RNA World (beta), исследование РНК оргинизмов: от простейших до РНК человека |
Привіт Гість ( Вхід | Реєстрація )
RNA World (beta), исследование РНК оргинизмов: от простейших до РНК человека |
nikelong |
Jan 2 2010, 02:07
Пост
#1
|
Тера ранчер Група: Trusted Members Повідомлень: 11 909 З нами з: 19-March 05 Користувач №: 92 Стать: Чол |
Проект "RNA World (beta)"
----------------------------------------------------------------------------------------------------------
ТОП-20 участников: ---------------------------------------------------------------------------------------------------------- Дата основания команды - 03.01.2010 Капитан - distributed.org.ua ---------------------------------------------------------------------------------------------------------- Для присоединения к команде Украины: 1. Загрузите BOINC менеджер (Если его у Вас еще нет!) 2. Перейдите в "расширенный вид" 3. Выберите сервис ---> добавить проект 4. Введите адрес проекта http://www.rnaworld.de/rnaworld/ 5. Введите свои регистрационные данные. 6. Найдите нашу команду. Она называется Ukraine. Нажмите Join чтобы вступить в команду. 7. Если есть доступные для загрузки задания Вы их получите и начнете расчеты. ---------------------------------------------------------------------------------------------------------- Новичкам: статья со скриншотами, как поставить и настроить BOINC-менеджер ---------------------------------------------------------------------------------------------------------- Полезная информация: Для идентификации пользователя в BOINC могут служить 2 вещи: 1) пара e-mail/пароль 2) межпроектный идентификационный ID (Cross-project ID) - 32значное шестнадцатиричное число. Если Вы пожелаете подключится ещё и к другому BOINC-проекту, то помните: чтобы не плодить новых аккаунтов при подключении к новому проекту или команде, нужно обязательно везде регистрироваться с одним и тем же Именем и EMAIL. если при регистрации в проекте указать другой e-mail , BOINC создаст новый аккаунт с тем же именем! В этом случае рекомендуется зайти во все ваши аккаунты и во все проекты и где надо поменять емейл на нужный. Через некоторое время ваши аккаунты сольются в один с одним cross-project-id. ---------------------------------------------------------------------------------------------------------- О проекте - общая информация (на английском): RNA World занимается исследованием РНК разных оргинизмов: от простейших, до РНК человека (Show/Hide) Подпроекты: (ссылка на официальную страницу) Project: CRISPR (Show/Hide) Project: GEMM (Show/Hide) Project: 6S (Show/Hide) Project: Thermo (Show/Hide) Project: Mtb, Myctu, Mycle & Myc - изучает РНК туберкулезных палочек (Show/Hide) Project: sRib (Show/Hide) Project: tRNA & tRNA-like (Show/Hide) Project: T-box (Show/Hide) Project: GA (Show/Hide) ------------------------- Ссылки по теме:
(Show/Hide) Це повідомлення відредагував nikelong: Sep 18 2010, 20:35 |
YuRi |
Mar 17 2010, 21:16
Пост
#46
|
BOINC-одессит Група: Trusted Members Повідомлень: 1 680 З нами з: 6-May 06 З: Odessa Користувач №: 211 Стать: Чол Парк машин: 25, від P-III/650 до C2D E4400@3GHz, переважна більшість Celeron 430@2.025GHz |
админы RNA обновят сервер и приложения чтобы временно исправить проблемы Перевод доставил. "Краткость - с. т." © -------------------- Гармонично недоразвитая личность
(Show/Hide) |
Rilian |
Mar 18 2010, 02:48
Пост
#47
|
interstellar Група: Team member Повідомлень: 17 001 З нами з: 22-February 06 З: Торонто Користувач №: 184 Стать: НеСкажу Free-DC_CPID Парк машин: ноут и кусок сервера |
Теперь на каждой ВЮ написано сколько она будет примерно считаться на "стандартном" 2.6ГГц компьютере
Пример можно посмотреть тут: http://www.rnaworld.de/rnaworld/workunit.php?wuid=511684 --- YuRi, не хот. копипастить 100499 сообщ. с нашего и оф форума -------------------- |
Peret |
Mar 18 2010, 11:50
Пост
#48
|
kранчер Група: Trusted Members Повідомлень: 88 З нами з: 6-April 07 Користувач №: 496 Стать: Чол |
А чекпоинты они так и не прикрутили? А то помоему вю на полторы недели без ЧП уже перебор...
|
Rilian |
Mar 18 2010, 11:59
Пост
#49
|
interstellar Група: Team member Повідомлень: 17 001 З нами з: 22-February 06 З: Торонто Користувач №: 184 Стать: НеСкажу Free-DC_CPID Парк машин: ноут и кусок сервера |
А чекпоинты они так и не прикрутили? А то помоему вю на полторы недели без ЧП уже перебор... обещают позже. под линуксом все работает, под виндовс - нет -------------------- |
Rilian |
Mar 20 2010, 15:19
Пост
#50
|
interstellar Група: Team member Повідомлень: 17 001 З нами з: 22-February 06 З: Торонто Користувач №: 184 Стать: НеСкажу Free-DC_CPID Парк машин: ноут и кусок сервера |
Сегодня появились задания с небольшими требованиями к оперативке. У меня пара компов с 2ГБ памяти уже успели посчитать штук 30 ВЮ за полдня
-------------------- |
Death |
Mar 20 2010, 23:27
Пост
#51
|
<script ///> Група: Moderators Повідомлень: 6 371 З нами з: 5-November 03 З: Kyiv Користувач №: 26 Стать: НеСкажу Free-DC_CPID Парк машин: гидропарк jabber:deadjdona@gmail.com |
20.03.2010 23:27:26 RNA World Message from server: cmsearch needs 3814.70 MB RAM but only 863.25 MB is available for use.
