Poem@home, Моделирование структуры белка |
Привіт Гість ( Вхід | Реєстрація )
Poem@home, Моделирование структуры белка |
nikelong |
Dec 25 2007, 18:59
Пост
#1
|
Тера ранчер Група: Trusted Members Повідомлень: 11 909 З нами з: 19-March 05 Користувач №: 92 Стать: Чол |
Проект "Poem@home" ---------------------------------------------------------------------------------------------------------- Официальный сайт Статистика по команде "Ukraine" Статистика на фришниках Статистика на фришниках по команде "Ukraine" ТОП-20 участников: ---------------------------------------------------------------------------------------------------------- Дата основания команды - 22.10.2007 Капитан - uNiUs ---------------------------------------------------------------------------------------------------------- Для присоединения к команде Украины: 1. Загрузите BOINC менеджер (Если его у Вас еще нет!) 2. Перейдите в "расширенный вид" 3. Выберите сервис ---> добавить проект 4. Введите адрес проекта http://boinc.fzk.de/poem/ 5. Введите свои регистрационные данные. 6. Найдите нашу команду. Она называется Ukraine и адрес ее статистики вы могли видеть выше. 7. Если есть доступные для загрузки задания Вы их получите и начнете расчеты. ---------------------------------------------------------------------------------------------------------- Полезная информация: Для идентификации пользователя в BOINC могут служить 2 вещи: 1) пара e-mail/пароль 2) межпроектный идентификационный ID (Cross-project ID) - 32значное шестнадцатиричное число. Если Вы пожелаете подключится ещё и к другому BOINC-проекту, то помните: чтобы не плодить новых аккаунтов при подключении к новому проекту или команде, нужно обязательно везде регистрироваться с одним и тем же e-mail/паролем либо CPID. если при регистрации в проекте указать другие e-mail или пароль, BOINC создаст новый аккаунт с тем же именем! ---------------------------------------------------------------------------------------------------------- Описание проекта: Моделирование струтуры белка, используется модифицированный метод молекулярной динамики с помощью стохастической оптимизации. Проект занимается поиском молекул, которые могут заблокировать хемокины (хемотаксические цитокины), что даст возможность блокировать различные процессы в организме на уровне клеточных рецепторов, например, остановить воспалительный процесс. Ведется совместная работа с проектами, посвященными малярии, онкологии, болезни Алцгеймера. В будущем планируется разработать метод моделирования белковых молекул, которые уже могут использовать фармацевты, врачи, ученые, а также детально изучить структуру мебранных белков. Вопрос: "Действительно ли поект POEM@Home отличается от других проектов, изучающих белки?" (Show/Hide) Вопрос: "Сворачивая новую последовательность, как ваш метод будет моделировать действие компаньонок (не нашел другого значения слова chperones) ? Вы участвовали в каком-нибудь недавнем соревновании CASP?" (Show/Hide) Вопрос: Мы хотели бы знать о болезнях, которые Poem@Home мог помочь лечить? (Show/Hide) Вопрос: Что Вы можете сказать на утверждение доктора Бейкера: Розетта использует физически детальную модель всего атома, и была бесспорно лучшим методом до настоящего времени для новых всерток, а также для того, чтобы проектировать новые белки. (Show/Hide) Ссылки по теме:График ППД команды за последние 60 дней: (Show/Hide) http://www.boinc-af.org/content/view/806/219/ http://www.dp.by/wiki/Projects/Poemathome http://wiki.bc-team.org/index.php?title=POEM%40home/en http://www.irelandboinc.com/projects/40-pr...ts/102-poemhome Це повідомлення відредагував x3mEn: May 23 2012, 21:17 |
Sonechko |
May 25 2012, 23:39
Пост
#151
|
кранчер зі стажем Група: Trusted Members Повідомлень: 311 З нами з: 27-June 08 З: Київ Користувач №: 768 Стать: НеСкажу Парк машин: Ryzen 1700X 3.6GHz, 32G RAM, MSI Gaming 2xRX480 4G |
розкажіть що і як записати, щоб було 2-3 завдання одночасно.
