ua     ru    Sitemap   Sitemap     | Пошук... |       Сайт відкрито 14.12.2005

Ukraine - Distributed Computing Team

 

 » Навігація 
  Новини
  Новини (Архів)
  Описи проектів
  Опитування
  Архіви

  Форум
  Форум (PDA)

 » Статті 


       Описи проектів 
Начало раздела > Folding@Home > Описи проектів F@H

Проект 2143



Проект 2143


Альдозоредуктаза (с) зображення www.rcsb.org      Для розрахунку електростатики в молекулярній динаміці білків існують методи RF й PME, які дають можливість уникнути обчислень електростатичних сил між кожною парою атомів у системі. Це важливо для проекту 2143, спорідненому проекту 2142, в системі якого міститься забагато атомів (більше 80000), щоб розрахувати всі спарені сили. Тому необхідно звернутися до наближених методів, вибравши між RF й PME.

     Проте, на практиці вибір між "правильними" методами обертається "релігійними війнами", що не є добрим. Тому для дослідження кінетики процесу обрані обидва методи. Згодом Boxer Group зі Стенфорду буде мати експериментальні дані електричних полів альдозоредуктази людини і ми будемо мати у своєму розпорядженні траєкторії, які допоможуть порівняти адекатність RF та PME.

     Завдання для цього проекту розроблені так, щоб займати приблизно однаковий час із завданнями проекту 2142, так ми зможемо порівняти їхню точність із обчислювальною ресурсоемністю.

     Через дуже великий розмір системи (альдозоредуктаза має 316 залишків, кофактор, інгібітор, 80000 атомів води) ці симуляції займають багато пам'яті, тому будуть обмежені тією частиною клієнтів, які дозволяють використання 200 Мб оперативної пам'яті й більше (ця величина змінилася до 100 Мб із 22.09.2006).

     Переклад - Yura_H, редакція і розміщення - Arbalet





Дата: Неділя, 21 Січень 2007
Прочитана: 3614 раз

Распечатать Распечатать    Переслать Переслать    В избранное В избранное

Другие публикации
  • Проекти 761-773
  • Проекти 962-997
  • Проекти 1136-1139
  • Проект 1151
  • Проекти 1155-1161
  • Проекти 1162, 1163
  • Проекти 1164-1168
  • Проекти 1800-1849
  • Проекти 1850-1899
  • Проекти 2008-2011
    Повернутися назад

  •  » Положення команди 
    Медико-біологічні
    Correlizer
    47
    DrugDiscovery@Home
    9
    Fightaids@Home
    40
    Folding@Home
    56
    Gpugrid.net
    50
    Help Cure Muscular Dystrophy
    40
    Help Conquer Cancer
    40
    Help Fight Childhood Cancer
    40
    Human Proteome Folding (Phase 2)
    40
    Lattice Project
    20
    Malariacontrol.net
    47
    NRG@home (Najmanovich Research Group)
    26
    Poem@Home
    32
    Ps3grid.net
    50
    RNA World
    47
    Rosetta@Home
    27
    World Community Grid
    40
    Математика
    Abc@Home
    13
    Collatz Conjecture
    75
    EulerNet
    10
    Gimps (Great Internet Mersenne Prime Search)
    29
    Mersenne@home
    78
    NFS@Home (Number Field Sieve)
    55
    OGR-27
    11
    OPTIMA@HOME
    35
    primaboinca
    44
    Primegrid
    40
    Seventeen Or Bust
    16
    Seventeen Or Bust-Sieve
    17
    WEP-M+2 Project (Wanless)
    40
    Криптографія
    DistrRTgen
    68
    Enigma@Home
    52
    RC5-72
    22
    Фізика
    Einstein@Home
    49
    IBERCIVIS
    1
    Leiden Classical
    61
    Lhc@Home
    33
    Magnetism@Home
    2
    Muon1-DPAD
    31
    Spinhenge@Home
    39
    Хімія
    QMC@Home
    44
    Kосмос
    Constellation@home
    51
    Cosmology@Home
    44
    Milkyway@Home
    48
    Orbit@Home
    27
    SETI@Home
    90
    Планета земля
    Climate Prediction
    43
    La Red de Atrapa Sismos
    7
    Quake Catcher Network
    64
    Radioactive@Home
    12
    Virtual Prairie (ViP)
    24
    Штучний інтелект
    FreeHAL@Home
    24
    Neurona@Home
    21
    Інтернет
    Majestic-12
    4
    Рендеринг
    Burp
    34
    Luxrenderfarm@home
    0
    ORE (Open Rendering Environment)
    40
    Ігрові проекти
    Chess960@Home
    95
    sudoku@vtaiwan
    16
    Клікери і трекери
    Marmot Project
    239
    Whatpulse
    83
    Мікс
    AlmereGrid
    24
    Pirates@Home
    9
    Sztaki Desktop Grid
    58
    Yoyo@Home
    37