40. Електричні поля й активний стан ензимів: пряме порівняння експерименту з теорією
Автори: Ian T. Suydam, Christopher D. Snow, Vijay S. Pande, Steven G. Boxer. Science (2006)
Підсумки: Можливість кількісної оцінки електричних полів у протеїнах є важливим завданням. У цій статті, завдяки розподіленим обчисленням проекту Foldіng@Home, ми зіставляємо нові експериментальні методи з новими теоретичними методами. Зокрема, ми вважаємо, що вивчення окремих структур не є ефективним в плані дослідження електростатики в білках, тому припускаємо, що множинні підходи в Foldіng@Home зіграють важливу роль у вивченні даної проблеми.
Трохи теорії: Електричне поле, що утворюється в згорнутих білках впливає майже на кожен аспект їхньої функціональності. Ми представляємо вібраційно-спектроскопічну техніку, що вимірює зміни в електричному полі при певному положенні білка як перепади частоти (сильні здвиги) каліброваної нітрилової вібрації. Нітрил-утримуючий інгібітор використовується для доставки унікального коливання в активну частину людської альдозредуктази, і відгук нитрілової частоти вимірюється серією мутацій на ділянці з активним ензимом. Ці здвиги надають кількісну інформацію про електричні поля, які можна прямо порівнювати з електростатичними обчисленнями. Ми показали, що необхідна симуляція екстенсивної молекулярної динаміки й безліч усереднень, щоб відтворити зміни, які спостерігаються в полі.
Більше докладну інформацію зможете одержати з даного PDF-документу.
|
ua 
ru 
|
Пошук...
|
Сайт відкрито 14.12.2005