-------------------- |
Rilian |
Apr 4 2010, 02:23
Пост
#52
|
interstellar Група: Team member Повідомлень: 17 001 З нами з: 22-February 06 З: Торонто Користувач №: 184 Стать: НеСкажу Free-DC_CPID Парк машин: ноут и кусок сервера |
-------------------- |
Rilian |
Apr 4 2010, 14:44
Пост
#53
|
interstellar Група: Team member Повідомлень: 17 001 З нами з: 22-February 06 З: Торонто Користувач №: 184 Стать: НеСкажу Free-DC_CPID Парк машин: ноут и кусок сервера |
Обновлены научные цели проекта
Добавлен проект T-box * The T-box leader is part of the 5' end of a number of mRNAs and represents an RNA element that serves a regulatory function in controlling protein production by interacting with non-charged tRNAs. In this project, the RNA World supercomputer is utilized to identify T-box elements throughout the kingdom of life. -------------------- |
Rilian |
Apr 4 2010, 23:35
Пост
#54
|
interstellar Група: Team member Повідомлень: 17 001 З нами з: 22-February 06 З: Торонто Користувач №: 184 Стать: НеСкажу Free-DC_CPID Парк машин: ноут и кусок сервера |
Снова есть ВЮ для компов с малым кол-вом памяти
-------------------- |
Rilian |
Apr 5 2010, 22:33
Пост
#55
|
interstellar Група: Team member Повідомлень: 17 001 З нами з: 22-February 06 З: Торонто Користувач №: 184 Стать: НеСкажу Free-DC_CPID Парк машин: ноут и кусок сервера |
QUOTE 2010-04-05: You may have noticed that I am a bit less responsive during the past two weeks concerning user support. This in fact has good reason since I am currently travelling around in India to meet our cooperation partners and discuss a set of very interesting projects I have planned from long hand since quite some time now. The outcome is this: While we are currently working on resolving the RAM issue with the large eukaryotic work units, as of today, I have replaced the remaining WUs of this batch by a novel, highly exciting project dealing with tuberculosis that is actually based on our very promising results obtained for the Lin64 CMC WU series we completed successfully a few weeks ago. I have meanwhile tested these Lin64 CMC results and they seem perfect as all testings could be completed to my full satisfaction.If all works as expected, you can expect the first WUs of the tuberculosis type to pour in on your machines by tomorrow or maybe even tonight. We just have to finish up the latest large WU batch that has been processed and fed in by the server. For a few more details on that project, just take a look at our constantly improving scientific objectives page. Michael. В RNA World добавлен новый подпроект который занимается изучением туберкулеза. ВЮ будут сегодня вечером или завтра. -------------------- |
Rilian |
Apr 6 2010, 00:30
Пост
#56
|
interstellar Група: Team member Повідомлень: 17 001 З нами з: 22-February 06 З: Торонто Користувач №: 184 Стать: НеСкажу Free-DC_CPID Парк машин: ноут и кусок сервера |
Для большей эффективности рассчетов, установите Affinity changer и добавьте в его список "cmsearch"
-------------------- |
Rilian |
Apr 6 2010, 22:40
Пост
#57
|
interstellar Група: Team member Повідомлень: 17 001 З нами з: 22-February 06 З: Торонто Користувач №: 184 Стать: НеСкажу Free-DC_CPID Парк машин: ноут и кусок сервера |
Страница с описанием научных целей проекта завершена. Можно переводить
-------------------- |
Rilian |
Apr 7 2010, 14:35
Пост
#58
|
interstellar Група: Team member Повідомлень: 17 001 З нами з: 22-February 06 З: Торонто Користувач №: 184 Стать: НеСкажу Free-DC_CPID Парк машин: ноут и кусок сервера |
The first set of WUs dealing with our tuberculosis project is now ready for processing. These WUs should have quite heterogeneous run times of up to a maxmum of 10 hrs (on an Intel i7 020 Quad-Core CPU) and should be devoid of RAM or traffic problems. I hope that even those that had problems with our last set of huge CMS WUs will consider participating again since I believe this is a very interesting research project.
During my travels in India I arranged for cooperation with scientific labs that have a S3 security license which is actually the second highest security status known. So, we will grow and analyze even the virulent Mycobacterium tuberculosis strains to validate our computational results. 8) Michael. -------------------- |
Rilian |
Apr 8 2010, 20:48
Пост
#59
|
interstellar Група: Team member Повідомлень: 17 001 З нами з: 22-February 06 З: Торонто Користувач №: 184 Стать: НеСкажу Free-DC_CPID Парк машин: ноут и кусок сервера |
Есть несколько тысяч туберкулезных ВЮ! ВЮ будут доступны примерно несколько дней (админы говорят что очень много в очереди)
http://www.rechenkraft.net/phpBB/viewtopic.php?f=75&t=10826 -------------------- |
Rilian |
Apr 9 2010, 22:53
Пост
#60
|
interstellar Група: Team member Повідомлень: 17 001 З нами з: 22-February 06 З: Торонто Користувач №: 184 Стать: НеСкажу Free-DC_CPID Парк машин: ноут и кусок сервера |
Пишут, что скоро будут бейджики разных биологических подпроектов!
Кстати, туберкулез кранчится хорошо. 1 час на ВЮ на 2.0ГГц, и занимает 20МБ памяти -------------------- |
Lo-Fi Версія | Поточний час: 20th June 2024 - 04:05 |