FightMalaria@Home |
Привіт Гість ( Вхід | Реєстрація )
FightMalaria@Home |
nikelong |
Jul 28 2011, 17:21
Пост
#1
|
Тера ранчер Група: Trusted Members Повідомлень: 11 909 З нами з: 19-March 05 Користувач №: 92 Стать: Чол |
--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Дата основания команды - 19 Июля 2012 Капитан - Rilian -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Для присоединения к команде Украины: 1. Загрузите BOINC менеджер (Если его у Вас еще нет!) 2. Перейдите в "расширенный вид" 3. Выберите сервис ---> добавить проект 4. Введите адрес проекта http://boinc.ucd.ie/fmah/ 5. Введите свои регистрационные данные. 6. Найдите нашу команду. Она называется Ukraine и адрес ее статистики вы могли видеть выше. 7. Если есть доступные для загрузки задания Вы их получите и начнете расчеты. -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- О проекте: FightMalaria@Home Цель: Открытие новых соединений для противомалярийных препаратов. К сведению: Каждые 45 секунд от малярии, в мире умирает один ребенок. Это заболевание наиболее распространено в бедных странах, где оно заражает 216 миллионов людей и убивает 650 тысяч каждый год, в основном африканских детей в возрасте до 5 лет. Малярия и дальше продолжает развивать устойчивость к доступным медикаментам. Поэтому нам нужно срочное открытие новых препаратов, для замены существующих. Важно, что эти новые лекарства должны быть ориентированы на новые белки у паразита. Проект FightMalaria@Home направлен на поиск новых соединений. Возможности: Геном малярии был упорядочен, в следствии чего была выявлена протеома. Экспрессия белка была подтверждена на различных этапах жизненного цикла этой структуры. Многочисленные кристаллические структуры целевых белков также доступны, а остаток был смоделирован, используя доступные структурные шаблоны. Большие научно-исследовательские организации GSK, Novartis уже опробовали миллионы соединений и обнаружили около 19 000 хитов(кандидатов), которые выглядят многообещающе в перспективности лечения малярии. Но они не знают, какой целевой белок ингибирует эти соединения. Изучение и разработка новых лекарств будут существенно ускоренны, зная целевой белок для каждого из этих хитов. Проблема: Мы планируем закрепить каждую из 18924 хитов в структуры каждой из 5363 белков малярийного паразита. Вычислительная мощность, необходима огромная. Решение: Мы стремимся использовать добровольно пожертвованные вычислительные мощности персональных компьютеров в мире. Большинство компьютеров используют только малую часть доступной мощности процессора для ежедневной работы. Мы запустили сервер BOINC, который позволяет распределять задания между волонтерами. Обработка заданий будет осуществляться в фоновом режиме. При подключении 1000 компьютеров таким образом, мы сможем достичь мощности эквивалентной суперкомпьютерам. Различия между проектами GO Fight Against Malaria(WCG) и FightMalaria@Home Проект GO Fight Against Malaria во главе с Алексом Перрименом(Alex Perryman) из института Скриппса, направлен на поиск новых низкомолекулярных ингибиторов известных белковых соединений. Их замысел состоит в том, чтобы сосредоточиться на мутациях, которые были уже найдены в установленных соединениях для препаратов от малярии. Для этого проекта GFAM необходимо закрепить миллионы мелких молекул в нескольких белковых структурах рецептора. Мы делаем нечто совсем другое. Мы берем небольшие составные хиты соединения, которые уже были найдены и которые могут убить малярию, и пытаемся выяснить, с какими белками эти соединения нужно связывать. Крупные фармацевтические компании обработали более 3 млн. соединений и обнаружили 18924(хитов) которые эффективны против малярии. Но выяснить, где эти соединения связываются с паразитом или как они работают, будет сложно. Мы надеемся сделать это, состыковывая каждый хит(18924) с каждой структурой белка(5363). Главное преимущество, которое мы имеем перед проекту