Help Conquer Cancer, исследование структуры белков в раковых клетках Налаштування

[Rilian]

Читайте статьи о проекте на нашем сайте:
* Официальная статистика
* FAQ по проекту help conquer cancer
* Help Conquer Cancer
* Help Conquer Cancer - результаты проекта, январь 2008
* Help Conquer Cancer - результаты проекта, май 2008 (в переводе) :onpc:
* Help Conquer Cancer - результаты проекта, октябрь 2008 (в переводе) :onpc:
* Сайт Института Рака в Онтарио

Как присоединиться читайте в главном топике World Community Grid

WCG запускает новый проект "Помоги Победить Рак", занимающийся улучшением результатов исследований белков методом рентгеновской кристаллографии. Это поможет не только записать части протеономы человека, но и улучшает понимание возникновения, развития и методы борьбы с раком. Проект спонсирует Институт Рака в Онтарио, Канада. Перейти на официальную страницу



Если Вы желаете помочь ученым в понимании такой сложной, многогранной и беспощадной болезни как Рак — присоединяйтесь к проекту распределенных вычислений "Help Conquer Cancer" (Помоги Победить Рак) основанный учеными из "Ontario Cancer Institute (OCI)" (Институт Рака в Онтарио), "Princess Margaret Hospital" (Госпиталь Принцессы Маргарет» и "University Health Network" (Университетская Сеть Здоровья).
Смысл помощи в том, чтобы предоставить ученым неиспользованное процессорное время вашего ПК для анализа фотографий белков сделанных методом "X-ray Crystallography" (Рентген кристаллография) с целью определения структуры этих белков и в дальнейшем понимания их роли в инициировании, течении и лечении Рака.

Миссия
Миссия проекта ПОМОГИ ПОБЕДИТЬ РАК состоит в том, чтобы улучшить результаты рентгеновской кристаллографии, которая помогает исследователям не только описать неизвестные структуры протеономы человека, но и большим образом понять как образуется рак, как он развивается, и как на него можно повлиять.

Важность проекта
Для того чтобы существенным образом повлиять на понимание рака и на его лечение, нужно не только открыть новые терапевтические подходы нацеленные на исследование метастаз (процесс распространения рака на другие органы тела), но и найти некие маркеры или структурные метки, с помощью которых можно было бы провести раннюю диагностику

Во время изучения многих форм рака, исследователи смогли сделать некоторые открытия даже имея ограниченное представление об участвующих в образовании рака белках. Однако, чтобы глубже понять и найти более эффективные способы лечения, необходимо исследовать все вовлеченные в процесс белки, их структуру и функции, чем и занимается данный проект. В основном это белки, характерные для раковых клеток, а также белки которые в них подавляются. Также исследуются белки которые были модифицированы и изменили свою структуру под воздействием рака.

С помощью рентгеновской кристаллографии исследователи смогут получить более точные данные о структуре этих белков. Это должно привести к более глубокому пониманию функций ракообразующих белков, и позволит найти потенциальные лекарства от смертельной болезни.

С начала проекта обрабатывалось 85 млн изображений.
По данным на 30 июня 2010, в данной фазе проекта обрабатывается более 115 млн изображений, каждое из них - на 2 разных компьютерах. Итого в проекте - 230 млн заданий.
По уточненным данным на 20 октября 2010, в данной фазе проекта обрабатывается более 105 млн изображений, каждое из них - на 2 разных компьютерах. Итого в проекте - 210 млн заданий.

Более 560 (на 1 января 2011) человек из украинской команды распределенных вычислений отдают свободные мощности своих компьютеров на эти исследования.

(Show/Hide)

Help Conquer Cancer project announcement:

World Community Grid takes great pleasure in announcing its newest research project: Help Conquer Cancer, sponsored by the Ontario Cancer Institute in Canada. The mission of Help Conquer Cancer is to improve the results of protein X-ray crystallography, which helps researchers not only annotate parts of the human proteome, but importantly improves their understanding of cancer initiation, progression, and treatment. For more information about this research project, click here. For additional announcement information about this project, please click here.

Help Conquer Cancer runs only on the BOINC client. For more information about BOINC see the last article in this newsletter.

Other Research Projects:

The Help Conquer Cancer project is the fifth research project that is currently active on World Community Grid. The other four projects include: Human Proteome Folding - Phase II, FightAIDS@Home, Discovering Dengue Drugs - Together, and AfricanClimate@Home. We hope that you are participating in one or more of these projects. For more information about all five projects, please click here.

