Mapping Cancer Markers Налаштування

[e_alesha]

Mapping Cancer Markers (MCM, Картирование маркеров рака)



Старт проекта: 8 ноября 2013.

Организаторы проекта: Торонтский университет (University of Toronto), факультет компьютерных наук, Лаборатория доктора Игоря Юрисика (Dr. Igor Jurisica), в сотрудничестве с Princess Margaret Cancer Centre. Техническую поддержку оказывает Исследовательский центр наук о жизни IBM (IBM Life Sciences Discovery Centre) на базе объединения World Community Grid.

Официальный сайт проекта: http://www.cs.utoronto.ca/~juris/MCM.htm

Цели и задачи проекта Mapping Cancer Markers

Различные формы рака – одна из главных причин смертности в мире. Современные методы лечения обеспечивают пятилетнюю выживаемость (это считается критерием излечения) лишь менее чем половине пациентов. Некоторые формы рака (например, головного мозга или поджелудочной железы) до сих пор остаются на 100% смертельными – врачи могут только на несколько лет или месяцев продлить мучения больных. Выживаемость больных раком легких лишь в последние годы увеличилась до 16%. Общее количество больных в 31 ведущей стране мира оценивается в 19 млн. человек.

Причины возникновения рака – это не только канцерогены в окружающей среде и общеизвестные вредные привычки, но и нарушения работы генов. Многие из них и тем более процессы их взаимодействия еще не выявлены. Развитие рака является многоступенчатым процессом, который приводит к неконтролируемому росту клеток опухоли, а затем – к их распространению (метастазированию) в другие органы организма. Этот процесс сопровождается усилением активности онкогенов, новыми мутациями, прекращением, подавлением или активизацией кодируемых генами белков.

Злокачественные изменения в клетках могут быть обнаружены с помощью так называемых мАркеров – определенных участков ДНК и связанных с ними специфических белков. Комбинации этих маркеров связаны с характерными типами рака. По наличию тех или иных маркеров в организме человека можно определить его предрасположенность к определенной форме рака, развитие и протекание выявленного заболевания, а также результаты проведенной терапии, что позволяет значительно улучшить качество лечения.

Например, годы исследований рака молочной железы и простаты позволили обнаружить маркеры, которые позволяют диагностировать рак на ранних стадиях, выявлять пациентов с высоким риском заболевания, прогнозировать реакцию организма на лечение. Известны маркеры и для некоторых других видов рака, но еще больше их предстоит открыть, так как рак очень неоднороден.

Авторы проекта Mapping Cancer Markers (MCM) надеются с помощью участников World Community Grid обнаружить и картировать клинически полезные онкомаркеры, связанные с раком молочной железы, яичников, простаты, поджелудочной железы, легких и других органов. Для этого потребуется обработка проб здоровых и пораженных раком образцов тканей тысяч пациентов, а также тестирование астрономического числа комбинаций маркеров. При этом методом простого перебора комбинаций выполнить такую задачу не представляется возможным – на это не хватит никаких вычислительных ресурсов. Вместо этого исследователи применяют специальные эвристические методы уменьшения пространства поиска полезных маркеров, которые позволят произвести всеобъемлющее картирование в разумные сроки с помощью вычислительных мощностей World Community Grid.

Перечень публикаций и патентов организаторов MCM

Связанные с проектом публикации на сайте:
В проекте Mapping Cancer Markers совершенствуют методологию исследования рака

Слово организаторам МСМ:


Требования проекта к ОС и железу: Windows, Linux, Mac; ок. 400 Мб оперативной памяти и 500 Мб свободного места на диске.

Текущая версия расчетного клиента: 7.24

Скриншот графической оболочки клиента Mapping Cancer Markers


Бейджики проекта:

Це повідомлення відредагував Arbalet: Feb 13 2015, 21:04

[Rilian]

Новости проекта http://www.worldcommunitygrid.org/about_us...o?articleId=419

[Arbalet]

Новости проекта http://www.worldcommunitygrid.org/about_us...o?articleId=419

Дык это, перевел уже давно - тут

[Rilian]

апдейт

One step closer to identifying lung cancer biomarkers

http://www.worldcommunitygrid.org/about_us...o?articleId=443

[Liderr1]

Вот хотел спросить.
04.03.2015 в 19:48 было 73%
26.09.2015 было 93%
Статус выполнения проекта.
Сейчас, сегодня, тоже 73% Что это такое??

[vadik_ua]

Вот хотел спросить.
04.03.2015 в 19:48 было 73%
26.09.2015 было 93%
Статус выполнения проекта.
Сейчас, сегодня, тоже 73% Что это такое??

Добавили еще заданий, соответственно, изменился прогрессбар. Было 300,000,000 стало 530,000,000.

Вот здесь народ следит за прогрессом.

[Liderr1]

Cпасибо, я подозревал что здесь что-то не то)

[Rilian]

я уже насчитал 71 год

[wlad]

я уже насчитал 71 год

Сколько же Вам сейчас?

[Rilian]

wlad, в 2.x раза меньше)

[Rilian]

Hello all,

In this latest Mapping Cancer Markers project update, the researchers discuss the upcoming transition to analyzing ovarian cancer, as well as many other details. Please take the time to check it out!

Thank you,
ErikaT

http://www.worldcommunitygrid.org/about_us...o?articleId=457

[Liderr1]

ну шо, все заглохло?

[Vzik]

ну шо, все заглохло?

Наразі отримую завдання, все лишається в силі.

[Rilian]

Research update from the MCM team (March 2024)

https://www.worldcommunitygrid.org/about_us...s?articleId=809

We continue to characterise lung cancer biomarkers identified in the MCM1 project. This update focuses on HSD17B11, a gene associated with lung cancer survival. HSD17B11 is a protein coding gene, relatively ubiquitously expressed across organs and tissues. It is a short-chain alcohol dehydrogenase that metabolises secondary alcohols and ketones.

[Rilian]

13 May 2024 – Research update from the MCM team (May 2024)

We continue to characterise lung cancer biomarkers identified in the MCM1 project. This update focuses on KLF5, a well-studied gene that has been implicated in several cancer types. KLF5 is a transcription factor, which is expressed across numerous organs and tissues.

[Rilian]

July 10 update

Since November 2013, World Community Grid volunteers have donated over 905,700 CPU years to the project, helping analyse data on lung and ovarian cancer and sarcoma, much more thoroughly than otherwise possible. We are immensely grateful for this continued support.

Focusing on characterising the 26 top-scoring genes in lung cancer, we have already discussed VAMP1, FARP1, GSDMB, ADH6, IL13RA1, PCSK5, TLE3, HSD17B11, and KLF5 in previous MCM updates. Here, we outline information on ASTN2.

https://www.worldcommunitygrid.org/about_us...s?articleId=813

З листопада 2013 року волонтери World Community Grid пожертвували понад 905 700 ЦП-років для проекту, допомагаючи аналізувати дані про рак легенів і яєчників і саркому набагато ретельніше, ніж це можливо в іншому випадку. Ми безмежно вдячні за цю постійну підтримку.

Зосереджуючись на характеристиці 26 генів з найвищими показниками раку легенів, ми вже обговорювали VAMP1, FARP1, GSDMB, ADH6, IL13RA1, PCSK5, TLE3, HSD17B11 і KLF5 у попередніх оновленнях MCM. Тут ми наводимо інформацію про ASTN2. https://www.worldcommunitygrid.org/about_us...s?articleId=813