Привіт Гість ( Вхід | Реєстрація )

> FightAIDS@home, поиск лекарств от ВИЧ и СПИДа
Rilian
Jun 18 2007, 16:31
Пост #1


interstellar
**********

Група: Team member
Повідомлень: 17 340
З нами з: 22-February 06
З: Ванкувер
Користувач №: 184
Стать: НеСкажу
Free-DC_CPID
Парк машин:
ноут и кусок сервера



IPB Image

Проект занимается подбором лекарств от ВИЧ

* Официальный сайт
* Прогресс и статус исследований на официальном сайте

Как присоединиться читайте в главном топике World Community Grid thumbsup.gif

Подробнее о научных методах в FightAIDS@Home:

Белки, как вы уже знаете, является строительным материалом для всех живых существ. Разнообразные формы белков принимают участие во всех процессах, происходящих в живых организмах. Белки являются длинными цепями меньших молекул - аминокислот.

Энзимы являются конкретными типами белков, которые ускоряют биохимические реакции.

Протеаза - энзим, который способен «вырезать» отдельный белок в некоторой точке аминокислотной цепи. Например, когда Вы едите пищу, которая также содержит белок, белковые молекулы режутся на меньшие аминокислотные молекулы протеазой в вашем желудке.

Ваш организм может затем использовать получившиеся аминокислоты, чтобы формировать белки, которые ему нужны для продолжения жизнедеятельности. Стоит отметить также, что только небольшой процент из всех белков в организме является протеазами, поэтому эти белки очень важны в своем функционировании для обеспечения жизненных процессов.

Ваш компьютер поможет нам имитировать процесс присоединения множества различных лиганд* к HIV-протеазе (HIV- Human Immunodeficiency Virus – вирус иммунодефицита человека), для этого используется компьютерная программы под названием AutoDock.

*Лиганды - (от лат . ligo - связываю), в комплексных соединениях молекулы или ионы, связанные с центральным атомом (комплексообразователем), напр. в соединении [Co(NH3)6]Cl3 центральный атом - Со, а лиганды - молекулы NH3.

Перспективные лиганды будут изучены более подробно учеными, и это должно привести нас к созданию лекарства для управления ВИЧ-инфекцией, и в конце концов, к предотвращению заболевания СПИДОМ.

Естественно, моделирование таких процессов – сложная в вычислительном отношении задача из-за большого разнообразия белковых структур и выделению из них тех, которые могут эффективно повлиять на вирус, поэтому в данном проекте также используются методы распределенных вычислений.

QUOTE
What is AIDS?
UNAIDS, the Joint United Nations Program on HIV/AIDS, estimated that in 2004 there were more than 40 million people around the world living with HIV, the Human Immunodeficiency Virus. The virus has affected the lives of men, women and children all over the world. Currently, there is no cure in sight, only treatment with a variety of drugs.

Prof. Arthur J. Olson's laboratory at The Scripps Research Institute (TSRI) is studying computational ways to design new anti-HIV drugs based on molecular structure. It has been demonstrated repeatedly that the function of a molecule — a substance made up of many atoms — is related to its three-dimensional shape. Olson's target is HIV protease ("pro-tee-ace"), a key molecular machine of the virus that when blocked stops the virus from maturing. These blockers, known as "protease inhibitors", are thus a way of avoiding the onset of AIDS and prolonging life. The Olson Laboratory is using computational methods to identify new candidate drugs that have the right shape and chemical characteristics to block HIV protease. This general approach is called "Structure-Based Drug Design", and according to the National Institutes of Health's National Institute of General Medical Sciences, it has already had a dramatic effect on the lives of people living with AIDS.

Even more challenging, HIV is a "sloppy copier," so it is constantly evolving new variants, some of which are resistant to current drugs. It is therefore vital that scientists continue their search for new and better drugs to combat this moving target.

Scientists are able to determine by experiment the shapes of a protein and of a drug separately, but not always for the two together. If scientists knew how a drug molecule fit inside the active site of its target protein, chemists could see how they could design even better drugs that would be more potent than existing drugs.

