ua     ru    Sitemap   Sitemap     | Пошук... |       Сайт відкрито 14.12.2005

Ukraine - Distributed Computing Team

 

 » Навігація 
  Новини
  Новини (Архів)
  Описи проектів
  Опитування
  Архіви

  Форум
  Форум (PDA)

 » Статті 


       Описи проектів 
Начало раздела > Life Sciences

Проект розшифровки генома рака (The Cancer Genome Atlas, TGCA)



The Cancer Genome Atlas

Проект розшифровки генома рака (The Cancer Genome Atlas, TGCA)


Автор: Макс Арбалет, переклад: Артем Артьомов (Nadvirna_Dolyna)


Сайт проекту: http://cancergenome.nih.gov/

Проект TGCA (The Cancer Genome Atlas) запущений у грудні 2005 силами Національного інституту раку (National Cancer Institute, NCI) і Національного інституту геномных досліджень (National Human Genome Research Institute, NHGRI), що входять у систему Національних інститутів здоров'я (National Institute of Health) США.

Абревіатура TGCA, окрім назви проекту, відповідає англомовним позначенням азотистих основ (нуклеотидів, послідовність яких складає ДНК людини): T (тимін), G (гуанін), C (цитозін), A (аденін).

Головна мета TGCA - розшифрування і складання систематизованого каталогу послідовностей нуклеотидів ДНК ракових клітин (близько 50 типів). Порівняльний аналіз генів здорових тканин і злоякісних новотворів допоможе виявити характерні генетичні мутації, що визначають розвиток рака, а також розробити нові методи діагностики і лікування онкологічних захворювань.

Проект розраховує залучити для досліджень з бюджету США суму у розмірі $1.35 мільярдів терміном на 9 років. Пілотна фаза проекту, за результатами якої буде прийняте рішення про початок повномасштабних досліджень, розрахована на 3 роки і включає виділення $100 млн. У ході пілотної фази передбачається вивчення декількох типів ракових клітин, що раніше не досліджувалися , а також розробка і тестування відповідних біоінформаційних технологій. Результати проекту будуть розміщатися в публічних базах даних NHGRІ і NCІ.

Деякі фахівці звертають увагу на проблему генетичної неоднорідності ракових клітин: так, дві клітини в одній і тій самій пухлині можуть відрізнятися мутаціями. Для мінімізації цих неточностей пілотний проект буде вивчати відносно однорідні з погляду генетичних варіацій типи рака.

Науковцям давно відомо про канцерогенну природу генетичних мутацій, нагромадження яких може перетворювати звичайні клітини на ракові. У середовищі фахівців навіть з'явився вираз: "Кожен рано чи пізно помре від раку, якщо його не наздожене інша хвороба". Вже відомо біля 300 генів,залучених у розвиток раку. З ліками ж, які впливають на рівні специфічних генетичних аномалій, справа йде значно гірше. Наприклад, Gleevek блокує певну генетичну зміну при особливій формі лейкозу, але викликає ремісію у більшості пацієнтів. Інші ліки - Iressa (їх призначають при раці легенів) ефективні лише у 10 відсотках хворих, тих хто має певну мутацію. Тому, поява подібного проекту повинна значно просунути дослідників у розумінні природи онкологічних захворювань і прискорити розробку ефективних протиракових препаратів.

Підготовлено за матеріалами Эхо Москвы



Результати проекту Cancer Genome Atlas


Вересень 2006

Згідно публікації в Science науковці університетів Джона Гопкінса, Південної Кароліни і Західного резервного району в Клівленді встановили відразу 189 генів, що змінюються при раці молочної залози і колоректальному раку. Відкриття зроблене в рамках проекту по розшифровці генома раку Cancer Genome Atlas.

