Poem@home, Моделирование структуры белка |
Привіт Гість ( Вхід | Реєстрація )
Poem@home, Моделирование структуры белка |
nikelong |
Dec 25 2007, 18:59
Пост
#1
|
Тера ранчер Група: Trusted Members Повідомлень: 11 909 З нами з: 19-March 05 Користувач №: 92 Стать: Чол |
Проект "Poem@home" ---------------------------------------------------------------------------------------------------------- Официальный сайт Статистика по команде "Ukraine" Статистика на фришниках Статистика на фришниках по команде "Ukraine" ТОП-20 участников: ---------------------------------------------------------------------------------------------------------- Дата основания команды - 22.10.2007 Капитан - uNiUs ---------------------------------------------------------------------------------------------------------- Для присоединения к команде Украины: 1. Загрузите BOINC менеджер (Если его у Вас еще нет!) 2. Перейдите в "расширенный вид" 3. Выберите сервис ---> добавить проект 4. Введите адрес проекта http://boinc.fzk.de/poem/ 5. Введите свои регистрационные данные. 6. Найдите нашу команду. Она называется Ukraine и адрес ее статистики вы могли видеть выше. 7. Если есть доступные для загрузки задания Вы их получите и начнете расчеты. ---------------------------------------------------------------------------------------------------------- Полезная информация: Для идентификации пользователя в BOINC могут служить 2 вещи: 1) пара e-mail/пароль 2) межпроектный идентификационный ID (Cross-project ID) - 32значное шестнадцатиричное число. Если Вы пожелаете подключится ещё и к другому BOINC-проекту, то помните: чтобы не плодить новых аккаунтов при подключении к новому проекту или команде, нужно обязательно везде регистрироваться с одним и тем же e-mail/паролем либо CPID. если при регистрации в проекте указать другие e-mail или пароль, BOINC создаст новый аккаунт с тем же именем! ---------------------------------------------------------------------------------------------------------- Описание проекта: Моделирование струтуры белка, используется модифицированный метод молекулярной динамики с помощью стохастической оптимизации. Проект занимается поиском молекул, которые могут заблокировать хемокины (хемотаксические цитокины), что даст возможность блокировать различные процессы в организме на уровне клеточных рецепторов, например, остановить воспалительный процесс. Ведется совместная работа с проектами, посвященными малярии, онкологии, болезни Алцгеймера. В будущем планируется разработать метод моделирования белковых молекул, которые уже могут использовать фармацевты, врачи, ученые, а также детально изучить структуру мебранных белков. Вопрос: "Действительно ли поект POEM@Home отличается от других проектов, изучающих белки?" (Show/Hide) Вопрос: "Сворачивая новую последовательность, как ваш метод будет моделировать действие компаньонок (не нашел другого значения слова chperones) ? Вы участвовали в каком-нибудь недавнем соревновании CASP?" (Show/Hide) Вопрос: Мы хотели бы знать о болезнях, которые Poem@Home мог помочь лечить? (Show/Hide) Вопрос: Что Вы можете сказать на утверждение доктора Бейкера: Розетта использует физически детальную модель всего атома, и была бесспорно лучшим методом до настоящего времени для новых всерток, а также для того, чтобы проектировать новые белки. (Show/Hide) Ссылки по теме:График ППД команды за последние 60 дней: (Show/Hide) http://www.boinc-af.org/content/view/806/219/ http://www.dp.by/wiki/Projects/Poemathome http://wiki.bc-team.org/index.php?title=POEM%40home/en http://www.irelandboinc.com/projects/40-pr...ts/102-poemhome Це повідомлення відредагував x3mEn: May 23 2012, 21:17 |
netphil |
Aug 23 2012, 20:46
Пост
#301
|
kранчер Група: Trusted Members Повідомлень: 110 З нами з: 7-April 12 Користувач №: 2 992 Стать: Чол |
mysterix,
не не выйдет на балкон Пока поставил в 1 поток на квадре 6000 и 8 потоков на 7970... мы должны прорватся в 20....еще 10 лямов накранчить нужно не так много |
TyphooNick |
Aug 26 2012, 00:29
Пост
#302
|
кранчер зі стажем Група: Trusted Members Повідомлень: 297 З нами з: 9-October 09 Користувач №: 1 178 Стать: Чол Free-DC_CPID Парк машин: ASUS M IX Code + Core i7-7700K @ 5.00GHz + 16GB DDR4 3733MHz CL17 + Castom Liquid Cooling Pentium G2020 @ 2.90GHz |
netphil,
Давайка, выбрасывай "квадру" и займемся местом в двадцатке, а то интрига теряется. Всем. Может кто знает, сколько в Поэме можно выжать с ПЕЧи 670? -------------------- (Show/Hide) |
DAlex |
Sep 20 2012, 12:37
Пост
#303
|
Трохи обжився Група: Trusted Members Повідомлень: 16 З нами з: 30-March 06 Користувач №: 199 Стать: Чол Парк машин: Intel(R) Core(TM) i7 CPU Q 740 @ 1.73GHz [Family 6 Model 30 Stepping 5] (8 processors) AuthenticAMD AMD Athlon(tm) 64 X2 Dual Core Processor 5200+ [Family 15 Model 107 Stepping 2] (2 processors) GenuineIntel Intel(R) Core(TM)2 CPU 6300 @ 1.86GHz [Family 6 Model 15 Stepping 2] (2 processors) |
Всім привіт!