To address these challenges, World Community Grid's FightAIDS@Home project runs a software program called AutoDock developed in Prof. Olson's laboratory. AutoDock is a suite of tools that predicts how small molecules, such as drug candidates, might bind or "dock" to a receptor of known 3D structure. The very first version of AutoDock was written in the Olson Laboratory in 1990 by Dr. David S. Goodsell, since then, newer versions, developed by Dr. Garrett M. Morris, have been released which add new scientific understanding and strategies to AutoDock, making it computationally more robust, faster, and easier for other scientists to use. From the beginning of this project, World Community Grid has been running a pre-release version of AutoDock4. In August 2007, World Community Grid started running the new publicly available version 4 of AutoDock which is faster, more accurate, can handle flexible target molecules and thus can also be used for protein-protein docking analysis. AutoDock is used in the FightAIDS@Home project on World Community Grid to dock large numbers of different small molecules to HIV protease, so the best molecules can be found computationally, selected and tested in the laboratory for efficacy against the HIV virus. By joining forces together, The Scripps Research Institute, World Community Grid and its growing volunteer force can find better treatments much faster than ever before.


IPB Image

График проекта
IPB Image

Ссылки

ВИЧ 3D

Це повідомлення відредагував Rilian: Sep 8 2010, 11:49
User is offlineProfile CardPM
Go to the top of the page
+Quote Post
15 Сторінки V « < 13 14 15  
Reply to this topicStart new topic
Відповідей(210 - 218)
Arbalet
Feb 26 2015, 19:05
Пост #211


Штандартенкранчер
*********

Група: Moderators
Повідомлень: 2 656
З нами з: 16-August 05
Користувач №: 119
Стать: Чол
Парк машин:
Расово верная продукция AMD & ATI: FX-8320 + Phenom II X6 1090T + HD5870 + HD5770



Отчитались о проделанной работе. Из важного - почти закончили все необходимые вычисления, теперь концентрируются на обработке и анализе полученных результатов. bq.gif


--------------------
(Show/Hide)


My asteroids: 1150 Achaia, 1643 Brown, 3286 Anatoliya

User is offlineProfile CardPM
Go to the top of the page
+Quote Post
e_alesha
Oct 1 2015, 08:02
Пост #212


Соромлюсь щось писати
*

Група: New Members
Повідомлень: 5
З нами з: 9-February 11
З: Запорожье
Користувач №: 1 623
Стать: Чол
Free-DC_CPID
Парк машин:
AMD Athlon X2 Dual-Core 7550@2750, 3Gb DDR2-667, AMD Radeon 7750@830 Intel i3-3110, 8Gb DDR3-1333, NVIDIA GT 640M 2GB



FightAIDS@Home - Phase 2

https://secure.worldcommunitygrid.org/resea...ahb/overview.do

Стартовала 2 фаза.


--------------------
(Show/Hide)



User is offlineProfile CardPM
Go to the top of the page
+Quote Post
Rilian
Oct 2 2015, 08:35
Пост #213


interstellar
**********

Група: Team member
Повідомлень: 17 340
З нами з: 22-February 06
З: Ванкувер
Користувач №: 184
Стать: НеСкажу
Free-DC_CPID
Парк машин:
ноут и кусок сервера



Ого, вот єто поворот!

https://secure.worldcommunitygrid.org/stat/...tShortName=fahb

Я даже не знаю стоит ли делать отдельний топик под 2 фазу ?


--------------------
(Show/Hide)

Миссия проекта Help Fight Childhood Cancer (Помоги Победить Детский Рак) - подобрать белки, блокирующие некоторые виды рака. Подключайтесь!
IPB Image
IPB Image

IPB Image

IPB Image
IPB Image

общая статистика: BOINCstats * FreeDC команда: BOINC команда Ukraine

IPB Image
User is offlineProfile CardPM
Go to the top of the page
+Quote Post
Tamagoch
Oct 2 2015, 16:07
Пост #214


Мультікранчер
********

Група: Trusted Members
Повідомлень: 1 737
З нами з: 27-September 03
З: Бровари
Користувач №: 18
Стать: Чол
Free-DC_CPID
Парк машин:
AMD x5 + Intel x2



вторая фаза, как и в других подпроектах, идет отдельно и у нас на форуме тоже.... думаю, есть смысл оформлять, тем более, что характер заданий совсем другой - похоже, это уже AVX-ориентированное приложение, на моем "старичке" задания по 16 часов идут, вместо 40-60 минут в первой фазе под Vina


--------------------
Кор2дуо не мой, я просто разместил там BOINC :)
(Show/Hide)

User is offlineProfile CardPM
Go to the top of the page
+Quote Post
Rilian
Oct 3 2015, 11:09
Пост #215


interstellar
**********

Група: Team member
Повідомлень: 17 340
З нами з: 22-February 06
З: Ванкувер
Користувач №: 184
Стать: НеСкажу
Free-DC_CPID
Парк машин:
ноут и кусок сервера