у мене файла app_data немає взагалі щось, в чому можуть бути граблі? може переінсталити треба боінк? я просто 7-у версію поверх 6-ї накатив і все. -------------------- ______
|
KING100N |
May 26 2012, 05:09
Пост
#152
|
кранчер з фермою Група: Trusted Members Повідомлень: 747 З нами з: 17-October 08 Користувач №: 847 Стать: Чол |
розкажіть що і як записати, щоб було 2-3 завдання одночасно. у мене файла app_data немає взагалі щось, в чому можуть бути граблі? може переінсталити треба боінк? я просто 7-у версію поверх 6-ї накатив і все. Создаешь новый файл .txt, копируешь в него текст из этой темы, переименовываешь файл в app_info.xml, кидаешь его в папку проекта -------------------- |
netphil |
May 29 2012, 17:58
Пост
#153
|
kранчер Група: Trusted Members Повідомлень: 110 З нами з: 7-April 12 Користувач №: 2 992 Стать: Чол |
ура я вошел в 100 (на 70 месте) по результатам на каждого пользователя...
http://boinc.fzk.de/poem/top_users.php?sor...redit&offset=60 и на 15 по Recent average credit Смотрю на первых местах у товарищей фермы с несколькими картами АТИ....вот нам в команду таких пару человек и мы бы в лидеры прорвались. А так только 3 человека реально считатют... |
Володимир |
May 31 2012, 13:07
Пост
#154
|
кранчер з фермою Група: Trusted Members Повідомлень: 659 З нами з: 29-June 11 З: Хмельницький 2016 (Khmelnytsky) Користувач №: 1 830 Стать: Чол Free-DC_CPID Парк машин: i5-4200M @ 2.50GHz |
Привіт netphil,
Слухай, ти розігнав цпу так позавчора??? Яка частота? Ніфіга собі ти шпариш Це у тебе зараз 4 чи 5 завдань одночасно? Я зараз вижимаю скільки можу - але нас майже обігнали TeAM AnandTech Але вони зараз рахують тимчасово в цьому проекті ( на форумі так пишуть). Так шо нам треба тільки трошки так протриматися. -------------------- |
netphil |
May 31 2012, 17:35
Пост
#155
|
kранчер Група: Trusted Members Повідомлень: 110 З нами з: 7-April 12 Користувач №: 2 992 Стать: Чол |
Володимир,
Привет. нет поменял свой и5-2500К (разогнаный на 4600мгц) на и7-2600К (пока неразгонял) да уже вышел по 375 000 в сутки. неплохо. посмотрел по другим командам то максимум 1 200 000 в сутки. но там у товарища 7 ПК с АТИ картами. думаю может прошить карту в 5870 и разблокировать шейдеры до 1600 и частоты поднять с 775мгц до 800-850мгц(хотя бы днем, а то турббина будет выть).сейчас карта прогревается до 66гр при турбине в1937оборотов. на этой карте больше не вытяну - уже 94-95% загрузка. |
KING100N |
May 31 2012, 18:58
Пост
#156
|
кранчер з фермою Група: Trusted Members Повідомлень: 747 З нами з: 17-October 08 Користувач №: 847 Стать: Чол |
netphil,
кроме Poem компьютер больше ничего не считает? проц свободен? Увеличение частоты ГПУ приводит к уменьшению его загрузки и наоборот - можно побаловаться даунклокингом, если не считать по 5 заданий одновременно -------------------- |
Володимир |
May 31 2012, 19:14
Пост
#157
|
кранчер з фермою Група: Trusted Members Повідомлень: 659 З нами з: 29-June 11 З: Хмельницький 2016 (Khmelnytsky) Користувач №: 1 830 Стать: Чол Free-DC_CPID Парк машин: i5-4200M @ 2.50GHz |
коли рахуєш 4 і більше завдань ПОЕМ проц ніяк не вільний. разом із ним майже нічого більше не можна рахувати - продуктивність падає так шо так не варто рахувати. То або ПОЕМ на всю катушку або шось інше.
