Биологический проект Налаштування

[Alien]

Как насчет сделать клиенты для громакса\намда с практическим применением в НИИ академии наук Украины?

[Alien]

Ребята, что от меня еще нужно?
Вид команды для запуска я предоставил, могу предоставить тестовый проект. Что еще?

[Rilian]

Alien, как видишь, биохимиков кроме тебя на форуме нет.

[Alien]

я так понимаю, биохим аспект здесь неважен пока...
главное технически настроить.. это уже в вашей компетенции.
ЗЫ ученые не любят ходить на форумы и общаться... но это не значит, что их нет )

[Rilian]

ну мы настроим и получим еще один gerasim@home (который завис в состоянии "сервер поднят, что считать?")

[Alien]

неправильная позиция..
если ты ждешь что сначала люди появятся, то ты ошибаешься..
Во-первых они есть, во-вторых, если речь о биологах\химиках, то они будут активны лишь когда будет все готово и автоматизировано.

Желающих ставить задачи огромное количество, еще меньше образованы в этой сфере (ИТ) и единицы работают без автоматизации.
Если говорить про молекулярную динамику и громакс, то мы автоматизировали процесс, но сейчас работаем над методологией, чтоб потом обучать людей далеких от информатики или прикладных пакетов.

Если мы хотим развивать украинский проект для биологов, нужно сделать базу и не боятся что на первых порах будет мало желающих. По мере образования их будет больше. И чем легче будет процедура, тем больше будет тех, кто будет заинтересован.

Если хотите заморозить до ближайшего будущего, ок.
Лично для меня это некритично, но вы противоречите себе.
Моя цель лишь помочь вам в вашем развитии, чем смогу, со своей стороны, а могу немалое.

[Rilian]

О

читаю RNA World FAQ:

Can I as a scientist submit tasks to RNA World?

Hopefully soon. We are working on implementing user job submission interfaces for each of the various RNA World applications. However, you will have to register and receive a digital certificate such that jobs submitted to our system are clearly correlated to an individual known to us.

Скоро можно будет сабмитить свои белки

Кстати сегодня видел в кэше задания с tRNA

[Alien]

я видел в топике по РНК, что у них бесплатные сорсы.. было бы интересно протестировать.

Отлично, мы как раз с транспортной РНК и работаем!

Держи нас в курсе.

[Rilian]

Alien, кстати в Hydrogen@home можно сабмитить работу на Autodock

теоретически также в DrugDiscovery@home. А там одним из кураторов проекта является Андрей Воронков из МГУ

[Alien]

Rilian или кто-то из ребят, когда вы будете свободны, чтоб попробовать поставить задачу через WCG?
Мне наверное нужно получить аккаунт? Чтоб я не тратил и без того малое время, прошу помощи, чтоб разобраться в этой системе..

У меня есть международный сертификат (X509), он может быть им необходим, для идентификации моей личности.

[Rilian]

Alien, хорошо! давай начнем пробовать со следующей недели. Щяс немного занят, и еще уезжаю оффлайн на неск дней.

[Alien]

Такс, ребята..
Я уже зарегистрировался на международную конференцию, которая будет проходить в Киеве

МІНІСТЕРСТВО ОХОРОНИ ЗДОРОВ'Я УКРАЇНИ
ПЕРШИЙ З'ЇЗД ”МЕДИЧНА ТА БІОЛОГІЧНА ІНФОРМАТИКА І КІБЕРНЕТИКА”
http://www.inmeds.com.ua/content/conference/conf_2010.php

Тематика моего выступления будет по направлению ускорения процессов расчета молекулярной динамики на базе нашей виртуальной лаборатории MolDynGrid.
Если хотите, чтоб в докладе прозвучали и вы, а так же, чтоб были напечатаны в тезисах конференции, то стоит поторопиться.
Остался где-то месяц, а нам нужно настроить наш био-проект.
Пока я ориентируюсь на академический грид.
У кого есть хорошие знания линукса, С и CUDA - велкам! Попробуем настроить плагин к громаксу.

[Death]

Rilian, а видел на вцг ссылку "отправить свой проект"?

может Элиена заинтересует.

[Alien]

я не видел, покажи плиз.

[Rilian]

я не видел, покажи плиз.

имеется ввиду http://www.worldcommunitygrid.org/research...mitAProposal.do

[Alien]

почитал...
идеально подходит
Genomics and disease - functions of proteins that are coded by human genes and how they might relate to cures for common diseases
но регламент у них конечно непростой..

как там успехи по направлению своего проекта?