В мене проблеми з розрахунками на GPU. 9/20/2012 12:22:00 PM | Poem@Home | Starting task poempp_gpucrystal_1348090305_941075491_0 using poemcl version 103 (opencl_nvidia_100) in slot 5 9/20/2012 12:22:06 PM | Poem@Home | Task poempp_gpucrystal_1348090305_941075491_0 exited with zero status but no 'finished' file 9/20/2012 12:22:06 PM | Poem@Home | If this happens repeatedly you may need to reset the project. 9/20/2012 12:22:06 PM | Poem@Home | Restarting task poempp_gpucrystal_1348090305_941075491_0 using poemcl version 103 (opencl_nvidia_100) in slot 5 9/20/2012 12:22:12 PM | Poem@Home | Task poempp_gpucrystal_1348090305_941075491_0 exited with zero status but no 'finished' file 9/20/2012 12:22:12 PM | Poem@Home | If this happens repeatedly you may need to reset the project. На 4-й секунді пише Computation error, Progress - 100% Майже всі задачі на GPU з помилками, але знайшлася парочка, яка успішно обраховані Моя сторінка: http://boinc.fzk.de/poem/results.php?useri...&state=0&appid= Карточка - NVIDIA GeForce 310M with CUDA Driver version: 296.10 |
Death |
Sep 20 2012, 13:11
Пост
#304
|
<script ///> Група: Moderators Повідомлень: 6 371 З нами з: 5-November 03 З: Kyiv Користувач №: 26 Стать: НеСкажу Free-DC_CPID Парк машин: гидропарк jabber:deadjdona@gmail.com |
QUOTE 9/20/2012 12:22:06 PM | Poem@Home | If this happens repeatedly you may need to reset the project. -------------------- |
DAlex |
Sep 21 2012, 12:08
Пост
#305
|
Трохи обжився Група: Trusted Members Повідомлень: 16 З нами з: 30-March 06 Користувач №: 199 Стать: Чол Парк машин: Intel(R) Core(TM) i7 CPU Q 740 @ 1.73GHz [Family 6 Model 30 Stepping 5] (8 processors) AuthenticAMD AMD Athlon(tm) 64 X2 Dual Core Processor 5200+ [Family 15 Model 107 Stepping 2] (2 processors) GenuineIntel Intel(R) Core(TM)2 CPU 6300 @ 1.86GHz [Family 6 Model 15 Stepping 2] (2 processors) |
Reset the project не допомагає, проблема лишилася:
9/21/2012 12:42:24 PM | Poem@Home | Restarting task poempp_gpucrystal_1348179247_1977302552_0 using poemcl version 103 (opencl_nvidia_100) in slot 8 9/21/2012 12:42:29 PM | Poem@Home | Task poempp_gpucrystal_1348179247_1977302552_0 exited with zero status but no 'finished' file 9/21/2012 12:42:29 PM | Poem@Home | If this happens repeatedly you may need to reset the project. 9/21/2012 12:42:29 PM | Poem@Home | Restarting task poempp_gpucrystal_1348179247_1977302552_0 using poemcl version 103 (opencl_nvidia_100) in slot 8 9/21/2012 12:42:34 PM | Poem@Home | Computation for task poempp_gpucrystal_1348179247_1977302552_0 finished 9/21/2012 12:42:34 PM | Poem@Home | Output file poempp_gpucrystal_1348179247_1977302552_0_0 for task poempp_gpucrystal_1348179247_1977302552_0 absent 9/21/2012 12:42:34 PM | Poem@Home | Output file poempp_gpucrystal_1348179247_1977302552_0_1 for task poempp_gpucrystal_1348179247_1977302552_0 absent 9/21/2012 12:42:34 PM | Poem@Home | Output file poempp_gpucrystal_1348179247_1977302552_0_2 for task poempp_gpucrystal_1348179247_1977302552_0 absent |
Rilian |
Sep 21 2012, 12:52
Пост
#306
|
interstellar Група: Team member Повідомлень: 16 930 З нами з: 22-February 06 З: Торонто Користувач №: 184 Стать: НеСкажу Free-DC_CPID Парк машин: ноут и кусок сервера |
DAlex, а если отключить и подключить проект заново? Ресет иногда может не помогать
-------------------- |
TyphooNick |
Sep 21 2012, 14:11
Пост
#307
|
кранчер зі стажем Група: Trusted Members Повідомлень: 297 З нами з: 9-October 09 Користувач №: 1 178 Стать: Чол Free-DC_CPID Парк машин: ASUS M IX Code + Core i7-7700K @ 5.00GHz + 16GB DDR4 3733MHz CL17 + Castom Liquid Cooling Pentium G2020 @ 2.90GHz |
DAlex, Разгон оперативной памяти, даже если это SPD-профиль, приводит к ошибкам. У меня так было. Откатился на предыдущий SPD-профиль - ошибок стало меньше, установил 1600 MHz - ошибки исчезли. Разгон процессора и видеокарты к ошибкам не приводят, даже если это нестабильный разгон в играх или бенчмарках, Boinc пашет. Также можно попробовать на предыдущей версии Boinc или драйверов видео. Да, еще. Как я понимаю, не до конца изучен вопрос о том, как влияет расположение папки с данными на втором физическом, отличном от системного, диске, который ОС отключает (если у Вас не задано другое). А ведь программа сохраняет промежуточные результаты вычислений, согласно Ваших установок. Это я к тому, что пробуя варианты с разгоном и версиями программы и драйверов, установите для полной гарантии папку с данными по умолчанию на диск С:\.