Нетфіл видусив із своєї карточки більше пів-мільйона очків у день, до-речі Я пробував знижувати частоту невеликими кроками (поки не дойшов до точки коли система зависала), і це або не давао різниці, або трохи зменшувало продуктивність. А от розгін карточки до максимуму (до зависання системи) дає десь 10%-15% прибавки у цьому проекті на моїй 7870. Забув - ше у нетфіла навантаження картки десь 94-95% - там більше завдань одночасно вже нічого не дасть. -------------------- |
netphil |
May 31 2012, 21:05
Пост
#158
|
kранчер Група: Trusted Members Повідомлень: 110 З нами з: 7-April 12 Користувач №: 2 992 Стать: Чол |
KING100N,
нет больше ничего не считает. Только ПОЕМ. проц в номинале равномерно згружен все 8 потоков на около 30% считаю сразу 4 задания на ГПУ. на проце не считаю т.к. особого смысла пока не вижу...или может за проц дают больше очков? хотя врядли, когда начинал то сичтал и процем так разница по очкам с ГПУ была в 5-10раз! потому и от проца оказался. Думаю летом обзавестись 7970 или 6970...посмотрим. |
Sonechko |
May 31 2012, 21:47
Пост
#159
|
кранчер зі стажем Група: Trusted Members Повідомлень: 311 З нами з: 27-June 08 З: Київ Користувач №: 768 Стать: НеСкажу Парк машин: Ryzen 1700X 3.6GHz, 32G RAM, MSI Gaming 2xRX480 4G |
Пора вже у сторону 7990 дивитись, скоро з'являться нові лідери кранчингу)
-------------------- ______
|
netphil |
May 31 2012, 22:19
Пост
#160
|
kранчер Група: Trusted Members Повідомлень: 110 З нами з: 7-April 12 Користувач №: 2 992 Стать: Чол |
Sonechko,
неа за 1000баксов я манал покупать для кранчингу....оно нафиг не нужно. а игрушек с такими требованиями еще года 2-3 не будет. Для кранча можно пару б\у карточек 5800/6900 серий взять за 150-250баксов.каждая и порвать многих лидеров....но это на любителя. я в игрушки не играю почти, а для Цивилизации 5 мне и этой карточки хватает. |
Володимир |
Jun 6 2012, 15:55
Пост
#161
|
кранчер з фермою Група: Trusted Members Повідомлень: 659 З нами з: 29-June 11 З: Хмельницький 2016 (Khmelnytsky) Користувач №: 1 830 Стать: Чол Free-DC_CPID Парк машин: i5-4200M @ 2.50GHz |
Агов , netphil,
шось тебе вже третій день у проекті не видко, шось сталося? Я знов почну активно проект обчислювати після СІМАПу -------------------- |
Володимир |
Jun 8 2012, 18:51
Пост
#162
|
кранчер з фермою Група: Trusted Members Повідомлень: 659 З нами з: 29-June 11 З: Хмельницький 2016 (Khmelnytsky) Користувач №: 1 830 Стать: Чол Free-DC_CPID Парк машин: i5-4200M @ 2.50GHz |
Ну шо. Закінчив всі завдання СІМАПу, і вже повернувся сюди із повною силою (для мене це 375тис/добу щонайбільше )
netphil, сподіваюся шо ти випадково не спалив картку, намагаючись розігнати (тфу тфу тфу). Кинь дві слові, і повертайся в проект ! -------------------- |
netphil |
Jun 9 2012, 19:30
Пост
#163
|
kранчер Група: Trusted Members Повідомлень: 110 З нами з: 7-April 12 Користувач №: 2 992 Стать: Чол |
Привет. не все гуд просто ОС переставлял и порядок наводил скоро присоеденюсь...а вы пока догоняйте
|
netphil |
Jun 9 2012, 21:57
Пост
#164
|
kранчер Група: Trusted Members Повідомлень: 110 З нами з: 7-April 12 Користувач №: 2 992 Стать: Чол |
Чего то проблемы после переустановки ОС.
А именно: без файла app_info считает только одно задание. А при подкидывание файла в папку с проектом..БОИНК пишет: Notice: File referenced in app_info.xml does not exist: poemcl_0.1_windows_intelx86_opencl_ati_100 Вот сам файл: <app_info> <app> <name>poemcl</name> <user_friendly_name>POEM++ OpenCL</user_friendly_name> </app> <file_info> <name>poemcl_0.1_windows_intelx86__opencl_ati_100</name> <executable/> </file_info> <app_version> <app_name>poemcl</app_name> <version_num>1</version_num> <flops>167186362363.818660</flops> <plan_class>opencl_ati_100</plan_class> <avg_ncpus>1</avg_ncpus> <max_ncpus>1</max_ncpus> <coproc> <type>ATI</type> <count>0.25</count> </coproc> <gpu_ram>419430400.000000</gpu_ram> <cmdline>p3</cmdline> <file_ref> <file_name>poemcl_0.1_windows_intelx86__opencl_ati_100</file_name> <main_program/> </file_ref> </app_version> </app_info> |
Rilian |
Jun 9 2012, 22:12
Пост
#165
|
interstellar Група: Team member Повідомлень: 16 930 З нами з: 22-February 06 З: Торонто Користувач №: 184 Стать: НеСкажу Free-DC_CPID Парк машин: ноут и кусок сервера |
netphil, а файл в папке проекта присутствует ?
-------------------- |
Lo-Fi Версія | Поточний час: 29th April 2024 - 11:22 |