Биологический проект |
Привіт Гість ( Вхід | Реєстрація )
Биологический проект |
Alien |
Jan 31 2010, 15:26
Пост
#1
|
Разработчик MolDynGrid Група: Trusted Members Повідомлень: 569 З нами з: 7-October 07 Користувач №: 594 Стать: Чол Парк машин: Q6600 2.4@3.0GHz\Asus p5kc\8Gb\8600GT\2 SATA: Sams 500Gb+ 500Gb + Seagate 400Gb |
Как насчет сделать клиенты для громакса\намда с практическим применением в НИИ академии наук Украины?
-------------------- |
Alien |
Feb 11 2010, 12:06
Пост
#46
|
Разработчик MolDynGrid Група: Trusted Members Повідомлень: 569 З нами з: 7-October 07 Користувач №: 594 Стать: Чол Парк машин: Q6600 2.4@3.0GHz\Asus p5kc\8Gb\8600GT\2 SATA: Sams 500Gb+ 500Gb + Seagate 400Gb |
Ребята, что от меня еще нужно?
Вид команды для запуска я предоставил, могу предоставить тестовый проект. Что еще? -------------------- |
Rilian |
Feb 11 2010, 13:17
Пост
#47
|
interstellar Група: Team member Повідомлень: 17 049 З нами з: 22-February 06 З: Торонто Користувач №: 184 Стать: НеСкажу Free-DC_CPID Парк машин: ноут и кусок сервера |
Alien, как видишь, биохимиков кроме тебя на форуме нет.
-------------------- |
Alien |
Feb 11 2010, 13:51
Пост
#48
|
Разработчик MolDynGrid Група: Trusted Members Повідомлень: 569 З нами з: 7-October 07 Користувач №: 594 Стать: Чол Парк машин: Q6600 2.4@3.0GHz\Asus p5kc\8Gb\8600GT\2 SATA: Sams 500Gb+ 500Gb + Seagate 400Gb |
я так понимаю, биохим аспект здесь неважен пока...
главное технически настроить.. это уже в вашей компетенции. ЗЫ ученые не любят ходить на форумы и общаться... но это не значит, что их нет ) -------------------- |
Rilian |
Feb 11 2010, 14:10
Пост
#49
|
interstellar Група: Team member Повідомлень: 17 049 З нами з: 22-February 06 З: Торонто Користувач №: 184 Стать: НеСкажу Free-DC_CPID Парк машин: ноут и кусок сервера |
ну мы настроим и получим еще один gerasim@home (который завис в состоянии "сервер поднят, что считать?")
-------------------- |
Alien |
Feb 11 2010, 16:17
Пост
#50
|
Разработчик MolDynGrid Група: Trusted Members Повідомлень: 569 З нами з: 7-October 07 Користувач №: 594 Стать: Чол Парк машин: Q6600 2.4@3.0GHz\Asus p5kc\8Gb\8600GT\2 SATA: Sams 500Gb+ 500Gb + Seagate 400Gb |
неправильная позиция..
если ты ждешь что сначала люди появятся, то ты ошибаешься.. Во-первых они есть, во-вторых, если речь о биологах\химиках, то они будут активны лишь когда будет все готово и автоматизировано. Желающих ставить задачи огромное количество, еще меньше образованы в этой сфере (ИТ) и единицы работают без автоматизации. Если говорить про молекулярную динамику и громакс, то мы автоматизировали процесс, но сейчас работаем над методологией, чтоб потом обучать людей далеких от информатики или прикладных пакетов. Если мы хотим развивать украинский проект для биологов, нужно сделать базу и не боятся что на первых порах будет мало желающих. По мере образования их будет больше. И чем легче будет процедура, тем больше будет тех, кто будет заинтересован. Если хотите заморозить до ближайшего будущего, ок. Лично для меня это некритично, но вы противоречите себе. Моя цель лишь помочь вам в вашем развитии, чем смогу, со своей стороны, а могу немалое. -------------------- |
Rilian |
Feb 12 2010, 03:49
Пост
#51
|
interstellar Група: Team member Повідомлень: 17 049 З нами з: 22-February 06 З: Торонто Користувач №: 184 Стать: НеСкажу Free-DC_CPID Парк машин: ноут и кусок сервера |
О
читаю RNA World FAQ: QUOTE Can I as a scientist submit tasks to RNA World? Hopefully soon. We are working on implementing user job submission interfaces for each of the various RNA World applications. However, you will have to register and receive a digital certificate such that jobs submitted to our system are clearly correlated to an individual known to us. Скоро можно будет сабмитить свои белки Кстати сегодня видел в кэше задания с tRNA -------------------- |
Alien |
Feb 12 2010, 14:13
Пост
#52
|
Разработчик MolDynGrid Група: Trusted Members Повідомлень: 569 З нами з: 7-October 07 Користувач №: 594 Стать: Чол Парк машин: Q6600 2.4@3.0GHz\Asus p5kc\8Gb\8600GT\2 SATA: Sams 500Gb+ 500Gb + Seagate 400Gb |
я видел в топике по РНК, что у них бесплатные сорсы.. было бы интересно протестировать.