В ході дослідження генетики визначили послідовність (первинну структуру) близько 13 000 генів, знайдених в 11 пухлинах грудей і 11 пухлинах ободової і прямої кишки. Потім були виявлені відмінності між генами здорових тканин і злоякісних новоутворень, а потім результат перепровірили за допомогою додаткового банку даних по 24 пухлинах молочної залози і колоректального раку.

У результаті було встановлено 189 генних мутацій, спільних для обох видів раку і, ймовірно, що є їх причиною. Більшість з них раніше не асоціювалися із захворюванням. Науковці були здивовані отриманими даними, оскільки не очікували зіткнутися з такою кількістю мутацій.

В той же час робота показала, що рак грудей і рак прямої кишки - два абсолютно різні захворювання, у яких співпадають всього 2 гени. Спостереження відноситься і до всіх решта видів раку. По словах дослідників, у світі не існує двох аналогічних пухлин.

За оцінками генетиків, типова пухлина молочної залози несе мутації більш ніж в 100 генах. Приблизно 20 з них можуть бути залучені в утворення пухлини. Менше половини цих генів, ймовірно, можна виявити в іншій пухлині грудей.

Першоджерело: http://www.gazeta.ru/


Дата: Понеділок, 25 Вересень 2006
Прочитана: 5334 раза

Распечатать Распечатать    Переслать Переслать    В избранное В избранное

Другие публикации
  • Проект "Геном людини" (Human Genome Project)
  • Генетична Революція
  • Опубліковано результати реалістичного моделювання глобального потепління в найближчі два століття.
    Повернутися назад

  •  » Положення команди 
    Медико-біологічні
    Correlizer
    47
    DrugDiscovery@Home
    9
    Fightaids@Home
    40
    Folding@Home
    56
    Gpugrid.net
    50
    Help Cure Muscular Dystrophy
    40
    Help Conquer Cancer
    40
    Help Fight Childhood Cancer
    40
    Human Proteome Folding (Phase 2)
    40
    Lattice Project
    20
    Malariacontrol.net
    47
    NRG@home (Najmanovich Research Group)
    26
    Poem@Home
    32
    Ps3grid.net
    50
    RNA World
    47
    Rosetta@Home
    27
    World Community Grid
    40
    Математика
    Abc@Home
    13
    Collatz Conjecture
    75
    EulerNet
    10
    Gimps (Great Internet Mersenne Prime Search)
    29
    Mersenne@home
    78
    NFS@Home (Number Field Sieve)
    55
    OGR-27
    11
    OPTIMA@HOME
    35
    primaboinca
    44
    Primegrid
    40
    Seventeen Or Bust
    16
    Seventeen Or Bust-Sieve
    17
    WEP-M+2 Project (Wanless)
    40
    Криптографія
    DistrRTgen
    68
    Enigma@Home
    52
    RC5-72
    22
    Фізика
    Einstein@Home
    49
    IBERCIVIS
    1
    Leiden Classical
    61
    Lhc@Home
    33
    Magnetism@Home
    2
    Muon1-DPAD
    31
    Spinhenge@Home
    39
    Хімія
    QMC@Home
    44
    Kосмос
    Constellation@home
    51
    Cosmology@Home
    44
    Milkyway@Home
    48
    Orbit@Home
    27
    SETI@Home
    90
    Планета земля
    Climate Prediction
    43
    La Red de Atrapa Sismos
    7
    Quake Catcher Network
    64
    Radioactive@Home
    12
    Virtual Prairie (ViP)
    24
    Штучний інтелект
    FreeHAL@Home
    24
    Neurona@Home
    21
    Інтернет
    Majestic-12
    4
    Рендеринг
    Burp
    34
    Luxrenderfarm@home
    0
    ORE (Open Rendering Environment)
    40
    Ігрові проекти
    Chess960@Home
    95
    sudoku@vtaiwan
    16
    Клікери і трекери
    Marmot Project
    239
    Whatpulse
    83
    Мікс
    AlmereGrid
    24
    Pirates@Home
    9
    Sztaki Desktop Grid
    58
    Yoyo@Home
    37