-------------------- (Show/Hide) |
netphil |
Sep 29 2012, 19:10
Пост
#308
|
kранчер Група: Trusted Members Повідомлень: 110 З нами з: 7-April 12 Користувач №: 2 992 Стать: Чол |
Народ подтягивайтесь....а то снова только 2 человека кранчят на полную.
Реально войти в 20!!!! |
Death |
Sep 29 2012, 19:49
Пост
#309
|
<script ///> Група: Moderators Повідомлень: 6 371 З нами з: 5-November 03 З: Kyiv Користувач №: 26 Стать: НеСкажу Free-DC_CPID Парк машин: гидропарк jabber:deadjdona@gmail.com |
на полную єто сколько? ))
Milestones Yesterday UA_ReMMeR passed 250,000 likvo passed 400,000 Dmitry Panoff passed 1,300,000 LSA passed 20,000,000 Sergey_F passed 30,000 Black_Dandy passed 6,000 alblackcat passed 1,000 amuliar passed 1,900,000 -------------------- |
mysterix |
Sep 29 2012, 22:20
Пост
#310
|
кранчер-новачок Група: Trusted Members Повідомлень: 52 З нами з: 12-July 07 З: Кривой Рог Користувач №: 555 Стать: Чол Парк машин: PIV 3ГГц (630), 3ГБ ОЗУ DDR2, ATI HD5450 512МБ DDR2 |
я кранчу на-полную)
|
TyphooNick |
Sep 30 2012, 00:47
Пост
#311
|
кранчер зі стажем Група: Trusted Members Повідомлень: 297 З нами з: 9-October 09 Користувач №: 1 178 Стать: Чол Free-DC_CPID Парк машин: ASUS M IX Code + Core i7-7700K @ 5.00GHz + 16GB DDR4 3733MHz CL17 + Castom Liquid Cooling Pentium G2020 @ 2.90GHz |
С понедельника по пятницу - время Boinc.
Выходные - Пользователю. Почти как в Библии: "День субботний... и т.д.))) -------------------- (Show/Hide) |
netphil |
Sep 30 2012, 08:28
Пост
#312
|
kранчер Група: Trusted Members Повідомлень: 110 З нами з: 7-April 12 Користувач №: 2 992 Стать: Чол |
Death,
на полную это 500-600 000 RAC у тогоже Vvolodymyr и т.д. По лимону конечно хорошо, но маловато. Посмотри сколько в сутки дают конкуренты в 20...сам поймешь нам нужно 2 000 000 в сутки для того что бы ввойти быстро в 20 и закрепится. |
Bel |
Oct 12 2012, 19:56
Пост
#313
|
Мега ранчер Група: Trusted Members Повідомлень: 1 287 З нами з: 3-September 10 Користувач №: 1 476 Стать: Чол |
Собственно, есть желающие переходить из Поемы на ВЦГ?
|
netphil |
Oct 12 2012, 20:57
Пост
#314
|
kранчер Група: Trusted Members Повідомлень: 110 З нами з: 7-April 12 Користувач №: 2 992 Стать: Чол |
Bel,
а поконкретней? как я понял в World Community Grid - множество подпроектов. о чем речь ? |
Bel |
Oct 12 2012, 21:36
Пост
#315
|
Мега ранчер Група: Trusted Members Повідомлень: 1 287 З нами з: 3-September 10 Користувач №: 1 476 Стать: Чол |
Проект HCC. Только сейчас нет возможности выбора заданий для гпу или цпу онли. Но обещают в скором времени прикрутить соответствующую кнопку. Правда народ как то извращается в сс.конфиге... Рулят амд карты, но правда хз - так говорят!
Тема на форуме https://distributed.org.ua/forum/index.php?...65entry100570 ЗЫ: OLED дисплеи vs Cancer... ?! |
Lo-Fi Версія | Поточний час: 29th April 2024 - 17:14 |