислений...
у меня AMD 2.4 ГГц, все-таки в пересчете на час работы, за рис давали меньше, чем FAAH к тому же, одно и тоже задание рассылается 19 раз и раздаются очки только после того, как вернется минимум 14 результатов по этому заданию - предполагается, что у всех они будут отличаться, так что это не дубли, а скорее "всеми пальцами в небо" -------------------- (Show/Hide) |
Burzum |
May 23 2008, 22:06
Пост
#3
|
D.NET'чик Група: Trusted Members Повідомлень: 1 113 З нами з: 27-April 05 З: Вінниця-Kиїв-Львів Користувач №: 106 Стать: Чол Парк машин: Майже 0 ГГц |
|
nikelong |
May 23 2008, 22:45
Пост
#4
|
Тера ранчер Група: Trusted Members Повідомлень: 11 909 З нами з: 19-March 05 Користувач №: 92 Стать: Чол |
Вопрос: зачем считать задание (одно!!) целых 19 раз, если можна для проверки посчитать три раза?
Тупой проект. -------------------- |
(_KoDAk_) |
May 23 2008, 23:49
Пост
#5
|
BOINC-guru Група: Trusted Members Повідомлень: 3 662 З нами з: 11-August 07 З: Kharkov Користувач №: 569 Стать: Чол Парк машин: E3-1245V2@3400-Mhz 16GB 1х GTX760DCMOC2GD5 Q8200@2300-Mhz 4GB + то там то сям |
недоверчивые или ждут чудес
-------------------- - "ты говоришь так, будто тебя чай ваше не вставляет "
(Show/Hide) Спаcибо автору алфавита за любезно предоставленные буквы. |
Dmitrio |
May 26 2008, 12:21
Пост
#6
|
кранчер-новачок Група: Trusted Members Повідомлень: 54 З нами з: 26-May 08 Користувач №: 748 Стать: Чол Парк машин: 1. AMD Duron 650Mhz 2. AMD Sempron 2Ghz 3. Intel Core 2 Q9450 2,6GHz |
На самом деле проект очень хорошо для старых машин:
1. Очень поднимается статистика кол-ва сданых WU. 2. Даже при очень небольшом времени на кранч машина успеет выполнить WU, потому что считает всегда 8 часов реального времени. А что касается большого лимита WU, так лучше перестраховаться в начале проекта, чем потом иметь возможно неверные результаты. Также, может быть, там используются вычисления/моделирования, которые не всегда дают один и тот же ответ (например вероятность чего-то учитывается). Тогда только при достаточно большом количестве результатов можно указать на правильный ответ. |
Rilian |
Sep 29 2008, 21:33
Пост
#7
|
interstellar Група: Team member Повідомлень: 17 056 З нами з: 22-February 06 З: Торонто Користувач №: 184 Стать: НеСкажу Free-DC_CPID Парк машин: ноут и кусок сервера |
Вот как примерно выглядит графика в проекте
-------------------- |
Death |
Sep 29 2008, 21:52
Пост
#8
|
<script ///> Група: Moderators Повідомлень: 6 371 З нами з: 5-November 03 З: Kyiv Користувач №: 26 Стать: НеСкажу Free-DC_CPID Парк машин: гидропарк jabber:deadjdona@gmail.com |
каша
-------------------- |
Rilian |
Sep 29 2008, 22:00
Пост
#9
|
interstellar Група: Team member Повідомлень: 17 056 З нами з: 22-February 06 З: Торонто Користувач №: 184 Стать: НеСкажу Free-DC_CPID Парк машин: ноут и кусок сервера |
Молекула вертится, типа как в розетте
-------------------- |
Dmitrio |
Sep 30 2008, 11:53
Пост
#10
|
кранчер-новачок Група: Trusted Members Повідомлень: 54 З нами з: 26-May 08 Користувач №: 748 Стать: Чол Парк машин: 1. AMD Duron 650Mhz 2. AMD Sempron 2Ghz 3. Intel Core 2 Q9450 2,6GHz |
|
Rilian |
Jan 11 2009, 04:17
Пост
#11
|
interstellar Група: Team member Повідомлень: 17 056 З нами з: 22-February 06 З: Торонто Користувач №: 184 Стать: НеСкажу Free-DC_CPID Парк машин: ноут и кусок сервера |
Посчитал 100 процессорных дней
-------------------- |
Rilian |
Jan 13 2009, 21:10
Пост
#12
|
interstellar Група: Team member Повідомлень: 17 056 З нами з: 22-February 06 З: Торонто Користувач №: 184 Стать: НеСкажу Free-DC_CPID Парк машин: ноут и кусок сервера |
С этого дня вю Nutritious Rice for the World считаются по 6 часов (были по 10)
-------------------- |
Rilian |
Jan 14 2009, 00:05
Пост
#13
|
interstellar Група: Team member Повідомлень: 17 056 З нами з: 22-February 06 З: Торонто Користувач №: 184 Стать: НеСкажу Free-DC_CPID Парк машин: ноут и кусок сервера |
В шапке добавлен раздел "Как работает рассчетное ядро"
-------------------- |
cosmo_vk |
Jan 25 2009, 11:00
Пост
#14
|
kранчер Група: Trusted Members Повідомлень: 86 З нами з: 19-September 08 З: Ковров Користувач №: 828 Стать: НеСкажу Парк машин: всего по немногу |
а золотую медальку за сколько дней дают?
у меня уже 77 процессорных дней на проекте просчитано, а так до сих пор серебрянная, хотя на других проектах уже была бы золотая точно. -------------------- |
Rilian |
Jan 25 2009, 12:01
Пост
#15
|
interstellar Група: Team member Повідомлень: 17 056 З нами з: 22-February 06 З: Торонто Користувач №: 184 Стать: НеСкажу Free-DC_CPID Парк машин: ноут и кусок сервера |
90 дней - стандартный срок
-------------------- |
Lo-Fi Версія | Поточний час: 1st November 2024 - 00:54 |