Time to Go BOINC!

In the October 2007 newsletter, World Community Grid announced that it was migrating entirely to BOINC (Berkeley Open Infrastructure for Network Computing), a software platform for volunteer computing and desktop grid computing. The move is being made to provide a better experience for all our members.

This is a reminder to all users of the United Devices client that you must migrate to the BOINC client before it sunsets in 2008 by visiting the website and downloading and installing the BOINC client. The BOINC installer will detect if a computer is running the UD client and if it is found, will help you uninstall it. Details on downloading and installing the BOINC agent for Windows may be found here.

To determine whether you are currently on the BOINC or UD client, double click on the World Community Grid icon in your system tray. If you are running the BOINC client, you will see "BOINC Client" at the top of the information panel. If you are running the United Devices client it will say United Devices in the lower right hand corner.

More details about the migration are available in the member news forum.

Are you active?

As we start this new project, the World Community Grid team wants to make sure that everyone who has signed up is actively contributing. To check out if you are actively contributing, sign in on the website and go to My Grid. In the middle of that page you will see a field for "Last Results Returned". If the last time you returned a result was more than 30 days ago, you are probably not active. The easiest way to become active again is to check that the software is installed and running properly.

To see if the software is installed, check for the World Community Grid logo in your system tray. Here is an example of what the logo looks like in the system tray:

Double-clicking on the logo will bring up the client. If the client does not appear to be running correctly (i.e., the numbers for Task Run Time or Elapsed Time are not increasing, examples below), please use the Contact Us feature on the bottom of most pages of the World Community Grid website, and a World Community Grid team member will help you to figure out how to become active again.

If the World Community Grid logo is not in your system tray, you will need to install the software. For instructions, click here. If you have any questions about this, please ask in the forums or send an email via Contact Us.

------------------------------

Для большей скорости (прирост 40%) используйте 64-битную ОС!

график проекта


видео о проекте


Це повідомлення відредагував Rilian: Jan 6 2011, 09:26

[netphil]

наконец догреб до 5 лимонов.....

[Arbalet]

Помогите настроить app_info для расчетов в проекте на HD 5870 двумя потоками, так чтобы не задействованные 4 из 6 ядер моего фенома считали другие проекты WCG.
Не, я то запустил двумя потоками, но остальные проекты WCG из списка заданий и диспетчера задач пропали, а считаются только HCC на двух ядрах. Как сделать так, чтобы оставшиеся не у дел ядра были тоже загружены работой на благо WCG?

[mysterix]

а как считать одновременно разные проекты (не по очереди)?

[Rilian]

а как считать одновременно разные проекты (не по очереди)?

на видяхе естественно щяс только HCC, а вообще ты можешь выбрать нужные галки проектов в дефолтном профиле или даже настроить и раздать разные профили разным компам

Arbalet, у тебя выбраны другие проекты в профиле ?

[Arbalet]

Arbalet, у тебя выбраны другие проекты в профиле ?

Конечно. До сегодняшнего дня у меня в один поток по-умолчанию считался HCC на карточке, а вдовесок крутились на остальных цпу-ядрах CEP2 и DSFL, выбранные в профиле на оф.сайте. Ну и решил посчитать в несколько потоков HCC, чтобы видяха сильно не простаивала. Зашаманил app_info с 4 потоками, но выхлоп не впечатлил, остановился на 2 потоках. Ну и тут увидел, что теперь считается только HCC на видяхе, отъедая 2 цпу-ядра и ресур карточки, а остальные 4 ядра моего фенома фактически простаивают и не заняты другими проектами WCG, как было до этого (даже из кэша пропали все загруженные задания CEP2 и DSFL).

[Володимир]

Аа - це тому що у тому ж апп_інфо треба описати всі під-проекти.
Тільки треба знати як точно називається кожен та правильне написання номеру версії і т.д.

Тобто там у тебе зараз описана аппліуха тільки HCC GPU - а треба ше додати такі самі блоки опису на інші які ти хочеш.

Вибач синтаксісу не пам’ятаю - треба буде все це на форумах перевірити.

[Arbalet]

Володимир, ты безусловно прав, спасибо!

Классно было бы выложить в отдельной теме и поддерживать в актуальном состоянии аппы для всех рабочих подпроектов WCG...

[Sonechko]

Володимир, ты безусловно прав, спасибо!

Классно было бы выложить в отдельной теме и поддерживать в актуальном состоянии аппы для всех рабочих подпроектов WCG...

