Привіт Гість ( Вхід | Реєстрація )

> Docking@home, Изучаем механизм взаемодействия лиганда с белком
nikelong
Aug 9 2007, 21:42
Пост #1


Тера ранчер
**********

Група: Trusted Members
Повідомлень: 12 443
З нами з: 19-March 05
Користувач №: 92
Стать: Чол





Проект "Docking@home"

--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
ТОП-20 участников:



----------------------------------------------------------------------------------------------------------
Дата основания команды - 30.06.2008 Капитан - (_KoDAk_)
----------------------------------------------------------------------------------------------------------
Для присоединения к команде Украины:
1. Загрузите BOINC менеджер (Если его у Вас еще нет!)
2. Перейдите в "расширенный вид"
3. Выберите сервис ---> добавить проект
4. Введите адрес проекта http://docking.cis.udel.edu/
5. Введите свои регистрационные данные.
6. Найдите нашу команду. Она называется Ukraine и адрес ее статистики вы могли видеть выше.
7. Если есть доступные для загрузки задания Вы их получите и начнете расчеты.
----------------------------------------------------------------------------------------------------------
Полезная информация:
Для идентификации пользователя в BOINC могут служить 2 вещи:
1) пара e-mail/пароль
2) межпроектный идентификационный ID (Cross-project ID) - 32значное шестнадцатиричное число.

Если Вы пожелаете подключится ещё и к другому BOINC-проекту, то помните: чтобы не плодить новых аккаунтов при подключении к новому проекту или команде, нужно обязательно везде регистрироваться с одним и тем же e-mail/паролем либо CPID. если при регистрации в проекте указать другие e-mail или пароль, BOINC создаст новый аккаунт с тем же именем!
----------------------------------------------------------------------------------------------------------


О проекте:
Docking@home - совместный проект, который стремится решить проблемы как информатики, так и биологической науки. С точки зрения биологической науки, целью проекта является дальнейшее расширение знаний об атомных деталях взаимодействий лиганда белка и, изучая это, возможные поиски и открытие новых фармацевтических препаратов. С точки зрения информатики, этот проект стремится расширить круг добровольных вычислений, чтобы помочь адаптивному моделированию мультимасштабных приложений: различные модели, которые представляют природные явления с различным уровнем точности и требований к ресурсам, будут выбраны для выполнения, основанного на результатах, разработанных пока для характеристик комплекса лиганда белка. Docking@home вовлекает сотрудничество среди Университета Техаса - Эль-Пасо, Научно-исследовательский институт Scripps (TSRI), и Университет Калифорнии - Беркли и включен BOINC. Docking@home - часть проекта DAPLDS (или Динамически Адаптивный проект Системы Стыковки Лиганда белка) и поддержан Национальным Фондом Науки (национальный научный фонд).



Docking@Home привлекает к сотрудничеству Университет Техаса – Эль-Пасо, Научно-исследовательский институт Scripps (TSRI), и Университет Калифорнии – Беркли и использует для вычислений программное обеспечение с открытым исходным кодом – BOINC. Docking@Home – часть проекта DAPLDS (Dynamically Adaptive Protein-Ligand Docking System project или Динамически Адаптивный проект Системы Взаимодействия Белок-Лиганд) и поддержан Национальным Научным Фондом США (National Science Foundation).

График ППД команды за последние 60 дней:

(Show/Hide)



----------------------------------------------------------------------------------------------------------
Статус сервера выдачи заданий:



http://www.boinc-af.org/content/view/245/219/

http://www.dp.by/wiki/Projects/Dockingathome

http://wiki.bc-team.org/index.php?title=Docking%40home/en


http://www.polarseti.ru/page.php?23

http://distributed.ru/wiki/pro:docking

Це повідомлення відредагував nikelong: Sep 18 2010, 19:59
User is offlineProfile CardPM
Go to the top of the page
+Quote Post
6 Сторінки V < 1 2 3 4 > »   
Reply to this topicStart new topic
Відповідей(15 - 29)
(_KoDAk_)
Nov 2 2008, 07:41
Пост #16