GFAM, состоит в том, что мы ЗНАЕМ, что соединения которые мы используем, уже работают против малярии. Если мы выясним, какой белок они подавляют, то это откроет целую область исследований: - что белок делает (биохимия)? - на что это похоже (кристаллография рентгена)? - мы можем найти лучшие ингибиторы (лекарственная химия)? - или одного лидерство достаточно, что бы вылечить болезнь(клиническая фармакология)? Основным недостатком является то, что мы никогда не сможем охватить весь протеом. Некоторые белки естественно не упорядочены и останутся непрозрачными к кристаллографии или моделированию. Но мы постараемся сделать лучшую попытку. У нас уже есть структуры(рентгеновские или моделированные) для 1426 из 5363 белков (26%), и мы будем продолжать делать моделирования более сложных белков. Если бы мы пробовали это только с одной частью соединений(1426), то мы имели бы шансы на успех 1:4. Но поскольку мы попробуем это почти 19 000 раз, у нас должны быть довольно хорошие шансы на успех. Я был бы рад, если бы нам удалось найти хотя бы одну новую цель в борьбе с малярией, так как это может быть Ахиллесова пята для болезни и путем её излечения. Новые препараты, разработанные из этого проекта открытой науки, будут направлены на новые цели, для того что бы у паразита не было возможности адаптироваться к препаратам. Как и все лекарства, они также в конечном счете потерпят неудачу, но по крайней мере мы попытаемся найти новые препараты быстрее, чем паразит сможет развить сопротивление. Борьба продолжается... Промежуточные результаты (Show/Hide) -------------------- |
Death |
Jul 28 2011, 23:04
Пост
#2
|
<script ///> Група: Moderators Повідомлень: 6 371 З нами з: 5-November 03 З: Kyiv Користувач №: 26 Стать: НеСкажу Free-DC_CPID Парк машин: гидропарк jabber:deadjdona@gmail.com |
Donate spare CPU time
If you would like to join the BOINC community who are donating screensaver CPU time, then please go here: {link to be added when BOINC goes live} If you would like to get involved with the development of the BOINC server, then please contact Anthony Chubb (below). -------------------- |
nikelong |
Jul 29 2011, 08:40
Пост
#3
|
Тера ранчер Група: Trusted Members Повідомлень: 11 909 З нами з: 19-March 05 Користувач №: 92 Стать: Чол |
Энд, ВТФ?
-------------------- |
Death |
Jul 29 2011, 23:07
Пост
#4
|
<script ///> Група: Moderators Повідомлень: 6 371 З нами з: 5-November 03 З: Kyiv Користувач №: 26 Стать: НеСкажу Free-DC_CPID Парк машин: гидропарк jabber:deadjdona@gmail.com |
когда настроят боинк дадуд ссылку на него.
-------------------- |
Rilian |
Jul 19 2012, 00:14
Пост
#5
|
interstellar Група: Team member Повідомлень: 17 049 З нами з: 22-February 06 З: Торонто Користувач №: 184 Стать: НеСкажу Free-DC_CPID Парк машин: ноут и кусок сервера |
http://boinc.ucd.ie/fmah/
Ukraine http://boinc.ucd.ie/fmah/team_display.php?teamid=21 About FightMalaria@Home FightMalaria@Home is a research project that uses donated CPU time to perform docking simulations on malaria proteins. You can participate by downloading and running a free program on your computer. PLEASE NOTE: FightMalaria@Home is still in testing. Although you may join the project, there may not be a constant supply of tasks until the launch day (23rd July). The server may also be unavailable up until this time. By participating in this project you are agreeing to our terms of use. FMAH is based in UCD CASL Project Homepage - http://www.fight-malaria.org/ -------------------- |
re_SET |
Jul 19 2012, 01:00
Пост
#6
|
кранчер зі стажем Група: Trusted Members Повідомлень: 454 З нами з: 26-January 09 З: Волинська обл., смт. Любешів Користувач №: 911 Стать: Чол Парк машин: 1х Athlon X2 BE2300 (2.2 Ghz) 1x C2D E8200 1x C2D E2180 (2.34 Ghz) 1x C2D E2160 1x C2D E5200 (2.9 Ghz) 9x C2D E6500 (Up 3.24 Ghz) 1x C2Q Q8300 (Up 3 Ghz) |
+1
-------------------- Нельзя попасть в Рай одной религии, не попав при этом в Ад всех остальных...