Там буде 1 Ап де описані всі проекти, вони і будуть працювати. Але твій комп братиме завдання лише ті що ти відмітиш в налаштуваннях на сайті ВЦГ - профіт!)

п.с. Там ще виявляється різні апи для АМД і Інтела, тому сам жду когось толкового щоб написав такий Ап бо теж не подобається коли буль простаює при двох завданнях на відусі .

[Arbalet]

Там буде 1 Ап де описані всі проекти, вони і будуть працювати. Але твій комп братиме завдання лише ті що ти відмітиш в налаштуваннях на сайті ВЦГ - профіт!)

п.с. Там ще виявляється різні апи для АМД і Інтела, тому сам жду когось толкового щоб написав такий Ап бо теж не подобається коли буль простаює при двох завданнях на відусі .

Ага, все верно. Нашел код остальных подпроектов для апп и по твоей теме возможно что-то есть здесь: http://www.xtremesystems.org/forums/showth...-app_info-files

[Yurr]

Кто-то знает, много еще не посчитанных заданий осталось в проекте?

[Rilian]

Yurr, по графику http://i137.photobucket.com/albums/q210/Se...sPi1Project.png еще 116 дней,
при 1 060 000 тасков в день, еще примерно осталось 122 960 000 штук

[netphil]

блин если заданий для ГПУ не добавят то максимум смогу в 5 попасть....что тоже не плохо но ХОТЕЛОСЬ БЫ на 2 место....лидера нашего конечно не подвинуть....
Интерестно а на чем он считает?

как то плавно у него выходит...такое чувство что комп вообще не использует только на расчеты.

(у меня то сынуля выключит БОИНК и комп стоит день, ему в WOТ захоелось поиграть то еще что то.

[MAGADAN]

блин если заданий для ГПУ не добавят то максимум смогу в 5 попасть....что тоже не плохо но ХОТЕЛОСЬ БЫ на 2 место....лидера нашего конечно не подвинуть....
Интерестно а на чем он считает?

как то плавно у него выходит...такое чувство что комп вообще не использует только на расчеты.

(у меня то сынуля выключит БОИНК и комп стоит день, ему в WOТ захоелось поиграть то еще что то.

Не , ну где справедливость на белом свете.
Тут целый год как поровоз пыхтиш что бы милион насобирать, даже в 50 не попал еще.
А тут молодь сразу и в топ 1 хочет.

А вообще то рад. У каждого своя дорога и свои цели.
А лидер просто считает на ОЧЕНЬ БОЛЬШОМ количестве ПК. Просто насколько я понял была проведена большая работа по привлечению парка машин на расчеты под боинк ссреди большого числа пользователей.

[Володимир]

блин если заданий для ГПУ не добавят то максимум смогу в 5 попасть....что тоже не плохо но ХОТЕЛОСЬ БЫ на 2 место....лидера нашего конечно не подвинуть....
Интерестно а на чем он считает?

как то плавно у него выходит...такое чувство что комп вообще не использует только на расчеты.

(у меня то сынуля выключит БОИНК и комп стоит день, ему в WOТ захоелось поиграть то еще что то.

netphile, Алексус вже дуже довгий час (ше до того як були ГПУ завдання) рахував і витягував команду великою кількістю ЦПУ...
Я рахував цей проект дуже недовго - і як МАГАДАНЬ та інші назбирав ледве ледве Срібну планетку (ну в них вже Золота! (це за цпу-часом) і це на ЦПУ,
і от лише зовсім-зовсім недавно додав до того ГПУ - БОІНК очки воно дає багато - а от цей ЦПУ-Відповідник-Часу_обрахування (значення введене проектом - там відповідник 45ЦПУ-днів в середньому на підпроект(з 21-го) або відповідник 90 ЦПУ-днів в середньому на підпроект(золото) ) навіть на ГПУ йде з такими ж темпами як і обчислення на ЦПУ.

Почитай тут коротше теми у розділі World Community Grid і давай кранчити

[Володимир]

netphilе, друже, кинь будь-ласка app_info.xml - а то мені шось видає помилки і не дає завдань (шось там про "не знайшов файл hcckernel.cl.7.08 ...") - то тепер марную ресурси по одному завданню за умовчанням.
Я так зрозумів також шо на 64-біт застосунок (application) не паше так як на 32-бітному (i868 чи як там).

Д.Р. у мене там 7.0.28 БОІНК - може в тому запара? поміняти на 7.0.42 ?
Коротше допоможіть хлопці - заздалегідь ДЯКУЮ!