BOINC-guru
*********

Група: Moderators
Повідомлень: 3 714
З нами з: 11-August 07
З: Kharkov
Користувач №: 569
Стать: Чол
Парк машин:
E3-1245V2@3400-Mhz 16GB 1х GTX760DCMOC2GD5 Q8200@2300-Mhz 4GB + то там то сям



5,832.75 33.80 33.80
+ поправил шапку команды )


--------------------
- "ты говоришь так, будто тебя чай ваше не вставляет "

(Show/Hide)











Спаcибо автору алфавита за любезно предоставленные буквы.
User is offlineProfile CardPM
Go to the top of the page
+Quote Post
T0lsty
Nov 4 2008, 10:00
Пост #17


кранчер з фермою
*******

Група: Trusted Members
Повідомлень: 990
З нами з: 13-October 06
Користувач №: 296
Стать: Чол



Results ready to send: 0


--------------------
..................
XtremeLabs.org

(Show/Hide)


User is offlineProfile CardPM
Go to the top of the page
+Quote Post
(_KoDAk_)
Nov 5 2008, 00:56
Пост #18


BOINC-guru
*********

Група: Moderators
Повідомлень: 3 714
З нами з: 11-August 07
З: Kharkov
Користувач №: 569
Стать: Чол
Парк машин:
E3-1245V2@3400-Mhz 16GB 1х GTX760DCMOC2GD5 Q8200@2300-Mhz 4GB + то там то сям



QUOTE(T0lsty @ Nov 4 2008, 10:00) *

Results ready to send: 0

ну єто может и клучшему


--------------------
- "ты говоришь так, будто тебя чай ваше не вставляет "

(Show/Hide)











Спаcибо автору алфавита за любезно предоставленные буквы.
User is offlineProfile CardPM
Go to the top of the page
+Quote Post
(_KoDAk_)
Nov 5 2008, 09:09
Пост #19


BOINC-guru
*********

Група: Moderators
Повідомлень: 3 714
З нами з: 11-August 07
З: Kharkov
Користувач №: 569
Стать: Чол
Парк машин:
E3-1245V2@3400-Mhz 16GB 1х GTX760DCMOC2GD5 Q8200@2300-Mhz 4GB + то там то сям



November 04, 2008 15:38 UTC
We are having some problems with the work generation. The workunit distribution will start and stop frequently during the next couple of hours

November 03, 2008 13:38 UTC
Due to your great support crunching about 600 000 HIV workunits, today we start a new phase of Docking@Home with the distribution of Trypsin. We did extensive testing before submiting this new protein but we may have some problems due to the new files distributed.

в общем как всегда пару часов (превращаются в пару дней) отсутствия заданий )


--------------------
- "ты говоришь так, будто тебя чай ваше не вставляет "

(Show/Hide)











Спаcибо автору алфавита за любезно предоставленные буквы.
User is offlineProfile CardPM
Go to the top of the page
+Quote Post
(_KoDAk_)
Nov 5 2008, 19:38
Пост #20


BOINC-guru
*********

Група: Moderators
Повідомлень: 3 714
З нами з: 11-August 07
З: Kharkov
Користувач №: 569
Стать: Чол
Парк машин:
E3-1245V2@3400-Mhz 16GB 1х GTX760DCMOC2GD5 Q8200@2300-Mhz 4GB + то там то сям



и появились новые задания ...


--------------------
- "ты говоришь так, будто тебя чай ваше не вставляет "

(Show/Hide)











Спаcибо автору алфавита за любезно предоставленные буквы.
User is offlineProfile CardPM
Go to the top of the page
+Quote Post
Rilian
Jan 9 2009, 20:43
Пост #21


interstellar
**********

Група: Team member
Повідомлень: 17 342
З нами з: 22-February 06
З: Торонто
Користувач №: 184
Стать: НеСкажу
Free-DC_CPID
Парк машин:
ноут и кусок сервера



В понедельник 12 января будет обновлен софт на сервере, и сайт проекта не будет работать с 5 до 11 вечера по восточному тихоокеанскому времени (то есть я так понимаю у нас это с около полуночи 12 января до 10 утра 13 января)