(Show/Hide) |
Death |
Jul 19 2012, 10:12
Пост
#7
|
<script ///> Група: Moderators Повідомлень: 6 371 З нами з: 5-November 03 З: Kyiv Користувач №: 26 Стать: НеСкажу Free-DC_CPID Парк машин: гидропарк jabber:deadjdona@gmail.com |
пока даунлоад не включили
-------------------- |
Rilian |
Jul 21 2012, 20:06
Пост
#8
|
interstellar Група: Team member Повідомлень: 17 049 З нами з: 22-February 06 З: Торонто Користувач №: 184 Стать: НеСкажу Free-DC_CPID Парк машин: ноут и кусок сервера |
FM@H up and running
We have just fired off the first 144,000 docking runs. If you'd like to see the details behind the 1,000,000,000 docking runs planned, please go to the 'Idea' page on our website: http://www.fight-malaria.org/index.php?opt...d=99&Itemid=108 After the first 94 million docking runs, we'll have achieved our first major milestone. We may have a small delay next week between experiments, then it's all systems go. Thanks again for your your help with this. ciao, Ant -------------------- |
Death |
Jul 22 2012, 03:15
Пост
#9
|
<script ///> Група: Moderators Повідомлень: 6 371 З нами з: 5-November 03 З: Kyiv Користувач №: 26 Стать: НеСкажу Free-DC_CPID Парк машин: гидропарк jabber:deadjdona@gmail.com |
Имя Всего очков В среднем за день Страна
1) Death 1,076 98.24 Ukraine -------------------- |
Bel |
Jul 23 2012, 16:48
Пост
#10
|
Мега ранчер Група: Trusted Members Повідомлень: 1 287 З нами з: 3-September 10 Користувач №: 1 476 Стать: Чол |
Интересный проект вырисовывается. Сделаем проектом месяца для суперкомпьютера?
|
Death |
Jul 23 2012, 17:41
Пост
#11
|
<script ///> Група: Moderators Повідомлень: 6 371 З нами з: 5-November 03 З: Kyiv Користувач №: 26 Стать: НеСкажу Free-DC_CPID Парк машин: гидропарк jabber:deadjdona@gmail.com |
я абортнул 1500 вушек.
Computing status Work # Tasks ready to send 1,096 Tasks in progress 35,264 врядли что-то будет свободно завтра -------------------- |
Rilian |
Jul 23 2012, 17:55
Пост
#12
|
interstellar Група: Team member Повідомлень: 17 049 З нами з: 22-February 06 З: Торонто Користувач №: 184 Стать: НеСкажу Free-DC_CPID Парк машин: ноут и кусок сервера |
если бы в нем были таски то можно было бы.
а так он больше смахивает пока что на тестовый проект -------------------- |
Rilian |
Jul 24 2012, 11:10
Пост
#13
|
interstellar Група: Team member Повідомлень: 17 049 З нами з: 22-February 06 З: Торонто Користувач №: 184 Стать: НеСкажу Free-DC_CPID Парк машин: ноут и кусок сервера |
Переподключите проект!!
Update Hi everyone, We have a few updates: 1. We have regenerated our signing keys but due to a technical problem they will not be distributed automatically. Please detach and reattach to the project in order to receive new workunits. We apologise for the inconvenience and will ensure that it does not happen again. 2. We are having issues with a small percentage (less than 1%) of Windows computers and a very small percentage of Linux computers. We are working to release new app versions in order to address these problems. 3. We have limited the number of tasks in progress per computer to 20 per CPU core. Although this has not been an issue for some, we have had a large number of aborted tasks as a result of sending too much work to each node. Thanks for your your help. Kevin 23 Jul 2012 -------------------- |
Rilian |
Jul 24 2012, 17:03
Пост
#14
|
interstellar Група: Team member Повідомлень: 17 049 З нами з: 22-February 06 З: Торонто Користувач №: 184 Стать: НеСкажу Free-DC_CPID Парк машин: ноут и кусок сервера |
Computing status
Work # Tasks ready to send 15,538 Tasks in progress 27,481 -------------------- |
Bel |
Jul 27 2012, 13:12
Пост
#15
|
Мега ранчер Група: Trusted Members Повідомлень: 1 287 З нами з: 3-September 10 Користувач №: 1 476 Стать: Чол |
Launching on 30th July
We are still doing a few final tests of the BOINC server. Then on 30th July we plan to officially launch the project. Thanks to those who have already signed up! We're able to do over 30,000 docking calculations per day, so testing is going well. |
Lo-Fi Версія | Поточний час: 19th October 2024 - 19:33 |