ок, я оформлю новий топик


--------------------
(Show/Hide)

Миссия проекта Help Fight Childhood Cancer (Помоги Победить Детский Рак) - подобрать белки, блокирующие некоторые виды рака. Подключайтесь!
IPB Image
IPB Image

IPB Image

IPB Image
IPB Image

общая статистика: BOINCstats * FreeDC команда: BOINC команда Ukraine

IPB Image
User is offlineProfile CardPM
Go to the top of the page
+Quote Post
Vzik
Jul 12 2016, 09:32
Пост #216


кранчер зі стажем
******

Група: Trusted Members
Повідомлень: 388
З нами з: 26-April 13
З: Київ, Святошин
Користувач №: 3 232
Стать: Чол
Free-DC_CPID
Парк машин:
В більшості застарілий хлам, але ж з краплі починається море. Обчислюю тільки CPU проекти, бо немає гідних відеокарт. Потроху парк оновлюється, але не так швидко, важкі часи.



Австралийские медики заявили о победе над СПИДом

В Австралии медики объявили, что на зеленом континенте СПИД больше не является проблемой национального здравоохранения.

Дело в том, что если в 1990 годах в Австралии от СПИДа умирали каждый год порядка 1000 граждан, то сегодня даже подобная статистика не ведется.

Это связано с тем, что на сегодняшний день СПИД превратился в хроническое контролируемое заболевание, сообщает The Australian.

По словам руководителя программы профилактики СПИДа Университета Кирби профессора медицины Эндрю Гралича, сегодня, если люди заражаются СПИДом, они проходят курс лечения и "расстаются со СПИДом".

Профессор подчеркнул, что сегодня СПИД – уже не смертельный приговор.

Ученые считают, что огромную помощь в борьбе со СПИДом оказала вакцинация, которая начала проводиться в середине 1990-х годов антиретровирусным препаратом.

В результате, это позволило оградить ВИЧ-инфицированных людей от последней формы заболевания - СПИДа.


--------------------
(Show/Hide)




Шукаю сенс життя...

Хто дуже шукає - той знаходить.
The Law of One (Ra Material)
User is offlineProfile CardPM
Go to the top of the page
+Quote Post
Rilian
Jul 15 2016, 21:27
Пост #217


interstellar
**********

Група: Team member
Повідомлень: 17 340
З нами з: 22-February 06
З: Ванкувер
Користувач №: 184
Стать: НеСкажу
Free-DC_CPID
Парк машин:
ноут и кусок сервера



ого, крутая новость!


--------------------
(Show/Hide)

Миссия проекта Help Fight Childhood Cancer (Помоги Победить Детский Рак) - подобрать белки, блокирующие некоторые виды рака. Подключайтесь!
IPB Image
IPB Image

IPB Image

IPB Image
IPB Image

общая статистика: BOINCstats * FreeDC команда: BOINC команда Ukraine

IPB Image
User is offlineProfile CardPM
Go to the top of the page
+Quote Post
mr11
Dec 7 2016, 14:04
Пост #218


Трохи обжився
**

Група: Trusted Members
Повідомлень: 30
З нами з: 15-January 10
Користувач №: 1 271
Стать: bot
Парк машин:
Phenom || X4 955, 4гб РАМ.



Знову з'явились завдання. Десь по 200.000 в день. Хоча у мене все одно ловить лише Mapping Cancer Markers.
User is offlineProfile CardPM
Go to the top of the page
+Quote Post
Dromage
Dec 7 2016, 15:16
Пост #219


кранчер з фермою
*******

Група: Trusted Members
Повідомлень: 939
З нами з: 6-March 12
З: Кривий Ріг
Користувач №: 2 942
Стать: Чол
Парк машин:
домашня конячка: i5-4690K, домашній ішачок: pentium B970



З учорашнього вечора по нинішній час мені нападало вже більше 200 завдань. Вчора розрахунки тривали по 4-8 хвилин. Сьогодні - вже приблизно по годині.


--------------------


(Show/Hide)

User is offlineProfile CardPM
Go to the top of the page
+Quote Post

15 Сторінки V « < 13 14 15
Reply to this topicStart new topic
1 Користувачів переглядають дану тему (1 Гостей і 0 Прихованих Користувачів)
0 Користувачів:

 



- Lo-Fi Версія Поточний час: 24th August 2019 - 08:38

Rambler's Top100 Рейтинг@Mail.ru
Invision Power Board v1.3.3 © 1996 IPS, Inc.