QUOTE
We will upgrade the Web page next Monday January 12th and it may be down from 5 to 11 PM EST


--------------------
(Show/Hide)

Миссия проекта Help Fight Childhood Cancer (Помоги Победить Детский Рак) - подобрать белки, блокирующие некоторые виды рака. Подключайтесь!
IPB Image
IPB Image

IPB Image

IPB Image
IPB Image

общая статистика: BOINCstats * FreeDC команда: BOINC команда Ukraine

IPB Image
User is offlineProfile CardPM
Go to the top of the page
+Quote Post
Некто
Jan 14 2009, 07:23
Пост #22


кранчер з фермою
*******

Група: Trusted Members
Повідомлень: 767
З нами з: 16-May 08
З: Київ
Користувач №: 745
Стать: Чол
Парк машин:
Q6600 @ 2600 MHz



у них новый сайтег smile.gif


--------------------

User is offlineProfile CardPM
Go to the top of the page
+Quote Post
Rilian
Jan 14 2009, 22:41
Пост #23


interstellar
**********

Група: Team member
Повідомлень: 17 342
З нами з: 22-February 06
З: Торонто
Користувач №: 184
Стать: НеСкажу
Free-DC_CPID
Парк машин:
ноут и кусок сервера



Почитал их сайт

Вобщем докинг это то же самое что розетта, тока для двух белков - рассчитывается их взаимодействие между собой


--------------------
(Show/Hide)

Миссия проекта Help Fight Childhood Cancer (Помоги Победить Детский Рак) - подобрать белки, блокирующие некоторые виды рака. Подключайтесь!
IPB Image
IPB Image

IPB Image

IPB Image
IPB Image

общая статистика: BOINCstats * FreeDC команда: BOINC команда Ukraine

IPB Image
User is offlineProfile CardPM
Go to the top of the page
+Quote Post
Rilian
Jan 18 2009, 17:03
Пост #24


interstellar
**********

Група: Team member
Повідомлень: 17 342
З нами з: 22-February 06
З: Торонто
Користувач №: 184
Стать: НеСкажу
Free-DC_CPID
Парк машин:
ноут и кусок сервера



И, как бе, да, Docking работает на программе CHARMM (лучшая на сегодня система моделирования взаимодействия белков), которая также используется для рассчетов в проекте FightAIDS@home

то есть считая этот проект вы косвенно помогаете тестировать все проекты которые рассчитывают взаимодействия белков


--------------------
(Show/Hide)

Миссия проекта Help Fight Childhood Cancer (Помоги Победить Детский Рак) - подобрать белки, блокирующие некоторые виды рака. Подключайтесь!
IPB Image
IPB Image

IPB Image

IPB Image
IPB Image

общая статистика: BOINCstats * FreeDC команда: BOINC команда Ukraine

IPB Image
User is offlineProfile CardPM
Go to the top of the page
+Quote Post
Некто
Jan 20 2009, 23:11
Пост #25


кранчер з фермою
*******

Група: Trusted Members
Повідомлень: 767
З нами з: 16-May 08
З: Київ
Користувач №: 745
Стать: Чол
Парк машин:
Q6600 @ 2600 MHz



New protein
January 20, 2009 17:36 UTC

Tomorrow, Jan 21, we will start docking a new protein. P38alpha, also known as SAPK2a and MAPK14, is involved in the regulation of cellular stress responses as well as the control of proliferation and survival of many cell types. Several promising compounds that inhibit p38 alpha are being investigated as potential therapies for arthritic and inflammatory diseases, more info here. This protein seems to be more stable than Trypsin, and we can expect longer workunits. Please also expect minor problems during the transition phase. Thank you
Slow WUs Generator
January 20, 2009 01:41 UTC

The work-unit generator seems not able to keep up the pace with your requests for jobs. We are working on this issue and we will keep you posted.