Отлично, мы как раз с транспортной РНК и работаем! Держи нас в курсе. -------------------- |
Rilian |
Feb 12 2010, 14:26
Пост
#53
|
interstellar Група: Team member Повідомлень: 17 049 З нами з: 22-February 06 З: Торонто Користувач №: 184 Стать: НеСкажу Free-DC_CPID Парк машин: ноут и кусок сервера |
Alien, кстати в Hydrogen@home можно сабмитить работу на Autodock
теоретически также в DrugDiscovery@home. А там одним из кураторов проекта является Андрей Воронков из МГУ -------------------- |
Alien |
Feb 16 2010, 20:37
Пост
#54
|
Разработчик MolDynGrid Група: Trusted Members Повідомлень: 569 З нами з: 7-October 07 Користувач №: 594 Стать: Чол Парк машин: Q6600 2.4@3.0GHz\Asus p5kc\8Gb\8600GT\2 SATA: Sams 500Gb+ 500Gb + Seagate 400Gb |
Rilian или кто-то из ребят, когда вы будете свободны, чтоб попробовать поставить задачу через WCG?
Мне наверное нужно получить аккаунт? Чтоб я не тратил и без того малое время, прошу помощи, чтоб разобраться в этой системе.. У меня есть международный сертификат (X509), он может быть им необходим, для идентификации моей личности. -------------------- |
Rilian |
Feb 16 2010, 21:25
Пост
#55
|
interstellar Група: Team member Повідомлень: 17 049 З нами з: 22-February 06 З: Торонто Користувач №: 184 Стать: НеСкажу Free-DC_CPID Парк машин: ноут и кусок сервера |
Alien, хорошо! давай начнем пробовать со следующей недели. Щяс немного занят, и еще уезжаю оффлайн на неск дней.
-------------------- |
Alien |
Feb 23 2010, 21:37
Пост
#56
|
Разработчик MolDynGrid Група: Trusted Members Повідомлень: 569 З нами з: 7-October 07 Користувач №: 594 Стать: Чол Парк машин: Q6600 2.4@3.0GHz\Asus p5kc\8Gb\8600GT\2 SATA: Sams 500Gb+ 500Gb + Seagate 400Gb |
Такс, ребята..
Я уже зарегистрировался на международную конференцию, которая будет проходить в Киеве МІНІСТЕРСТВО ОХОРОНИ ЗДОРОВ'Я УКРАЇНИ ПЕРШИЙ З'ЇЗД ”МЕДИЧНА ТА БІОЛОГІЧНА ІНФОРМАТИКА І КІБЕРНЕТИКА” http://www.inmeds.com.ua/content/conference/conf_2010.php Тематика моего выступления будет по направлению ускорения процессов расчета молекулярной динамики на базе нашей виртуальной лаборатории MolDynGrid. Если хотите, чтоб в докладе прозвучали и вы, а так же, чтоб были напечатаны в тезисах конференции, то стоит поторопиться. Остался где-то месяц, а нам нужно настроить наш био-проект. Пока я ориентируюсь на академический грид. У кого есть хорошие знания линукса, С и CUDA - велкам! Попробуем настроить плагин к громаксу. -------------------- |
Death |
Mar 17 2010, 11:27
Пост
#57
|
<script ///> Група: Moderators Повідомлень: 6 371 З нами з: 5-November 03 З: Kyiv Користувач №: 26 Стать: НеСкажу Free-DC_CPID Парк машин: гидропарк jabber:deadjdona@gmail.com |
Rilian, а видел на вцг ссылку "отправить свой проект"?
может Элиена заинтересует. -------------------- |
Alien |
Mar 18 2010, 22:39
Пост
#58
|
Разработчик MolDynGrid Група: Trusted Members Повідомлень: 569 З нами з: 7-October 07 Користувач №: 594 Стать: Чол Парк машин: Q6600 2.4@3.0GHz\Asus p5kc\8Gb\8600GT\2 SATA: Sams 500Gb+ 500Gb + Seagate 400Gb |
я не видел, покажи плиз.
-------------------- |
Rilian |
Mar 18 2010, 23:15
Пост
#59
|
interstellar Група: Team member Повідомлень: 17 049 З нами з: 22-February 06 З: Торонто Користувач №: 184 Стать: НеСкажу Free-DC_CPID Парк машин: ноут и кусок сервера |
-------------------- |
Alien |
Mar 19 2010, 00:28
Пост
#60
|
Разработчик MolDynGrid Група: Trusted Members Повідомлень: 569 З нами з: 7-October 07 Користувач №: 594 Стать: Чол Парк машин: Q6600 2.4@3.0GHz\Asus p5kc\8Gb\8600GT\2 SATA: Sams 500Gb+ 500Gb + Seagate 400Gb |
почитал...
идеально подходит Genomics and disease - functions of proteins that are coded by human genes and how they might relate to cures for common diseases но регламент у них конечно непростой.. как там успехи по направлению своего проекта? -------------------- |
Lo-Fi Версія | Поточний час: 23rd September 2024 - 08:52 |