--------------------

User is offlineProfile CardPM
Go to the top of the page
+Quote Post
Rilian
Jan 27 2009, 19:07
Пост #26


interstellar
**********

Група: Team member
Повідомлень: 17 342
З нами з: 22-February 06
З: Торонто
Користувач №: 184
Стать: НеСкажу
Free-DC_CPID
Парк машин:
ноут и кусок сервера



Вот как примерно віглядит белок которій считается в проекте Docking@home

IPB Image

его можно крутить, приближать, отдалять итд look.gif


--------------------
(Show/Hide)

Миссия проекта Help Fight Childhood Cancer (Помоги Победить Детский Рак) - подобрать белки, блокирующие некоторые виды рака. Подключайтесь!
IPB Image
IPB Image

IPB Image

IPB Image
IPB Image

общая статистика: BOINCstats * FreeDC команда: BOINC команда Ukraine

IPB Image
User is offlineProfile CardPM
Go to the top of the page
+Quote Post
Rilian
Feb 2 2009, 11:37
Пост #27


interstellar
**********

Група: Team member
Повідомлень: 17 342
З нами з: 22-February 06
З: Торонто
Користувач №: 184
Стать: НеСкажу
Free-DC_CPID
Парк машин:
ноут и кусок сервера



Dear rilian,

The Docking@Home team is pleased to release the third Docking@Home newsletter to our volunteers. You can download the newsletter at:

http://docking.cis.udel.edu/about/project/...sletter_nr3.pdf

Enjoy the reading!

Michela rtfm.gif


--------------------
(Show/Hide)

Миссия проекта Help Fight Childhood Cancer (Помоги Победить Детский Рак) - подобрать белки, блокирующие некоторые виды рака. Подключайтесь!
IPB Image
IPB Image

IPB Image

IPB Image
IPB Image

общая статистика: BOINCstats * FreeDC команда: BOINC команда Ukraine

IPB Image
User is offlineProfile CardPM
Go to the top of the page
+Quote Post
Death
Feb 6 2009, 22:20
Пост #28


<script ///>
**********

Група: Moderators
Повідомлень: 6 428
З нами з: 5-November 03
З: Kyiv
Користувач №: 26
Стать: НеСкажу
Free-DC_CPID
Парк машин:
гидропарк
jabber:deadjdona@gmail.com



в шапке такой же адрес как и для тестового проекта.
если это основной, то какой же тогда у теста????


--------------------
wbr, Me. Dead J. Dona OGR-27
User is offlineProfile CardPM
Go to the top of the page
+Quote Post
Rilian
Feb 7 2009, 10:18
Пост #29


interstellar
**********

Група: Team member
Повідомлень: 17 342
З нами з: 22-February 06
З: Торонто
Користувач №: 184
Стать: НеСкажу
Free-DC_CPID
Парк машин:
ноут и кусок сервера



нет у тестового свой адрес


--------------------
(Show/Hide)

Миссия проекта Help Fight Childhood Cancer (Помоги Победить Детский Рак) - подобрать белки, блокирующие некоторые виды рака. Подключайтесь!
IPB Image
IPB Image

IPB Image

IPB Image
IPB Image

общая статистика: BOINCstats * FreeDC команда: BOINC команда Ukraine

IPB Image
User is offlineProfile CardPM
Go to the top of the page
+Quote Post
Death
Feb 7 2009, 13:45
Пост #30


<script ///>
**********

Група: Moderators
Повідомлень: 6 428
З нами з: 5-November 03
З: Kyiv
Користувач №: 26
Стать: НеСкажу
Free-DC_CPID
Парк машин:
гидропарк
jabber:deadjdona@gmail.com



http://docktest.cis.udel.edu/ это тест - аккаунті не создаются
http://docking.cis.udel.edu/ это основной - можно щитать.

препутал вечером с устатку....



--------------------
wbr, Me. Dead J. Dona OGR-27
User is offlineProfile CardPM
Go to the top of the page
+Quote Post

6 Сторінки V < 1 2 3 4 > » 
Reply to this topicStart new topic
1 Користувачів переглядають дану тему (1 Гостей і 0 Прихованих Користувачів)
0 Користувачів:

 



- Lo-Fi Версія Поточний час: 24th October 2021 - 15:32

Invision Power Board v1.3.3 © 1996 IPS, Inc.